| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
AAATAAATGTAATTCTTCCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_40/1471‑1604 | aataaatGTAATTCTTCCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAAtg < 1:37595‑M1/135‑3 (MQ=255) tAATTCTTCCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTTCATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAAggaactgaac < 2:1943002‑M1/135‑11 (MQ=255) aTTCTTCCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAAtgaactgaaccc < 2:2439603‑M1/135‑13 (MQ=255) cttcCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCATAATTATATGTACTGCCCCTCAAtgaactgaaccccaa > 1:3042422‑M1/1‑120 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |