| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_40 | = 62 | NA (NA) | 140 (0.570) +G |
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| ? | AssemblyC74_contig_5 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+540) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/FIG00627359: hypothetical protein | |||||
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
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ata‑‑tTA‑TAATAATT‑TTATTTGCTCCTTAATTAGTAACGAACTACTCTAAATTGCTAGCAATAATTACGGTATCTAGCTTAAAATAAAAAAACACCTCAAACGAGGTGTTTAAAGTTCAACATTATTTTACAatat < 1:2502744/135‑1 (MQ=255) ata‑‑tTA‑TAATAATT‑TTATTTGCTCCTTAATTAGTAACGAACTACTATAAATTGCTAGCAATAATTACGGTATCTAGCTTAAAATAAAAAAACACCTCAAACGAGGTGTTTAAAGTTCAACATTATTTTACAatat < 1:501246/135‑1 (MQ=255) ta‑‑tta‑tAATAATT‑TTATTTGCTCCTTAATTAGTAACGAACTACTCTAAATTGCTAGCAATAATTACGGTATCTAGCTTAAAATAAAAAAACACCTCAAACGAGGTGTTTAAAGTTCAACATTATTTTACAATAtt < 2:1081711/135‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGAAGTTTTTTTGAGTTACGTAAATGGAAAGTTTTGTCTCGCTTAATTTGACAAATAATA‑‑TTA‑TAATAATT‑TTATTTGCTCCTTAATTAGTAACGAACTACTCTAAATTGCTAGCAATAATTACGGTATCTAGCTTAAAATAAAAAAACACCTCAAACGAGGTGTTTAAAGTTCAACATTATTTTACAATATT > AssemblyC74_contig_40/1‑195 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |