| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_47 | = 882 | NA (NA) | 133 (0.510) | 45/254 | 1.8 | 42.8% | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
| ? | AssemblyC74_contig_60 | 100 = | 178 (0.780) | coding (99/438 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | FIG00630508: hypothetical protein | |||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_47/748‑882 | ctctTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGa > 1:516768/1‑135 (MQ=255) aaCGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgtt < 1:1641877‑M1/135‑7 (MQ=255) aCGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttt < 1:2794586‑M1/135‑8 (MQ=255) cGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgtttt > 1:3372156‑M1/1‑127 (MQ=255) aGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctg > 1:47206‑M1/1‑120 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgt < 2:2391579‑M1/135‑17 (MQ=255) ttaagtaatTTGGATAAGTAGAAGGTTACTTCTATGCCTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggc < 2:3383252‑M1/134‑20 (MQ=255) gttagtatttgGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggc < 2:3434503‑M1/132‑20 (MQ=255) gtaagtaaTTGGGATACGTCGAATGTTAATTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGTGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTAGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggc < 2:1910336‑M1/135‑20 (MQ=255) taagtaaTTGGGGTACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtgg > 1:437938‑M1/1‑115 (MQ=255) agtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctct < 1:1194531‑M1/135‑23 (MQ=255) taaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:3092501‑M1/1‑111 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAATTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:95545‑M1/1‑110 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:2937084‑M1/1‑110 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:1716041‑M1/1‑110 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 1:2451067‑M1/1‑110 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 1:2208398‑M1/1‑110 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:555284‑M1/1‑110 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 1:826401‑M1/1‑110 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 1:1460042‑M1/1‑110 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 1:98587‑M1/1‑110 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGAAGCGGTTAAATCTAAAAATATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:1030951‑M1/1‑110 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGATACTTCTATGACTGCTATGTTAGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAAATGTGATACGTCGAAGGTTACTAATAATACTGAtatgatatatggctgtggctcatta > 2:3342012‑M1/1‑110 (MQ=255) tttgGGATTCGTCGAAGGTTACTACTATGTCTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:1314047‑M1/132‑25 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:3456786‑M1/133‑25 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:2835658‑M1/133‑25 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:633993‑M1/133‑25 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:673473‑M1/133‑25 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:787255‑M1/133‑25 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:2262630‑M1/133‑25 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:2342786‑M1/133‑25 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:1022944‑M1/133‑25 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:1606520‑M1/133‑25 (MQ=255) aTTGGGAGACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:2790354‑M1/133‑25 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaac > 1:3133633‑M1/1‑108 (MQ=255) gggATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacga < 2:2911309‑M1/135‑30 (MQ=255) gggATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacga < 2:2242946‑M1/135‑30 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGATGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacga < 2:2701044‑M1/134‑30 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgag > 1:942923‑M1/1‑105 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacga > 1:2701044‑M1/1‑105 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGAATGAtatgttttatggctgtggctctttaacgag > 1:1910336‑M1/1‑105 (MQ=255) tcgTCGAAGGTTACTTCTTTGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTTTCGTTGTAAGTAATTGGGATACTTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgta < 1:332284‑M1/134‑35 (MQ=255) aCGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgta < 2:559472‑M1/135‑35 (MQ=255) gTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaga < 2:1716802‑M1/135‑37 (MQ=255) gTCGAAGGTTACTTCTATGACTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaga < 1:2064694‑M1/135‑37 (MQ=255) gAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgt > 1:3241036‑M1/1‑96 (MQ=255) gAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatg < 2:1217926‑M1/134‑39 (MQ=255) aGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaa > 1:3515773‑M1/1‑94 (MQ=255) aGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaa > 1:1608110‑M1/1‑94 (MQ=255) ggTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaag < 1:2729886‑M1/135‑43 (MQ=255) gTTACGACTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGCAGGTTACTTATAGGACTGAtatgttatagggcggtggctctttaacgagtgtagatgtaag > 2:3323926‑M1/1‑92 (MQ=255) ttACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagta > 1:1354225‑M1/1‑91 (MQ=255) ttACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagta > 2:1295566‑M1/1‑91 (MQ=255) tACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagt < 1:1036609‑M1/133‑44 (MQ=255) ttCTATGACTGCTATGTTTGCAGGTGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattg < 1:1655853‑M1/135‑49 (MQ=255) ttCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattg < 1:250951‑M1/135‑49 (MQ=255) ttCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattg < 2:437938‑M1/135‑49 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgg > 2:2457198‑M1/1‑86 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgg > 2:2690431‑M1/1‑86 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgg > 1:1428208‑M1/1‑86 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgg > 1:2140346‑M1/1‑86 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:3423414‑M1/110‑25 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 1:41259‑M1/1‑86 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:41259‑M1/110‑25 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 1:3423414‑M1/1‑86 (MQ=255) cTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattggg > 1:993870‑M1/1‑85 (MQ=255) cTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattggg > 2:1723010‑M1/1‑85 (MQ=255) tGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggata < 1:2504033‑M1/135‑54 (MQ=255) cTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtcattgggatacgt > 1:2071378‑M1/1‑79 (MQ=255) cTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt > 2:728436‑M1/1‑79 (MQ=255) cTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt > 1:2208427‑M1/1‑79 (MQ=255) cTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt > 2:2200385‑M1/1‑79 (MQ=255) cTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt > 2:1151730‑M1/1‑79 (MQ=255) cTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt > 1:3035232‑M1/1‑79 (MQ=255) tGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtc < 1:687650‑M1/135‑58 (MQ=255) tGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt < 2:1563314‑M1/134‑57 (MQ=255) tATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaa > 2:2441312‑M1/1‑75 (MQ=255) aTGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCTATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggcggtggctctttaacgtgtgtagatgtaagtaattgggatacgtaaaat > 2:990098‑M1/1‑74 (MQ=255) aTGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtccaat > 2:2069817‑M1/1‑74 (MQ=255) aTGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaat < 1:3048579‑M1/135‑62 (MQ=255) aTGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaat > 2:470307‑M1/1‑74 (MQ=255) aTGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaat < 1:1659626‑M1/135‑62 (MQ=255) gTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgt > 2:2197888‑M1/1‑72 (MQ=255) tttGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgt > 1:599123‑M1/1‑71 (MQ=255) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatgtctgtggctctttaacgagtgtagatgtaataaattgttataattagaatgttacgaat > 2:2010791‑M1/1‑65 (MQ=255) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaa < 1:3477559‑M1/134‑70 (MQ=255) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaa < 1:1718715‑M1/134‑70 (MQ=255) ggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaa > 2:1923436‑M1/1‑63 (MQ=255) ggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaa < 1:1923436‑M1/132‑70 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaa > 2:2426452‑M1/1‑49 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:2375917‑M1/1‑49 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:2375917‑M1/73‑25 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaat > 1:1503534‑M1/1‑43 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaat < 2:1503534‑M1/104‑62 (MQ=255) aagtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:3212907‑M1/63‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacga > 2:1338450‑M1/1‑35 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:3392541‑M1/59‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 1:3392541‑M1/1‑35 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAATGTTACTTATATGAATGTtatgttttttggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacagatatggagactatgttccaaggttgtgtctcttt < 2:1609370‑M1/135‑103 (MQ=255) cGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagt > 2:2151448‑M1/1‑25 (MQ=255) | CTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_47/748‑882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |