| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
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CGTGTAATCTCGGCATGCTCTGCGGTATACAATACTATTTCGACTTTATCTGTCAATTTTAACCCACTTCCCACATAATATTGGAACGTACCGTTTTTCAGATCCTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGGCC < 1:292238/134‑1 TAATCTCGGCATGCTCTGCGGGATACAATACTATTTCGACATTATCTGTCAATTTTAACCCACTTCCCACATAATATTGGAACGTACCGATTTTCAGATCCTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGGCCATTGA < 2:1053527/135‑1 TCGGCATGCTCTGCGGTATACAATACTATTTCGACTTTATCTGTCAATTTTAACCCACTTCCCACATATTATTGGAACGTACCGTTTTTCAGATCCTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGGCCATTGATTTCT < 2:2517472/135‑1 TCGGCATGCTCTGCGGTATACAATACTATTTCGACTTTATCTGTCAATTTTAACCCACTTCCCACATAATATTGGAACGTACCGTTTTTCAGATCCTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGGCCATTGATTTCT < 2:1663107/135‑1 ATGCTCTGCGGTATACAATACTATTTCGACTTTATCTGTCAATTTTAACCCACTTCCCACATAATATTGGAACGTACCGTTTTTCAGATCCTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGGCC > 1:1670216/1‑120 TGCTCTGCGGTATACAATACTATTTCGACTTTATCTGTCAATTTTAACCCACTTCCCACATAATATTGGAACGTACCGTTTTTCAGATCCTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGGCCATTGATTTCTACTCC < 2:2068904/134‑1 CTCTGCGGTATACACTACTATTTCGACTTTATCTGTCAATTTTAACCCACTTCCCACATAATATTGGAACGTTCCGTTTTTCAGATCCTCACTAGGAACGATGGATTGTACTTGGCCATTGATTTCTACTCCAAT < 1:1171125/135‑1 TATAGTTGCTACTAATTTTGAATATAGAAATTAGCGACATACTTAATATGCCGCTAATTCATGTTAATAAGGTATATCCAAAACAGTTACTTTGCGTTAATTGGAACAGCTGCTCGTGTAATCTCGGCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_62/259‑391‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTGCGGTATACAATACTATTTCGACTTTATCTGTCAATTTTAACCCACTTCCCACATAATATTGGAACGTACCGTTTTTCAGATCCTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGGCCATTGATTTCTACTCCAAT < AssemblyC74_contig_64/352‑220 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |