| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_15 | 1 = | 0 (0.000) | 279 (0.690) | 71/254 | 0.6 | 100% | intergenic (–/+1116) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_52 | = 702 | 0 (0.000) | intergenic (+23/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Putative transposase InsK for insertion sequence element IS150/– | |||||
Only 100 of 546 total aligned reads displayed.
ATATTTCAAAGTAAATTAAATGAGTATATTAGGTGGTATAATAACAAAAGGATAAAACTAAAGTTAAATGGACTATCTCCAGTAGAATATCGGAAACAGTCCATTAAATAGTTCAACTTTTGGGGTTCAGTTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_52/569‑702 | atatTTCAAAGTAAATTAAATGAGTATATTAGGTGGTATAATAACAAAAGGATAAAACTAAAGTTAAATGGACTATCTCCAGTAGAATATCGGAAACAGTCCATTAAATAGTTCAACTTTTGGGgttcagttca < 2:1091450/134‑1 (MQ=255)atatTTCAAAGTAAATTAAATGAGTATATTAGGTGGTATAATAACAAAAGGATAAAACTAAAGTTAAATGGACTATCTCCAGTAGAATATCGGAAACAGTCCATTAAATAGTTCAACTTTTGGGgttcagttca < 2:2421146/134‑1 (MQ=255) atTTCAAAGTAAATTAAATGAGTATATTAGGTGGTATAATAACAAAAGGATAAAACTAAAGTTAAATGGACTATCTCCAGTAGAATATCGGAAACAGTCCATTAAATAGTTCAACTTTTGGGGTTCAGTTCAaa > 2:3364098‑M2/1‑132 (MQ=255) tttCAAAGTAAATTAAATGAGTATATTAGGTGGTATAATAACAAAAGGATAAAACTAAAGTTAAATGGACTATCTCCAGTAGAATATCGGAAACAGTCCATTAAATAGTTCAACTTTTGGGGTTCAGTTCAttga < 2:3042400‑M2/135‑5 (MQ=255) 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ATATTTCAAAGTAAATTAAATGAGTATATTAGGTGGTATAATAACAAAAGGATAAAACTAAAGTTAAATGGACTATCTCCAGTAGAATATCGGAAACAGTCCATTAAATAGTTCAACTTTTGGGGTTCAGTTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_52/569‑702 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |