| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
CTTAATGCTATAAATTCATAATAACATTATGGACAATAAATTTAAAATTTATTCAGACTGTAGACAAACTCCTAAATTTAGAGTGTTGTTTGCAGTCTGACGACTCAAAAATGAGTCGTATAAATCAATTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_46/752‑883 | cTTAATGCTATAAATTCATAATAACATTATGGACAATAAATTTAAAATTTATTCAGACTGTAGACAAACTCCTAAATTTAGAGTGTTGTTTGCAGTCTGACGACTCAAAAATGAGTCGTATAAATCAATTATagt > 1:1031992‑M2/1‑132 (MQ=255)cTTAATGCTATAAATTCATAATAACATTATGGACAATAAATTTAAAATTTATTCAGACTGTAGACAAACTCCTAAATTTAGAGTGTTGTTTGCAGTCTGACGACTCAAAAATGAGTCGTATAAATCAATTATagt > 1:1536370‑M2/1‑132 (MQ=255)cTTAATGCTATAAATTCATAATAACATTATGGACAATAAATTTAAAATTTATTCAGACTGTAGACAAACTCCTAAATTTAGAGTGTTGTTTGCAGTCTGACGACTCAAAAATGAGTCGTATAAATCAATTATagt < 2:355457‑M2/135‑4 (MQ=255)cTTAATGCTATAAATTCATAATAACATTATGGACAATAAATTTAAAATTTATTCAGACTGTAGACAAACTCCTAAATTTAGAGTGTTGTTTGCAGTCTGACGACTCAAAAATGAGTCGTATAAATCAATTATagt < 1:1757897‑M2/135‑4 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aaaTCAATTATagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaatagcctttcgttcaactaaccatg < 2:1637877‑M2/135‑125 (MQ=255) aTCAATTATagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaatagcctttcgttcaactaaccatttt < 1:1322612‑M2/135‑127 (MQ=255) aaTTATagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaatagcctttcgttcaactaaccattttttt < 2:2884355‑M2/135‑130 (MQ=255) tagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcttgaatagcctttcgttcaactaaccatttttttaggtt < 2:1148045‑M2/135‑135 (MQ=255) tagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaatagcctttcgttcaactaaccatttttttaggtt < 2:1106700‑M2/135‑135 (MQ=255) tagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaatagcctttcgttcaactaaccatttttttaggtt < 1:1730212‑M2/135‑135 (MQ=255) tagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaatagcctttcgttcaactaaccatttttttaggtt < 2:2013972‑M2/135‑135 (MQ=255) tagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaatagcctttcgttcaactaaccatttttttaggtt < 1:385803‑M2/135‑135 (MQ=255) tagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaatagcctttcgttcaactaaccatttttttaggtt < 2:21726‑M2/135‑135 (MQ=255) tagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaata > 2:2874‑M2/1‑1 (MQ=255) tagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttc < 2:3266273‑M2/60‑60 (MQ=255) tagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttc > 1:3266273‑M2/1‑1 (MQ=255) | CTTAATGCTATAAATTCATAATAACATTATGGACAATAAATTTAAAATTTATTCAGACTGTAGACAAACTCCTAAATTTAGAGTGTTGTTTGCAGTCTGACGACTCAAAAATGAGTCGTATAAATCAATTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_46/752‑883 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |