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CATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_45/868‑1002 | cATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCg < 1:653680/135‑1 (MQ=255)cATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCg > 2:1244207/1‑135 (MQ=255)cATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCg < 2:1991715/135‑1 (MQ=255) ttACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCg > 1:1221524/1‑133 (MQ=255) 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CATTACAAGCTCGTTTGGTGTAAGATGGGTATAAGTCATTTATGTTCACTCTCCTTGTATGCTTTAGCGGGTATTACAATTTGAGTGTAACATAAATGGCTTTTTTATTTGTCTCGCTTAATTATACAAACGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_45/868‑1002 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |