| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_44 | = 1136 | 0 (0.000) | 304 (0.550) | 70/258 | 0.2 | 100% | coding (1/1134 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_48 | = 844 | 0 (0.000) | coding (843/843 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Chitinase (EC 3.2.1.14) | |||||
Only 100 of 615 total aligned reads displayed.
ATTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_44/1002‑1136 | tttGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCt > 1:1071539‑M2/1‑134 (MQ=255) tGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaag < 2:2043440‑M1/135‑4 (MQ=255) tGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaag < 2:2337575‑M1/135‑4 (MQ=255) gTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagc > 2:2244890‑M1/1‑131 (MQ=255) gTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagc > 1:2114003‑M1/1‑131 (MQ=255) tACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttg > 1:508556‑M2/1‑124 (MQ=255) tACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttg > 1:1627998‑M2/1‑124 (MQ=255) tCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACTTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccag > 2:2216685‑M2/1‑118 (MQ=255) cacaGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaa > 1:1468138‑M1/1‑108 (MQ=255) caGAGGTGACATCCTAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaaca > 1:225991‑M1/1‑106 (MQ=255) caGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttg < 1:308711‑M2/134‑29 (MQ=255) caGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaaca > 2:463395‑M1/1‑106 (MQ=255) caGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACAAGTCCAAACTACTGAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaaca > 1:916362‑M1/1‑106 (MQ=255) ggTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATAGTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacctatt > 2:2442183‑M1/1‑102 (MQ=255) cATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattcc < 1:218985‑M2/133‑37 (MQ=255) cATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaa > 2:1921815‑M1/1‑97 (MQ=255) tCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagct < 2:1005218‑M2/135‑41 (MQ=255) tCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagct < 2:1904357‑M2/135‑41 (MQ=255) tCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaaga > 1:1813053‑M1/1‑95 (MQ=255) tCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaaga > 2:2387636‑M1/1‑95 (MQ=255) cccAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagcta > 2:187524‑M2/1‑94 (MQ=255) cccAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagat < 1:796504‑M1/135‑42 (MQ=255) cAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaac < 1:1579110‑M2/135‑44 (MQ=255) cAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaag < 2:773147‑M2/135‑48 (MQ=255) cAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttg < 1:2358257‑M1/135‑48 (MQ=255) aGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggtttt > 2:2139947‑M1/1‑87 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggt < 2:594660‑M2/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCacgcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta < 2:1180333‑M1/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta > 2:2313039‑M1/1‑83 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta < 1:2526542‑M1/135‑53 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta > 1:334974‑M1/1‑83 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta > 2:2519904‑M1/1‑83 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgtttta > 1:1895611‑M1/1‑83 (MQ=255) aaaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacaggtttggaacatatttgaaagattggttgtttta > 1:1141553‑M1/1‑83 (MQ=255) aaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttag > 2:863255‑M1/1‑82 (MQ=255) aaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttag > 1:880046‑M1/1‑82 (MQ=255) aaTTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttag > 1:569010‑M1/1‑82 (MQ=255) aGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaat < 2:325373‑M2/134‑63 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 2:909731‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 2:1466604‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:754392‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 2:1287045‑M2/1‑71 (MQ=255) gTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 2:1227401‑M2/1‑71 (MQ=255) aaTTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgctta < 1:429590‑M2/135‑69 (MQ=255) tactacAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagtta < 1:2387636‑M1/135‑72 (MQ=255) acAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc < 1:1975453‑M1/135‑76 (MQ=255) aCCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagatt > 2:429590‑M2/1‑57 (MQ=255) aCCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagatt > 1:120286‑M2/1‑57 (MQ=255) aCCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacat > 2:1104047‑M2/1‑57 (MQ=255) aCCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacat < 1:1104047‑M2/90‑34 (MQ=255) aCCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatt < 1:2079596‑M1/90‑34 (MQ=255) ttGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtc < 1:142563‑M2/135‑83 (MQ=255) ttGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaatt > 1:1001179‑M2/1‑53 (MQ=255) ttGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatac > 1:1515429‑M1/1‑53 (MQ=255) aaCATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagatacatcccaaccagttaaatcaacatacttt < 1:1363711‑M1/135‑86 (MQ=255) aaCATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACGTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatacttt < 1:1840274‑M1/135‑86 (MQ=255) aCATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagt < 2:375874‑M2/135‑87 (MQ=255) cATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagtt < 2:569346‑M2/135‑88 (MQ=255) cATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatca > 2:506828‑M1/1‑48 (MQ=255) cATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc > 2:1410729‑M1/1‑48 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaaca < 2:113087‑M2/135‑94 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaaca < 2:293763‑M2/135‑94 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgtt > 2:1058609‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgtt > 2:656684‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgtt > 1:1687303‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatacgtt > 2:1960705‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc > 2:720727‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaacc > 1:975704‑M1/1‑42 (MQ=255) cTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaa < 2:1634019‑M2/135‑95 (MQ=255) tCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaa > 1:608560‑M1/1‑40 (MQ=255) atatTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaattt > 1:1273870‑M2/1‑38 (MQ=255) tatTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtctttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttg > 1:1760688‑M2/1‑37 (MQ=255) cGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaa > 1:460679‑M2/1‑33 (MQ=255) cGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatcctt > 1:132584‑M1/1‑33 (MQ=255) gTGCCACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatcctta > 2:474185‑M1/1‑32 (MQ=255) gTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaac > 1:2555066‑M2/1‑32 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggtttttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatacttaaatccgttaaaatccttaaaca > 2:401784‑M1/1‑28 (MQ=255) cacTAGACATGTCCCAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaaca > 2:2361628‑M1/1‑28 (MQ=255) aTGTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatg < 2:137761‑M2/135‑116 (MQ=255) gTCCCAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgtt > 1:851162‑M2/1‑18 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccaggga > 1:1995380‑M1/1‑15 (MQ=255) ccAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccaggga > 2:2091070‑M1/1‑15 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 1:363908‑M2/134‑121 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgt < 2:2002866‑M2/134‑121 (MQ=255) cAACTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagattttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtc > 2:1360297‑M2/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttgtaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcc > 2:2180270‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 2:805799‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 2:850140‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 1:2333198‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 2:168525‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaa > 2:1496882‑M1/1‑14 (MQ=255) cAACTACTTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatc > 2:1577696‑M1/1‑14 (MQ=255) aaCTACTTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtca > 2:2556698‑M2/1‑13 (MQ=255) actactTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtcac > 2:1800487‑M2/1‑12 (MQ=255) actactTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaacattcccgccagggaatt > 1:821570‑M1/1‑12 (MQ=255) actactTAAATCaagcgtatcaatatcacagttttggaaaatattttaaagatttgttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaaaatccttaaaaattcccgacagggaatt > 1:2451376‑M1/1‑12 (MQ=255) actTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtcacaca > 1:716044‑M2/1‑9 (MQ=255) actTAAATCtggagctgttgtcccagtatagtttttgaacattccagctaacgaagtaggtagcttccaattgcttacatctagattcgtcaagttggaacaatttgcaaacatactatccatgttcgtcacaca > 2:971083‑M2/1‑9 (MQ=255) aaaTCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaa > 1:402766‑M1/1‑5 (MQ=255) aaTCaagcgtatcaatatcacagttttggaacatatttgaaagattggttgttttagataaatcccaaccagttaaatcaacatactttaatccgttaatagccttaatcattcccgccagggaatttggtaat > 1:2170702‑M1/1‑4 (MQ=255) | ATTTGTAAACATACTATTCATATTCGTCACAGAGGTGACATCCCAACCAGTCAAATTTAACGTAGTTAAATTACTACAACCCTTGAACATATTGCTCATATTCGTGACACTAGACATGTCCCAACTACTTAAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_44/1002‑1136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |