| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AssemblyC74_contig_52 | 1 = | 0 (0.000) | 243 (0.500) | 71/254 | 0.9 | 100% | intergenic (–/‑1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Putative transposase InsK for insertion sequence element IS150 |
| ? | AssemblyC74_contig_53 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+2) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Mobile element protein | |||||
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTCAATTTAAAT > AssemblyC74_contig_53/1‑135 | aagatttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttc > 2:2457352‑M2/135‑135 (MQ=255) agatttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCt < 1:1143428‑M2/2‑1 (MQ=255) agatttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCt < 2:3473477‑M2/2‑1 (MQ=255) gatttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCtt > 1:2162473‑M2/133‑135 (MQ=255) 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ataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGAtt > 2:3227812‑M2/11‑135 (MQ=255) taagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTCATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTc > 2:2418252‑M2/10‑135 (MQ=255) attccatttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTc > 1:3234672‑M2/10‑135 (MQ=255) agagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTCaa > 1:424575‑M2/8‑135 (MQ=255) agtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGc > 2:2929779‑M2/6‑103 (MQ=255) agtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTCAAtt > 1:952238‑M2/6‑135 (MQ=255) 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTCAATTTAAAT > AssemblyC74_contig_53/1‑135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |