| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_44 | = 1136 | 0 (0.000) | 270 (0.540) | 69/254 | 0.2 | 100% | coding (1/1134 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_48 | = 844 | 0 (0.000) | coding (843/843 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Chitinase (EC 3.2.1.14) | |||||
Only 100 of 600 total aligned reads displayed.
ATTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_44/1002‑1136 | aTTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATc < 2:1151745/135‑1 (MQ=255) gTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtgg < 2:1839083‑M2/134‑4 (MQ=255) gTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtgg < 2:1518754‑M2/134‑4 (MQ=255) gTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtgg < 1:3028728‑M2/134‑4 (MQ=255) tACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttg > 2:2683410‑M2/1‑124 (MQ=255) aTTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtccc < 2:1965823‑M2/135‑16 (MQ=255) aTTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtccc > 1:374868‑M2/1‑120 (MQ=255) tCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccag > 2:1301264‑M2/1‑118 (MQ=255) cATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcaca > 2:576652‑M1/1‑117 (MQ=255) tCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagtttt > 1:2446293‑M1/1‑112 (MQ=255) cGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtt > 2:1773006‑M2/1‑111 (MQ=255) gTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagttt > 2:1095323‑M2/1‑110 (MQ=255) cacaGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagttttt < 1:1675631‑M2/135‑28 (MQ=255) cacaGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagtgttggaa > 2:1001923‑M1/1‑108 (MQ=255) caGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttg < 1:1091936‑M2/134‑29 (MQ=255) caGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaaca > 1:135392‑M1/1‑106 (MQ=255) aTCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccag > 2:2361187‑M2/1‑96 (MQ=255) tCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCt < 1:2380979‑M2/96‑2 (MQ=255) cccAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagat < 1:715146‑M1/135‑42 (MQ=255) cAGTCAAATTTTACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttg < 2:712648‑M1/135‑48 (MQ=255) cAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttg > 2:3426933‑M1/1‑88 (MQ=255) cAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttg > 2:2217615‑M1/1‑88 (MQ=255) cAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttg < 1:2685561‑M1/135‑48 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcgcagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggt < 2:909368‑M2/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggt < 2:3506149‑M2/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtagg > 2:2607350‑M2/1‑83 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta < 2:816640‑M1/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta < 1:475377‑M1/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta > 2:1688704‑M1/1‑83 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta > 2:2048697‑M1/1‑83 (MQ=255) aaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttag > 2:407518‑M1/1‑82 (MQ=255) gTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcc < 2:2534222‑M1/135‑62 (MQ=255) aGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtagg > 2:3409840‑M2/1‑72 (MQ=255) aGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtagg < 1:3409840‑M2/123‑52 (MQ=255) aGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcg > 1:426396‑M1/1‑72 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:3326596‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:2554458‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:2758624‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:1740861‑M2/1‑71 (MQ=255) aaaTTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaac < 1:3426933‑M1/133‑66 (MQ=255) aaTTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccag < 1:576652‑M1/135‑69 (MQ=255) aaTTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccag < 1:2804387‑M1/135‑69 (MQ=255) tactacAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagtta < 2:1245409‑M1/135‑72 (MQ=255) acacCCCATGAACCTATTGCTCATATTCGTGACACTAGACCTGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc < 2:1424551‑M1/135‑76 (MQ=255) acAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc < 2:487977‑M1/135‑76 (MQ=255) acAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc < 2:2324228‑M1/135‑76 (MQ=255) acAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc < 2:2505754‑M1/135‑76 (MQ=255) aaCCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatca > 1:2107231‑M1/1‑58 (MQ=255) tGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatact < 2:3305068‑M1/135‑84 (MQ=255) cATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatacttta > 2:2979873‑M1/1‑48 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaaca < 2:969022‑M2/135‑94 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaaca < 1:1853953‑M2/135‑94 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaaca < 1:2047809‑M2/135‑94 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgtt > 1:2298446‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaa > 1:3184072‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc > 1:1898634‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc > 1:693805‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaata > 2:839505‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaata < 1:839505‑M1/55‑14 (MQ=255) tCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatacttta > 2:2262327‑M1/1‑40 (MQ=255) atatTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAACTCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaattt > 2:1591406‑M2/1‑38 (MQ=255) atatTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaattt > 2:1368107‑M2/1‑38 (MQ=255) tCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaa > 1:2501987‑M2/1‑34 (MQ=255) tCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatcct > 1:903554‑M1/1‑34 (MQ=255) gTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaac > 1:798675‑M2/1‑32 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatac < 1:1982647‑M2/135‑108 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttc > 2:2812314‑M2/1‑28 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaaca > 2:1997654‑M1/1‑28 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaaca > 1:2872257‑M1/1‑28 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaaca > 2:2147864‑M1/1‑28 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaaca > 1:2949586‑M1/1‑28 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaaca > 2:3094492‑M1/1‑28 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatact > 2:2098122‑M1/1‑28 (MQ=255) acTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatac > 1:148199‑M2/1‑27 (MQ=255) aGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatc > 2:1722429‑M2/1‑24 (MQ=255) aTGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatg < 1:1172242‑M2/135‑116 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 1:2250001‑M2/135‑121 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 1:1386567‑M2/135‑121 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 1:1014561‑M2/135‑121 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 1:1562723‑M2/135‑121 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 2:2904024‑M2/135‑121 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgtt > 2:754485‑M2/1‑15 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccaggga > 2:3029173‑M1/1‑15 (MQ=255) caccgacttacagCtggagctgttgtcccagtatagttattgaacattccagcaaacgaagtaggtagcttccaattgcttacaactagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtc > 2:2753491‑M2/6‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 1:1810962‑M2/134‑121 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 2:637174‑M2/134‑121 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 1:2909769‑M2/134‑121 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaa > 1:3513200‑M2/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttg > 1:542880‑M2/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttg < 2:542880‑M2/112‑99 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 2:3169447‑M2/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttc < 2:3542346‑M2/72‑59 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 2:1336660‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 1:2648670‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaacc < 1:973462‑M1/80‑67 (MQ=255) actactTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtcac > 2:296027‑M2/1‑12 (MQ=255) actTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtcacaca > 1:2174099‑M2/1‑9 (MQ=255) actTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtcacaca > 2:2441422‑M2/1‑9 (MQ=255) aaaTCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacacactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaatttggtaat > 1:3292245‑M1/1‑5 (MQ=255) tCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtcac > 1:3126473‑M2/1‑2 (MQ=255) | ATTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_44/1002‑1136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |