New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | AssemblyC74_contig_55 | = 585 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
CAGTATATTTTGATGAACGCATATGTAGTCCTCATTTCTTGGGAGTTTTGAGACTACTATATGCGTTTTTTTGTTGATTTACCAACATGTTTAGACATTTTCCTCTAGGAAAAAATTAACTAGCACCACGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_49/133‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTATTATAATCTCATCCTATAAAAAATCAATACTAAAAAACTATTCTTTCGAGTAGCTCTGAACAGATGTCATCATAACTTATGAAGGAAATAGACATAAGATTGTGTATAAAAAAATAACCACCCGAAGGT < AssemblyC74_contig_55/585‑454 AGTATATTTTGATGAACGCATATGTAGTCCTCATTTCTTGGGAGTTTTGAGACTACTATATGCGTTTTTTTGTTGATTTACCAACATGTTTAGACATTTTCCTCTAGGAAAAAATTAACTAGCACCACGGGTTTA > 1:663522/1‑135 AGTATATTTTGATGAACGCATATGTAGTCCTCATTTCTTGGGAGTTTTGAGACTACTATATGCGTTTTTTTGTTGATTTACCAACATGTTTAGACATTTTCCTCTAGGAAAAAATTAACTAGCACCACGGGTTTA < 1:233497/135‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |