| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | AssemblyC74_contig_48 | 22 = | 0 (0.000) | coding (21/843 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Chitinase (EC 3.2.1.14) | |||||
Only 100 of 562 total aligned reads displayed.
TGTATCTACACTCGTTAAGAAAGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTC > AssemblyC74_contig_43/838‑1105 | tGTATCTACACTCGTTAAGAAAGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATAGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCaa > 2:1014653/1‑135 (MQ=255) aggttgttaaattactacagctatggacgtaagaattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACtt > 2:1529965‑M1/129‑135 (MQ=255) acacTCGTTAAGAAAGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTg > 1:784378/1‑135 (MQ=255) ttgttaaattactacagctatggacgtaagaattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGa < 2:384736‑M1/10‑1 (MQ=255) ttgttaaattactacagctatggacgtaagaattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGa < 2:2175006‑M1/10‑1 (MQ=255) cTCGTTAAGAAAGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGAtt < 1:540880/135‑1 (MQ=255) tCGTTAAGAAAGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGAt > 2:3156003/1‑133 (MQ=255) cGTTAAGAAAGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTc < 1:9513/135‑1 (MQ=255) aaattactacagctatggacgtaagaattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCt < 2:1477687‑M1/15‑1 (MQ=255) aaattactacagctatggacgtaagaattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCt < 1:3134818‑M1/15‑1 (MQ=255) 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1:2303771‑M1/122‑1 (MQ=255) aattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACtt < 1:442461‑M1/124‑1 (MQ=255) agtATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTgg < 1:147914/133‑1 (MQ=255) gtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGa < 1:2063463‑M1/71‑1 (MQ=255) gtATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCt > 1:2878249/1‑57 (MQ=255) gtATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTg > 2:1971930/1‑114 (MQ=255) gtATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACa > 1:2641720/1‑135 (MQ=255) gtATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCGTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACa > 1:2978174/1‑135 (MQ=255) ctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAgg < 2:1630240‑M1/64‑1 (MQ=255) AACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTc < 1:2167903‑M1/135‑1 (MQ=255) AACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTc < 2:3066114‑M1/135‑1 (MQ=255) | TGTATCTACACTCGTTAAGAAAGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTC > AssemblyC74_contig_43/838‑1105 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |