| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_45 | = 1002 | 0 (0.000) | 259 (0.360) | 83/258 | 0.0 | 100% | intergenic (‑96/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Integrase, catalytic region/– |
| ? | AssemblyC74_contig_55 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
ATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_45/869‑1002‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTTTTTCTTTTT > AssemblyC74_contig_55/1‑134 ATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGT > 2:681380/1‑135 AGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATA > 2:1770430/1‑135 CGTTTGGTGTAAGATGTGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTTTTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAA < 1:659191/135‑1 CGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAA < 1:1455386/135‑1 CGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAA < 2:1595595/135‑1 GTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAA > 1:1864794/1‑135 GGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTA > 1:2027618/1‑134 GGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTA > 1:305378/1‑134 AGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGTCGTAATATAAAAAATTAAGCAAAT > 1:278419/1‑135 GATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATA < 2:1633845/135‑1 TGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAAT > 1:630709/1‑135 TATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGA < 1:2171168/134‑1 TAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTA > 2:1387545/1‑135 TAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTA > 1:1477161/1‑135 TAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTA > 1:1903615/1‑135 TAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTA > 2:541658/1‑135 TAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTA > 1:2189711/1‑135 TAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTA > 1:1854382/1‑135 TAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACT < 2:305378/134‑1 TAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAAGTATACAAACGGAGTAATATAATAAATTAAGCAAATAATAGACTA > 2:961376/1‑135 AGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAA > 1:1630650/1‑135 GTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAA < 2:349831/135‑1 CATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAA > 1:1564075/1‑135 ATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAATCGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAACAT > 1:1099867/1‑135 ATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAAT > 2:2242722/1‑135 ATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAA < 2:210518/134‑1 TATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAAC > 2:1067824/1‑135 ATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACT > 1:1966164/1‑135 ATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATGTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAAAAGACTAAAAAATAACT > 1:2455069/1‑135 TGTTCACTCTCGTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTATGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTA > 2:1134503/1‑135 TGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTA > 2:1924905/1‑135 CACTCTCATTTTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAATTTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGT < 2:708798/134‑1 ACTCTCCTGGTATGCTGTAGCGGGTAGTACAAGTTGAGGGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAAAGGCGTAATATAAAAAAGTGAGCAATAAATAGAATAAAAAATAAATATTTGA > 1:468580/1‑135 CTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGAT > 1:1450521/1‑135 GTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAA > 2:857654/1‑135 TTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGA > 1:2417081/1‑135 TTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGA > 1:231729/1‑135 TTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGA < 1:1166764/134‑1 TAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATATAAA > 2:1887958/1‑135 TAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAA > 2:2503288/1‑135 TAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAA > 2:1191123/1‑135 TAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAA > 1:583968/1‑135 GCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATCAAAAAAGAAAAA > 2:1291500/1‑135 GCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAA > 1:440691/1‑135 GCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAA > 2:766917/1‑135 GCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAA > 2:1787472/1‑135 GCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAA > 2:2533189/1‑135 GCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGAT > 2:2053005/1‑119 GCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGAT < 1:2053005/119‑1 GGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAA > 2:2451386/1‑133 GGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGC > 1:1885147/1‑135 ATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAA > 2:1856745/1‑99 TTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTC < 1:1355961/134‑1 TTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTC < 1:1291500/134‑1 TTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTC < 1:2503288/134‑1 TTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTC < 2:906815/134‑1 TTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTC < 1:1821198/134‑1 TTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGAGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCA < 1:1707108/135‑1 TACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAG > 1:879564/1‑135 TACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAG < 1:541658/135‑1 TACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAG > 1:48050/1‑135 TACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAG > 1:2106963/1‑135 TACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAG < 1:1387545/135‑1 TTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACT < 2:2027618/135‑1 TTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACT < 1:103150/135‑1 TTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCTCTTAATTATACAAACGGCTTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATATACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTC < 1:1678595/135‑1 TTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATACACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTC < 2:1747644/135‑1 TTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTC < 2:590074/135‑1 TTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTC < 1:1189800/135‑1 TTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTC < 2:521761/135‑1 TTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTC < 1:1577296/135‑1 TTGAGTGTAACATAAATGGCTTTATTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTC < 1:500495/135‑1 GTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTC > 1:978649/1‑131 TGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTC < 1:1770430/134‑1 GTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTAGGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCA > 2:1534621/1‑134 TAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACC < 1:356895/135‑1 ACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCT > 2:1026975/1‑135 AAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGA > 1:2146691/1‑134 GCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTT > 2:2304892/1‑134 GCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTT > 2:2298166/1‑134 GCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTC > 2:448533/1‑117 GCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAG > 1:2222649/1‑111 TTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAG < 1:2288268/106‑1 TTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAA > 2:2163271/1‑135 TTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAA > 1:565726/1‑135 ATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATA > 1:723582/1‑52 ATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATA < 2:723582/52‑1 TGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGA < 2:1371758/135‑1 CTCGCTTAATTATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAA > 1:796020/1‑135 ATACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGC > 2:1442562/1‑135 ACAAACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCCCCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTT < 2:1237634/135‑1 AACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTTT > 2:2002393/1‑133 AACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTTT > 2:901820/1‑133 ACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTTTTTC > 1:1373834/1‑135 ACGGCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTTTTTC > 2:877584/1‑135 GCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTTTTTCTTT > 2:410972/1‑135 GCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCACCAAAAAGATAAGTATCTGAATCTGTTTCTTT > 2:573927/1‑135 GCGTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCACACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTTTTTCTTT > 1:1265049/1‑135 GTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTTTTTCTTTT < 2:1841178/134‑1 GTAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTTTTTCTTTT < 2:1450521/134‑1 ATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_45/869‑1002‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATATAAAAAATTAAGCAAATAATAGACTAAAAAATAACTATGTGAGATAATAAACATAGAAAAAAGCTTCAGATACTCCCTCACCCTAGAGTCTTTCCCCAAAAAGATAAGTATCTGAAGCTTTTTCTTTTT > AssemblyC74_contig_55/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |