| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | AssemblyC74_contig_11 | = 78782 | 0 (0.000) | coding (62/66 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 459 total aligned reads displayed.
TTTATGTGGTCAAAATTCAAATCTAGGTGGGGATATAGAGTTAAAAATATATTGACATGTGTAAATTTACATGATATATTCATTTCTGTTGTTTTAAGTAGCAAAGCAATAAAATAGTATTTTAAAAAACATATAAAATAGTTGTTGACATGTTAGAAATGACATGATAAGATAACTGAGTTGTTAAAAAAGAACCACTTGTGAAGCTTGATTCTATCGAAAAAAACTTCAAAAAAAGTTCTTGACAAATAACAAATGATAAGTTATGA > AssemblyC74_contig_1/442995‑443263 | aataataataattgatcgaaaaatcatttcacaaagtaatgcttaatttatagttgaccaaggaagaaatacatgataaatttaacagcgttgattctgaagtggatgttatatcacatttctaaaaaatttaaa > 2:1646201‑M1/135‑135 (MQ=255)aataataataattgatcgaaaaatcatttcacaaagtaatgcttaatttatagttgaccaaggaagaaatacatgataaatttaacagcgttgattctgaagtggatgttatatcacatttctaaaaaatttaaa > 1:1322601‑M1/135‑135 (MQ=255) aataataattgatcgaaaaatcatttcacaaattaatgcttaatttatagttgaccaaggaagaaatacatgataaatttaacagcgttgattctgaagtggatgttatatcacatttctaaaaaatttaaaaaa < 2:268451‑M1/4‑1 (MQ=255) aTGTGGTCAAAATTCAAATCTAGGTGGGGATATAGAGTTAAAAATATATTGACATGTGTAAATTTACATGATATATTCATTTCTGTTGTTTTAAGTAGCAAAGCAATAAAATAGTATTTTAAAAAACATATaaaa > 1:1948868/1‑135 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |