New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_21 | = 10843 | 0 (0.000) | 232 (0.670) | 69/258 | 0.3 | 100% | intergenic (+54/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Mobile element protein/– |
? | AssemblyC74_contig_49 | = 764 | 0 (0.000) | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Mobile element protein/– |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
AACCCGAAAAGAAGGCACTCTCTTCGGGTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_21/10714‑10843 | aaCCCGAAAAGAAGGCACTCTCTTCGGGTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCccctt > 2:927968‑M1/1‑130 (MQ=255) aaCCCGAAAAGAAGGCACTCTCTTCGGGTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCccctt > 2:18031‑M1/1‑130 (MQ=255) aaCCCGAAAAGAAGGCACTCTCTTCGGGTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCccctt > 1:590870‑M1/1‑130 (MQ=255) aaCCCGAAAAGAAGGCACTCTCTTCGGGTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTAGTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCccctt > 2:1725412‑M1/1‑130 (MQ=255) ggCACTCTCTTCGGGTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttt < 1:1862399‑M1/135‑19 (MQ=255) ctTCGGGTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggat > 1:359826‑M1/1‑109 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta < 1:927968‑M1/135‑31 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta < 2:1870560‑M1/135‑31 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta < 2:143274‑M1/135‑31 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta < 2:2135343‑M1/135‑31 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta < 2:2539447‑M1/135‑31 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta < 1:1518734‑M1/135‑31 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta < 2:642988‑M1/135‑31 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta < 2:855880‑M1/135‑31 (MQ=255) gggTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta < 2:903512‑M1/135‑31 (MQ=255) gggATTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta < 1:2286571‑M1/135‑31 (MQ=255) ggTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttat < 1:737418‑M1/135‑32 (MQ=255) cGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaa < 2:1191435‑M1/135‑38 (MQ=255) cGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaa < 1:2169705‑M1/135‑38 (MQ=255) ggTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaat > 1:1426736‑M1/1‑97 (MQ=255) ggTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaat > 1:688323‑M1/1‑97 (MQ=255) ggTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaat > 1:944585‑M1/1‑97 (MQ=255) ggTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta < 2:537040‑M1/127‑31 (MQ=255) ggTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta > 1:537040‑M1/1‑97 (MQ=255) ggTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGACTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaat > 2:1709151‑M1/1‑97 (MQ=255) cTGAAATCACGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCACCAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcct < 2:17118‑M1/134‑46 (MQ=255) cTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTAATTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcct < 2:2105560‑M1/134‑46 (MQ=255) cTGAAATCAAGGGATTATTGGGAATCCCAGCTTACCACATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCACCCGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatattatggctaagatatcct < 2:823671‑M1/134‑46 (MQ=255) aaaTCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgt < 1:2549005‑M1/135‑50 (MQ=255) aTCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtc < 1:1213539‑M1/134‑51 (MQ=255) tCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCCTAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCaccttaagggcaagcttttcatgtattttatggctaatatatcctttgtccc < 1:811453‑M1/135‑53 (MQ=255) tCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtc > 1:1375769‑M1/1‑83 (MQ=255) aaGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccct < 2:2450901‑M1/135‑55 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttttcccctagg > 1:2379155‑M1/1‑78 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctagg > 2:950221‑M1/1‑78 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctagg > 1:2215414‑M1/1‑78 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctagg > 2:1003749‑M1/1‑78 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctagg > 2:2013111‑M1/1‑78 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctagg > 1:299291‑M1/1‑78 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctagg > 2:1909212‑M1/1‑78 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctagg > 2:1581352‑M1/1‑78 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgt < 1:294204‑M1/127‑50 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcct < 1:420970‑M1/123‑46 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcct > 2:420970‑M1/1‑78 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta > 2:1037742‑M1/1‑78 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta < 1:1037742‑M1/108‑31 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta < 1:1288459‑M1/108‑31 (MQ=255) gTATTATTGGGAATCACAGATTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTAAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcatttcatggattttatggctaatataacctttgtcccctagg > 1:1089213‑M1/1‑78 (MQ=255) attattGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggat > 2:257179‑M1/1‑76 (MQ=255) attattGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggat > 2:1442414‑M1/1‑76 (MQ=255) ggAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattggga < 1:450942‑M1/135‑67 (MQ=255) tCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagat < 1:1938506‑M1/135‑71 (MQ=255) cccAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcct < 2:722563‑M1/109‑46 (MQ=255) cAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcgtttttcccctaggatattgggtagatt > 2:692107‑M1/1‑62 (MQ=255) cAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagatt > 2:1142312‑M1/1‑62 (MQ=255) cAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagatt > 2:1529793‑M1/1‑62 (MQ=255) cAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagatt > 2:451775‑M1/1‑62 (MQ=255) ttAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcccttgtcccctaggagattgggaagattcgcttc > 1:1640941‑M1/1‑58 (MQ=255) tAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgctt < 1:2544505‑M1/133‑77 (MQ=255) tCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccg < 1:2479237‑M1/135‑83 (MQ=255) tCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccg < 2:2185552‑M1/135‑83 (MQ=255) tCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccg < 1:2013111‑M1/135‑83 (MQ=255) aTAGATACCGTAAGGTATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccataagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgat < 2:1358281‑M1/135‑85 (MQ=255) aTAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgat < 1:1646872‑M1/135‑85 (MQ=255) aTAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgat < 2:1597943‑M1/135‑85 (MQ=255) aTAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgat < 2:1995119‑M1/135‑85 (MQ=255) aTAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgat < 1:1142300‑M1/135‑85 (MQ=255) tACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaa > 2:1076749‑M1/1‑46 (MQ=255) cGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctc < 1:1785315‑M1/135‑93 (MQ=255) tAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctct > 2:1141318‑M1/1‑41 (MQ=255) aaGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaa > 1:1720468‑M1/1‑40 (MQ=255) aaGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaa > 2:248526‑M1/1‑40 (MQ=255) aaGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagactctaa > 2:2160489‑M1/1‑40 (MQ=255) aaGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggatttta > 1:772247‑M1/1‑40 (MQ=255) gggATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACATAAACcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatccattgtcccctaggatatttggaagattcgcttcttcagataaagtctctaa > 1:1692204‑M1/1‑38 (MQ=255) gggATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctcggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaa > 2:2077164‑M1/1‑38 (MQ=255) gggATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaa > 1:1881699‑M1/1‑38 (MQ=255) gggATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagagtcgcttcttccgataaagtctctaa > 2:2559906‑M1/1‑38 (MQ=255) aTTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacact < 2:1375769‑M1/134‑100 (MQ=255) aTTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacac < 2:299291‑M1/133‑99 (MQ=255) tttATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttc < 1:1003730‑M1/135‑103 (MQ=255) tATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagattttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcac < 2:2547380‑M1/135‑105 (MQ=255) aTTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcac > 1:1532654‑M1/1‑30 (MQ=255) aTTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcac > 2:1339497‑M1/1‑30 (MQ=255) tatttatttaaaACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtc < 1:2045741‑M1/133‑108 (MQ=255) tCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtc < 2:934695‑M1/135‑108 (MQ=255) tCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtc < 1:882384‑M1/135‑108 (MQ=255) tttatttaAAACTTTGCAACAGAACCcccttcagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtcat < 1:1416606‑M1/135‑110 (MQ=255) atttaAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtcatgga > 1:1337166‑M1/1‑23 (MQ=255) ttaAAACTTTGCAACAGAACCcccttcagggcaatcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttacgataaagtctctaacactttcacgtcatggaca < 1:974101‑M1/135‑115 (MQ=255) taAAACTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtcatggac > 1:155538‑M1/1‑20 (MQ=255) aaCTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtcatggacacctg < 1:1753259‑M1/135‑119 (MQ=255) aaCTTTGCAACAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtcatggacacctg < 2:371507‑M1/135‑119 (MQ=255) aaCTTAGCAACAGAACCcccctaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtcatggacacctg < 2:2283380‑M1/135‑119 (MQ=255) aaCAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtcatggacacctggattcgtg > 2:1783485‑M1/1‑9 (MQ=255) aaCAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtcatggacacctggattcgtg > 2:359241‑M1/1‑9 (MQ=255) aaCAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtcatggacacctggattcgtg > 1:233766‑M1/1‑9 (MQ=255) aaCAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtcatggacacctggattcgtg > 2:123486‑M1/1‑9 (MQ=255) aaCAGAACCcccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatatt < 1:44718‑M1/71‑63 (MQ=255) ccccttaagggcaagcttttcatggattttatggctaatatatcctttgtcccctaggatattgggaagattcgcttcttccgataaagtctctaacactttcacgtcatggacacctggattcgtgattgagta > 2:230057‑M1/1‑1 (MQ=255) | AACCCGAAAAGAAGGCACTCTCTTCGGGTTTTCGGTCTGTACTGAAATCAAGGTATTATTGGGAATCCCAGCTTAAATCATAGATACCGTAAGGGATTTTATTCTTTATTTAAAACTTTGCAACAGAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_21/10714‑10843 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |