| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_47 | 452 = | NA (NA) | 308 (0.910) +TACACTCGTTAAAGAGCCACAGCCATAAAACATA |
65/190 | 0.0 | 100% | noncoding (7/29 nt) | direct | CRISPR repeat with sequence actatcgatgtaagtaattgggatacgtc |
| ? | AssemblyC74_contig_61 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+2) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 1023 total aligned reads displayed.
CAAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTG > AssemblyC74_contig_47/319‑582 | gtcaaatgttactactatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGa > 1:1037050‑M1/103‑135 (MQ=255) aaaGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGAt > 1:1154187/1‑135 (MQ=255) aaaGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGAt > 2:1721432/1‑135 (MQ=255) acaagtatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATgtaagt > 2:1944434‑M1/127‑135 (MQ=255) aatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaaTGATATGTTTTCAGGTGTAAAAACTAAGAGTATAGATGTAATAAATTgg < 1:1217732‑M1/49‑1 (MQ=255) tgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTg > 1:2187704‑M1/120‑133 (MQ=255) tgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTg > 1:686984‑M1/120‑133 (MQ=255) tgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTg > 1:1341969‑M1/120‑133 (MQ=255) ctatgactgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTggg < 1:2142453‑M1/16‑1 (MQ=255) cTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATAc < 2:2257661/135‑1 (MQ=255) cTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATAc > 2:2341323/1‑135 (MQ=255) cTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATAc > 1:1004431/1‑135 (MQ=255) tgaatgaaCTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGTTACGt > 2:2202686/1‑135 (MQ=255) tgaaCTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCaaa > 2:1415066/1‑135 (MQ=255) gaaCTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCAACGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGTGGTTAAATCTAACACAATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAAt > 2:2029763/1‑135 (MQ=255) tttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATg < 1:865732‑M1/28‑1 (MQ=255) tgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATg > 2:1843453‑M1/108‑135 (MQ=255) tttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTa < 1:1615912‑M1/62‑1 (MQ=255) tttCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTAc > 2:39936/1‑135 (MQ=255) tgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTacgaa > 2:44131‑M1/100‑132 (MQ=255) ggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTacgaa > 1:382584‑M1/100‑132 (MQ=255) ggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTacgaa > 2:957851‑M1/100‑132 (MQ=255) ggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTacgaa > 1:1498943‑M1/100‑132 (MQ=255) ggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTTGGATACGTCAAATGTtacgaat < 2:510369‑M1/67‑4 (MQ=255) gctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgaaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAAGGGTACgaatatta < 2:608716‑M1/40‑3 (MQ=255) taaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATgac < 2:1608119‑M1/41‑2 (MQ=255) taaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGa > 2:2069814‑M1/95‑134 (MQ=255) ctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGaa < 2:792551‑M1/41‑1 (MQ=255) ctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacatctatgaattctatgttttattgctgtgtctctttaacgagtggaGATGTAAGAAATTGGGATACTTCACATGATacgaataagca < 1:1073484‑M1/41‑5 (MQ=255) aaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATAtgact > 1:1298178‑M1/94‑133 (MQ=255) cAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAAtt < 2:1011058/135‑1 (MQ=255) aacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTAt < 1:561499‑M1/47‑1 (MQ=255) cgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGt < 1:2300597‑M1/49‑1 (MQ=255) agtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGttt > 2:85149‑M1/85‑135 (MQ=255) gtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTAt < 1:1678824‑M1/54‑1 (MQ=255) aCCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTAt > 2:1339436/1‑135 (MQ=255) gatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTAt < 2:2149877‑M1/54‑1 (MQ=255) tagatgtaagtacttgggctccgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTTTCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCt > 1:589886‑M1/47‑135 (MQ=255) atgtacgtacttgggattcgtcgtcggttacttctatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCt > 2:747879‑M1/78‑135 (MQ=255) atgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTTGGATACGTCTAATGTTACTAATATGAATTCTATgttttaagtat < 1:908518‑M1/58‑6 (MQ=255) atgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACTTCAATTGTTAAGAATATGCCTTCAATGTTTTAt < 1:1737792‑M1/54‑1 (MQ=255) atgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACTAATATGACTTCTATGTTTTatgggt < 1:758773‑M1/58‑3 (MQ=255) atgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTAt < 1:2554390‑M1/54‑1 (MQ=255) atgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTAt < 2:1996320‑M1/54‑1 (MQ=255) gtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCt > 2:1656432‑M1/76‑133 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCtgt > 1:141360/1‑134 (MQ=255) tatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTAACGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCtgt > 2:1271304/1‑133 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGTATACGTCAAATGTTACTAATATGAATTATATGTTTTATGGCTGTGGatct < 1:949876‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCt > 1:827638‑M1/70‑127 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 1:1885322‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 2:2378851‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 2:87641‑M1/66‑1 (MQ=255) gtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCtt < 2:2564950‑M1/98‑1 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:2272203‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttatatgagtgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:317239‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:1637486‑M1/68‑135 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:1879801/135‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:448718‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:342218‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:710443‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:1781885‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaaTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg > 1:1384966‑M1/33‑80 (MQ=255) gggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTaa < 1:1860406‑M1/70‑1 (MQ=255) ttGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACg < 1:2333677/134‑1 (MQ=255) atacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:1167721‑M1/68‑1 (MQ=255) atacgtcgaagctttcttatatgaatgatttgatttatggctgtggatcttaaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACg > 2:1470985‑M1/63‑134 (MQ=255) tacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAg < 2:2314658‑M1/74‑1 (MQ=255) gatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAgt < 1:649140‑M1/106‑1 (MQ=255) cgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAgtg < 1:2036510‑M1/76‑1 (MQ=255) cgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAg < 2:1127122‑M1/79‑1 (MQ=255) gaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:1679685‑M1/56‑123 (MQ=255) tgttacttctatgaattatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgt > 2:363380‑M1/53‑135 (MQ=255) aaTGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgta > 1:2099544/1‑135 (MQ=255) aaTGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgta > 1:1454564/1‑135 (MQ=255) aaTGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgta > 2:137884/1‑135 (MQ=255) acttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgtaagt > 1:1118746‑M1/49‑135 (MQ=255) ctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACTAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTATCGAGTGTTGATGTAAGTAAtt < 2:661795‑M1/91‑1 (MQ=255) ttctatgaatgcTATGTTTGCATGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg > 2:550737‑M1/13‑135 (MQ=255) tatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGATGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg > 1:275579‑M1/44‑135 (MQ=255) tctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCTATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTgg < 1:2359770‑M1/124‑1 (MQ=255) cTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCgaag > 1:1973919/1‑67 (MQ=16) actgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGa < 1:2502255‑M1/95‑1 (MQ=255) ctgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATAAGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATa < 2:1062790‑M1/97‑1 (MQ=255) attctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATgtaag < 2:1582350‑M1/8‑1 (MQ=255) attctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCtgt > 2:1218832‑M1/39‑98 (MQ=255) tgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATAc < 2:926473‑M1/98‑1 (MQ=255) tgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATAc > 1:992801‑M1/38‑135 (MQ=255) atgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGt < 1:2390296‑M1/131‑1 (MQ=255) atgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGt < 1:15644‑M1/131‑1 (MQ=255) atatGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGACACGTCGa < 2:2473253/135‑1 (MQ=37) atGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAg > 2:2406916/1‑135 (MQ=37) atGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAg > 2:1450777/1‑135 (MQ=17) gTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:243609/1‑96 (MQ=40) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACaaa < 2:2104236/134‑1 (MQ=40) gggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttcta < 2:290546‑M2/135‑6 (MQ=255) gctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATa < 2:1539855‑M1/19‑1 (MQ=255) tAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgac < 1:2222326‑M2/135‑10 (MQ=255) aaaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgact < 1:470311‑M2/135‑11 (MQ=255) aaaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgact > 1:1809290‑M2/1‑125 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGtttt > 1:530926/1‑135 (MQ=255) | CAAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTG > AssemblyC74_contig_47/319‑582 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |