| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_45 | = 1002 | 0 (0.000) | 322 (0.360) | 82/254 | 0.1 | 100% | intergenic (‑96/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Integrase, catalytic region/– |
| ? | AssemblyC74_contig_55 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTTTTTCTTTTT > AssemblyC74_contig_55/1‑134 | caagctagtttggtgtaagatgtgtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAata < 2:940145‑M2/5‑1 (MQ=255) agctcgtttggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAAtata > 2:3462523‑M2/129‑135 (MQ=255) cttttgttgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATaaaaa < 2:2581139‑M2/11‑1 (MQ=255) cgtttggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATaaaaa > 1:358017‑M2/125‑135 (MQ=255) cgtttggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATaaaaa < 1:2630581‑M2/11‑1 (MQ=255) gtttggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaatcggcgTAATATaaaaaa > 2:2696204‑M2/124‑135 (MQ=255) tggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTa > 2:1080543‑M2/121‑135 (MQ=255) ggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTa > 2:471058‑M2/120‑134 (MQ=255) ggtgtaagatgggtataagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTa > 2:1421831‑M2/120‑134 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacactttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTa > 2:1400916‑M2/105‑135 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTATGCAAATAATAGACTa > 2:2101816‑M2/105‑135 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTa > 1:2934048‑M2/105‑135 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTa > 2:408698‑M2/105‑135 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTa > 1:1990487‑M2/105‑135 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTa > 1:191253‑M2/105‑135 (MQ=255) taagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTa > 2:707367‑M2/105‑135 (MQ=255) aagtcatttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTaa < 2:2110385‑M2/32‑1 (MQ=255) atttatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAAt > 1:2256866‑M2/99‑135 (MQ=255) tatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAAc > 1:221198‑M2/96‑135 (MQ=255) tatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAAc > 1:1709175‑M2/96‑135 (MQ=255) tatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAAc > 2:2170067‑M2/96‑135 (MQ=255) tatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAAc > 2:2008094‑M2/96‑135 (MQ=255) tatgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgctaaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGAAAATAATAGACTAAAAAATAAc > 1:3153966‑M2/96‑135 (MQ=255) atgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTaaaa < 1:2008470‑M2/34‑1 (MQ=255) atgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACt > 2:2405498‑M2/95‑135 (MQ=255) atgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACt > 2:1898640‑M2/95‑135 (MQ=255) atgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACt > 1:3241973‑M2/95‑135 (MQ=255) atgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAAGATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTCAAAAATAACt > 1:1402875‑M2/95‑135 (MQ=255) tgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTa > 1:3083338‑M2/94‑135 (MQ=255) tgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTa > 1:2844324‑M2/94‑135 (MQ=255) tgttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTa > 2:3129752‑M2/94‑135 (MQ=255) gttcactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTAt < 1:3312500‑M2/43‑1 (MQ=255) cactctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAGATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTAtgt < 2:1381659‑M2/45‑1 (MQ=255) actctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTACTATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTga > 2:226770‑M2/89‑135 (MQ=255) tctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTgaga > 2:1753064‑M2/87‑135 (MQ=255) tctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTgaga > 2:2598877‑M2/87‑135 (MQ=255) ctccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGat > 1:910932‑M2/86‑135 (MQ=255) ccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAGTAGACTAAAAAATAACTATGTGAGataa > 2:1257836‑M2/84‑135 (MQ=255) ccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGataa > 1:3028043‑M2/84‑135 (MQ=255) ccttgtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGataa > 1:1216986‑M2/84‑135 (MQ=255) gtatgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATaaa > 2:823929‑M2/80‑135 (MQ=255) tgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTAt < 2:663230‑M2/43‑1 (MQ=255) tgctttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTAt > 1:663230‑M2/77‑119 (MQ=255) tttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGa > 1:596491‑M2/74‑135 (MQ=255) ttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGa < 1:1040791‑M2/62‑1 (MQ=255) ttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGa < 1:2980195‑M2/62‑1 (MQ=255) ttagcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGa < 1:2170067‑M2/62‑1 (MQ=255) gcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAAt > 1:2139126‑M2/70‑82 (MQ=255) gcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTa < 1:1830765‑M2/15‑1 (MQ=255) gcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGaaaaa > 1:753012‑M2/70‑135 (MQ=255) gcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGaaaaa > 1:1154011‑M2/70‑135 (MQ=255) gcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGaaaaa < 1:2324945‑M2/66‑1 (MQ=255) gcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGaaaaa < 2:1223504‑M2/66‑1 (MQ=255) gcgggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGAAAATAATATACTAAAAAATAACTATGTTAGATAATAAACATATaaaaa > 2:3535701‑M2/70‑135 (MQ=255) gggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGaaaaa > 2:2764305‑M2/68‑133 (MQ=255) ggtattacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGaaaaaa < 2:262035‑M2/67‑1 (MQ=255) ttacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTc < 2:1616385‑M2/72‑1 (MQ=255) ttacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCa < 2:2844324‑M2/73‑1 (MQ=255) ttacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCa < 1:565363‑M2/73‑1 (MQ=255) ttacaatttgagtgtaacataaatggattttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCa < 2:528370‑M2/73‑1 (MQ=255) tacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAg > 2:96234‑M2/62‑135 (MQ=255) tacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAg < 2:2325894‑M2/74‑1 (MQ=255) tacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAg > 2:644468‑M2/62‑135 (MQ=255) tacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAg < 1:1257815‑M2/74‑1 (MQ=255) tacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAg < 1:420714‑M2/74‑1 (MQ=255) tacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAg < 1:2358897‑M2/74‑1 (MQ=255) tacaatttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAg < 1:156337‑M2/74‑1 (MQ=255) tttgagtgtaacataaatgtattttttatttgtctctcttaattatacaaacggagTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACt < 2:49015‑M2/79‑1 (MQ=255) tttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACt < 2:3324292‑M2/79‑1 (MQ=255) tttgagtgtaacataaatggattttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATATACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATAc > 1:2761174‑M2/57‑134 (MQ=255) ttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTc < 1:707367‑M2/80‑1 (MQ=255) ttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTc < 2:3028043‑M2/80‑1 (MQ=255) ttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTc < 1:2598877‑M2/80‑1 (MQ=255) ttgagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgattaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTc < 2:1130097‑M2/80‑1 (MQ=255) ttgagtgtaacataaatggcttttttattggtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTc < 2:279646‑M2/80‑1 (MQ=255) gagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATaaaaa > 2:1739571‑M2/54‑64 (MQ=255) gagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTaaaaaa < 2:791128‑M2/36‑1 (MQ=255) gagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTc < 1:429464‑M2/80‑1 (MQ=255) gagtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTc > 2:429464‑M2/54‑133 (MQ=255) agtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGAtaataa < 2:295347‑M2/55‑1 (MQ=255) gtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTc < 2:2437473‑M2/80‑1 (MQ=255) gtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTc > 1:2437473‑M2/52‑131 (MQ=255) gtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCt > 1:2920656‑M2/52‑134 (MQ=255) gtgtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCt > 2:3192723‑M2/52‑134 (MQ=255) gtaacataaatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTc < 1:79220‑M2/80‑1 (MQ=255) aatggcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGt < 2:1174487‑M2/94‑1 (MQ=255) gcttttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCtt > 2:2906857‑M2/38‑134 (MQ=255) ttttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTcccc < 1:1080543‑M2/102‑1 (MQ=255) tttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCa > 2:1822075‑M2/33‑135 (MQ=255) ttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCaa > 2:857661‑M2/32‑135 (MQ=255) ttatttgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCaa > 2:2230101‑M2/32‑135 (MQ=255) tgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGa < 1:476672‑M2/109‑1 (MQ=255) tgtctcgcttaattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGa < 1:495072‑M2/109‑1 (MQ=255) taattatacaaacggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATc < 2:1036513‑M2/117‑1 (MQ=255) acaagcggcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGctt < 1:254251‑M2/125‑1 (MQ=255) gcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGctttttcttt > 2:3497097‑M2/4‑135 (MQ=255) gcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGctttttcttt > 2:3081030‑M2/4‑135 (MQ=255) gcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGctttttcttt < 1:857661‑M2/132‑1 (MQ=255) gcgTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGctttttcttt > 1:1503322‑M2/4‑135 (MQ=255) gTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGctttttcttttt > 2:3251785‑M2/2‑135 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTTTTTCTTTTT > AssemblyC74_contig_55/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |