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Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
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cATATTCATCAActtcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagt > 1:571289‑M2/1‑12 (MQ=255) cAGATTCATCAActtcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagtg > 1:3486674‑M2/1‑12 (MQ=255) cAGATTCATCAActtcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagt > 2:3103448‑M2/1‑12 (MQ=255) aTTCTTCAActtcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagtgaca > 1:1114956‑M2/1‑9 (MQ=255) aTTCATCAActtcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagtgaca > 1:2264618‑M2/1‑9 (MQ=255) ttCATCAActtcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagtgacag > 2:1957373‑M2/1‑8 (MQ=255) tcatcaActtcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagtgacag < 2:656562‑M2/134‑128 (MQ=255) tcatcaActtcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacaatacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagtgacag > 1:1253448‑M2/1‑7 (MQ=255) tcatcaActtcaagcgacagtacagatactacctctaccacaa > 1:257957‑M2/1‑7 (MQ=255) tcataaActtcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagtgaca > 1:365540‑M2/1‑7 (MQ=255) aacttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggacacatcagcttcaagtgacagtacaga > 2:3315015‑M2/1‑2 (MQ=255) acttcaagcgacagtacagatactacctctaccacaagtgatagcacggatacatcagcttcaagt < 2:2580268‑M2/66‑66 (MQ=255) | AATGTGATTTTAGATGCAGCTACCAATCGTTGGGATCCTAACGAAATATTTATCAGCGACAATGGTACAGATACGACAGACACAAGCGACAGTACAGATACATCTACCACAAGTGATAGCTCAGATTCATCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_7/152640‑152772 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |