| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_47 | 730 = | NA (NA) | 212 (0.460) | 64/254 | 0.5 | 100% | coding (729/879 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_61 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+2) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 502 total aligned reads displayed.
TTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGA > AssemblyC74_contig_47/596‑863 | aGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCaaaa > 2:2010694/1‑135 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCaaaa < 1:2869394/134‑1 (MQ=255) gtaagtaaTTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATtgt < 2:1436127/135‑1 (MQ=255) agtaaTTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGc < 1:2159690/135‑1 (MQ=255) gtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaagttacttaaatgaatgcTTTGTTGCAAAATTGTgg < 1:2693441‑M1/18‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAAtt > 1:1947741‑M1/114‑127 (MQ=255) aattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAAtt < 2:1947741‑M1/14‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGctct < 1:1385255‑M1/22‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGctct < 2:362793‑M1/22‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGctct < 1:2304758‑M1/22‑1 (MQ=255) aaTTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGctct > 2:1132208/1‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCttt > 1:2414997‑M1/112‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCttt > 2:334103‑M1/112‑135 (MQ=255) ttGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCttt < 2:3112432/135‑1 (MQ=255) ttGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCttt < 1:889805/135‑1 (MQ=255) ggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCttt < 2:3174260‑M1/24‑1 (MQ=255) ggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCttt > 2:1170485‑M1/109‑132 (MQ=255) ggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAAc < 1:1702528‑M1/27‑1 (MQ=255) gAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCttt > 2:1285192/1‑132 (MQ=255) atacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAAtt > 1:1157896‑M1/107‑120 (MQ=255) aTACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACg < 1:2572929/134‑1 (MQ=255) tACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGa < 1:1206446/134‑1 (MQ=255) tACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGa < 1:1871382/134‑1 (MQ=255) tCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTa < 1:2532266/135‑1 (MQ=255) cAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACGATTATGAGTGATATGTTGAAAACATGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGa > 2:579893/1‑135 (MQ=25) cAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGa > 1:2665115/1‑135 (MQ=255) aatgttacgactaagacttctatcttttatcgctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattcTCTGTTACAAATTTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGAt > 1:739797‑M1/99‑135 (MQ=255) atgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgactgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTatcgagtgtcgaag < 2:2482453‑M1/38‑6 (MQ=255) gttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgta < 1:4808‑M1/40‑1 (MQ=255) ttACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgtaa > 1:559472/1‑135 (MQ=255) aatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTGCAAAATTGTGTATCTTTAACGAGTGTCTATGTAAGTAAt < 2:1526196‑M1/46‑1 (MQ=255) aatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAgt > 1:921200‑M1/90‑120 (MQ=255) aatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAgt < 2:921200‑M1/31‑1 (MQ=255) aatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAt < 2:1308782‑M1/46‑1 (MQ=255) atatGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGTGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAtt > 2:441463/1‑135 (MQ=255) tatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg > 1:784565‑M1/88‑135 (MQ=255) tatGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg < 1:3070570/135‑1 (MQ=255) gggCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACg < 2:285504/135‑1 (MQ=255) tgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGa > 2:861182‑M1/77‑135 (MQ=255) tGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTTGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGa > 2:1910101/1‑135 (MQ=255) gTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGa < 2:2061561/134‑1 (MQ=255) ttttGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAg < 1:441463/135‑1 (MQ=255) ggggAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGt > 2:2667050/1‑133 (MQ=255) tggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGa > 1:1289068‑M1/70‑98 (MQ=255) ggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAc < 1:2334231‑M1/66‑1 (MQ=255) ctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTc < 1:1254721‑M1/69‑1 (MQ=255) aaaTACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAg > 1:2997411/1‑127 (MQ=255) aaTACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGTATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTc < 1:1637725/134‑1 (MQ=255) aaTACGTGTTGAGAGAGTGTAGCTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCACTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTc < 1:1458357/134‑1 (MQ=255) cGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCtt < 2:1234501/84‑1 (MQ=255) ctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGGAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATgaa < 2:1050910‑M1/75‑2 (MQ=255) tttAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGc < 1:3382522/135‑1 (MQ=255) cgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCttt > 1:70196‑M1/53‑76 (MQ=255) cgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCttt < 2:70196‑M1/24‑1 (MQ=255) agtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGttt > 2:230727‑M1/51‑135 (MQ=255) tgtAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGttt < 1:2078409/133‑1 (MQ=255) agatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctattaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAgg < 1:3529860‑M1/90‑1 (MQ=255) aGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACg > 1:1002370/1‑100 (MQ=40) aGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACg < 2:1002370/100‑1 (MQ=40) aGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGttt > 2:1844218/1‑130 (MQ=255) gatgtaagtaattgggatacgtcgaatgttacttctatgaatgcTGTGTTACAATATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAggg > 1:1526196‑M1/45‑135 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAggg < 1:2748048/135‑1 (MQ=255) gtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGt < 1:1751612/100‑1 (MQ=40) gtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAggg < 2:2528200/128‑1 (MQ=255) gtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTaa > 2:3477570/1‑133 (MQ=255) gtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTaa > 2:3399932/1‑133 (MQ=255) aattgggatacgtctaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAggg > 2:2750373‑M1/36‑126 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCttt > 1:1115550‑M1/36‑59 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATgaa < 2:2390982‑M1/75‑2 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt < 2:527634‑M1/100‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt < 2:1383092‑M1/100‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt < 1:3150195‑M1/100‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt < 1:2367941‑M1/100‑1 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTa < 1:277052/106‑1 (MQ=40) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGttt > 1:376792/1‑120 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCTGGGGTTAAATCt > 1:2831896/1‑135 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAggg > 1:3450105/1‑126 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt > 2:1606520/1‑135 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt > 2:2794586/1‑135 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt > 2:673473/1‑135 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt > 2:3048579/1‑135 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt > 2:3254722/1‑135 (MQ=255) attgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATc > 1:2482453‑M1/35‑133 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATc < 1:2010694/133‑1 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATc < 1:1320339/133‑1 (MQ=255) ggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATc > 2:746405‑M1/31‑129 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGa > 2:3426327/1‑89 (MQ=255) cgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCg < 2:2104327‑M1/110‑1 (MQ=255) gtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGa > 2:1702528‑M1/25‑135 (MQ=255) tcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGAt > 1:3329663‑M1/24‑135 (MQ=255) tcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGAt < 1:3242932‑M1/112‑1 (MQ=255) gaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATgt < 2:2981432‑M1/114‑1 (MQ=255) ttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg > 2:2627505‑M1/13‑135 (MQ=255) aTTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAggg > 1:2268142/1‑102 (MQ=255) aTTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAggg < 2:2268142/102‑1 (MQ=255) aTTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTgg < 2:1791084/135‑1 (MQ=39) aGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACg < 1:1446926/135‑1 (MQ=37) aGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACg < 2:2147664/135‑1 (MQ=37) gTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGt > 2:145893/1‑135 (MQ=35) atatGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTc < 1:1812491/133‑1 (MQ=34) | TTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGA > AssemblyC74_contig_47/596‑863 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |