| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | AssemblyC74_contig_12 | = 59245 | 0 (0.000) | coding (93/672 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Putative peptidoglycan bound protein (LPXTG motif) Lmo2178 homolog | |||||
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TATTCTCTTTTGTTAAAAAGATCGCCACTTCTTGTTCTTTTTCGATCTTGAAAGTTACTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCT > AssemblyC74_contig_12/58833‑59101 | ggttttctttcgtcaattctaccaccgctgtctgacttctttcgatctcaaactcgattggtgtcgcatctaattcataccctattggcgcttgagtttctaccagctgatatgctcctggtgctaaaccgtcaa < 2:1765604‑M1/1‑1 (MQ=255)ggttttctttcgtcaattctaccaccgctgtctgacttctttcgatctcaaactcgatcggtgtcgcatctaattcataccctattggcgcttgagtttctaccagctgatatgctcctggtgctaaaccgtcaa < 1:1501998‑M1/1‑1 (MQ=255)ggttttcttacgtcaattctaccaccgctgtctgacttctttcgatctcaaactcgaacggtgtcgcatctaattcataccctattggcgcttgagtttctaccagctgatatgctcctggtgctaaaccgtcaa < 1:591600‑M1/1‑1 (MQ=255) tttctttcgttaattctaccaccgctgtctgacttctttcgatctcaaactcgattggtgtcgcatctaattcataccctattggcgcttgagtttctaccagctgatatgctcctggtgctaaaccgtcaatt > 1:1108263‑M1/132‑133 (MQ=255) 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ccATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTcc > 1:394828/1‑89 (MQ=38) gtcaATCGCCAGTTTTCCATCTCCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGATCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGacac < 1:1812484‑M1/130‑1 (MQ=255) aTCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGAcc < 2:2203484/39‑1 (MQ=255) aTCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACAcc < 1:1052254/135‑1 (MQ=255) aTCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACAcc < 1:2158436/135‑1 (MQ=255) aTCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGCTTACATTGGCAACTTGTAAATCAAAAAAAGCAACTTTCAGGACTTCCCCGATTGGGTCATCGATCTTATACAACAAGACACCGcgt > 1:493563/1‑133 (MQ=14) ATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGAcc < 1:2291685‑M1/35‑1 (MQ=255) ATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCt < 2:1368318‑M1/135‑1 (MQ=255) ATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCCCCGCTTTGGTCATCGACCTTTGTCAACACGACAcc < 1:629167‑M1/131‑1 (MQ=255) | TATTCTCTTTTGTTAAAAAGATCGCCACTTCTTGTTCTTTTTCGATCTTGAAAGTTACTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAGCCATCTATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCT > AssemblyC74_contig_12/58833‑59101 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |