| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_47 | 486 = | NA (NA) | 9 (0.020) +TCGTAACATTA |
4/236 | 0.2 | 27.5% | coding (485/879 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_61 | 22 = | 26 (0.040) | coding (401/420 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 885 total aligned reads displayed.
CCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATT > AssemblyC74_contig_47/352‑620 | taaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATgac < 2:1608119‑M1/41‑2 (MQ=255) ctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaaagagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCTAATGTTAAGTATATGaa < 2:1391363‑M1/41‑1 (MQ=255) aaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATAtgact > 1:1298178‑M1/94‑133 (MQ=255) ctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAAtt > 2:1873964‑M1/93‑135 (MQ=255) ctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAAtt > 1:1916701‑M1/93‑135 (MQ=255) aatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATatgactt > 2:2066140‑M1/93‑132 (MQ=255) aatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATatgactt > 2:1157498‑M1/93‑132 (MQ=255) aataCCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATGTATCTCTATCGTTGTAAGTAATTGGGATAGGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGtt < 1:2341323/131‑1 (MQ=21) ctatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGtttt < 1:1184463‑M1/52‑1 (MQ=255) aCCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTAt > 1:549445/1‑135 (MQ=255) tagatgtaagtacttgggctccgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTTTCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCt > 1:589886‑M1/47‑135 (MQ=255) tCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTTGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCt < 1:1064185/135‑1 (MQ=255) atgtacgtacttgggattcgtcgtcggttacttctatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCt > 2:747879‑M1/78‑135 (MQ=255) atgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTTGGATACGTCTAATGTTACTAATATGAATTCTATgttttaagtat < 1:908518‑M1/58‑6 (MQ=255) atgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATACTATGTTTTAt < 1:1738194‑M1/54‑1 (MQ=255) gtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggatctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCtgt > 2:776761‑M1/76‑135 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCtgt > 1:141360/1‑134 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCtgt > 1:390700/1‑134 (MQ=255) gtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGc > 1:1142224‑M1/42‑135 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 2:387928‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 2:1680836‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGGTTTATGGCTGTGGctct < 2:839722‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 2:1442385‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 1:1811940‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 2:2378851‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttagatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATACTATGTTATATGGCTGTGGctct < 1:880261‑M1/66‑1 (MQ=255) aatagggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATTTCAGTAATTGGGATACGACAAATGTTACGAAAATGAATTCTATGTGTTATGGCTGTggctat < 2:914162‑M1/66‑3 (MQ=255) tttgtctacgacgaaggatagttctatgatttctttgttttttggctgtggctatttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:2100433‑M1/68‑135 (MQ=255) ttggtatacgtcgaaggttaatactatgaattctctgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:2006252‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:2461985‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:441246‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:2515375‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:1009946‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctcattaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:466895‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:2404697‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:1637486‑M1/68‑135 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:527321/135‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:2111968‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:1792806‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:710443‑M1/99‑1 (MQ=255) gggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTaa < 1:1860406‑M1/70‑1 (MQ=255) attgggatacgtcgttggtttcttctatgtaTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:305881‑M1/32‑133 (MQ=255) tacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGa > 1:1343277‑M1/62‑134 (MQ=255) tacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGa > 1:744729‑M1/62‑134 (MQ=255) cgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAgtg < 1:636043‑M1/76‑1 (MQ=255) tcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTa > 1:259620‑M1/58‑135 (MQ=255) tcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTAATATGTGTGTGGCTCTTTAACGAGTGTa < 2:594535‑M1/78‑1 (MQ=255) cgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAg < 1:2369287‑M1/110‑1 (MQ=255) cgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAg < 2:1127122‑M1/79‑1 (MQ=255) gaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:2319357‑M1/56‑123 (MQ=255) gttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgta < 1:1682082‑M1/84‑1 (MQ=255) gttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgta < 1:2240576‑M1/84‑1 (MQ=255) aaTGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGTGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGAAATTGGGATACGTCAAAACATACGGATATGAATTCAATGATTTATTGCTGTGGATCTGTAACGAGTGTAGATgta > 1:2191348/1‑135 (MQ=14) aaTGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgta > 1:1454564/1‑135 (MQ=255) atatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAtt < 1:160715‑M1/91‑1 (MQ=255) ttCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg < 2:2349239/135‑1 (MQ=255) tatgaattctttgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg > 1:805418‑M1/44‑135 (MQ=255) tctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTgg < 2:22436‑M1/124‑1 (MQ=255) tctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTgg < 2:959001‑M1/124‑1 (MQ=255) atgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTgg > 2:1913824‑M1/43‑135 (MQ=255) cTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTggg > 2:508946/1‑135 (MQ=255) tGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATa > 1:2288702/1‑135 (MQ=40) attctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATa < 2:872952‑M1/97‑1 (MQ=255) tgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATAc > 2:1665803‑M1/38‑135 (MQ=255) tactgcTTTGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTTTCGATGTAAGTAATTGGGATCCGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATAc > 1:1494450‑M1/7‑135 (MQ=255) gCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACg < 2:272599/135‑1 (MQ=39) gCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTATTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACg < 1:2141776/135‑1 (MQ=255) aatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACg > 1:1103983‑M1/6‑135 (MQ=255) atgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGt < 1:2311924‑M1/131‑1 (MQ=255) ttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAg < 1:424117‑M1/105‑1 (MQ=255) atGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGaa < 2:549445/134‑1 (MQ=37) atGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAg > 2:2185107/1‑135 (MQ=37) atGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCt < 1:1998814/88‑1 (MQ=255) tGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAgg > 2:1213996/1‑135 (MQ=17) gTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:243609/1‑96 (MQ=40) tttGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGAAGATGTAAGTAATTGGGATACTTCGAAGGt > 1:1386117/1‑134 (MQ=255) ggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACa < 2:1464257‑M1/111‑1 (MQ=255) gCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACa < 2:1723997/135‑1 (MQ=38) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACaaa < 2:639731/134‑1 (MQ=40) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACaaa < 2:1346505/134‑1 (MQ=40) aaaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAg < 2:212554/134‑1 (MQ=255) aaaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGt > 1:1034601/1‑135 (MQ=255) tCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACTTCGAAGGTTACAAATATGAGTtat > 2:1248788/1‑135 (MQ=255) tCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTtat < 1:943980/135‑1 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGtttt > 1:1532676/1‑135 (MQ=255) cGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGact < 1:2510447/121‑3 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTtgt > 2:1583118/1‑131 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTtgt > 2:678062/1‑131 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACt < 2:352587/135‑1 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgatatgtttgctggggttaaatct < 2:130907‑M2/135‑35 (MQ=255) ttGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCttt < 2:1830792/135‑1 (MQ=255) ttGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCttt < 2:1499183/135‑1 (MQ=255) ttGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCttt < 2:1062067/135‑1 (MQ=255) ttGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggg > 1:681957‑M2/1‑99 (MQ=255) ttGCGAGACGACAAATGCTACGGACATGAATTCTATTTTTTATGTCTGTGGCTCTATATCGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTTTATGTTTTGTGACTGTGTCTCttt < 2:1975366/135‑1 (MQ=21) aTACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACg < 1:1003790/134‑1 (MQ=255) cGTCGAAGGTTACATATATGACTGATATGTTTTATGTCTGTGGATCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGGAATTGGGATACGTCGAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTGTATGGGTGTGGCTCTTTAACGAgtg > 1:32192/1‑135 (MQ=2) gTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggg > 1:983463‑M2/1‑83 (MQ=255) gATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAt > 1:2058766/1‑135 (MQ=255) aatatgACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgaatgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatagatgtaggtaattgg < 2:240176‑M2/134‑59 (MQ=255) | CCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTGTGACTGTGTCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATT > AssemblyC74_contig_47/352‑620 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |