| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_16 | 21870 = | 221 (1.000) | 225 (0.900) | 54/258 | 1.4 | 67.1% | coding (264/387 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_24 | = 8654 | 0 (0.000) | intergenic (+132/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | 1,4‑dihydroxy‑2‑naphthoate polyprenyltransferase (EC 2.5.1.74)/– | |||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
TAACAGCATGAAGAGGTTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_24/8520‑8654 | aCAGCATGAAGAGGTTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGga < 2:853619‑M2/135‑3 (MQ=255) aCAGCATGAAGAGGTTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGga < 1:1596197‑M2/135‑3 (MQ=255) aCAGCATGAAGAGGTTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGga < 2:392108‑M2/135‑3 (MQ=255) tGAAGAGGTTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgt > 1:2437279‑M2/1‑127 (MQ=255) tGAAGAGGTTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgt > 1:1802245‑M2/1‑127 (MQ=255) gAAGAGGTTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtg < 2:1638340‑M2/135‑10 (MQ=255) gAAGAGGTTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtg < 1:2511380‑M2/135‑10 (MQ=255) gAAGAGGTTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtg < 2:291240‑M2/135‑10 (MQ=255) agagGTTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACATCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaa < 1:960335‑M2/135‑12 (MQ=255) agagGTTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaa < 1:757677‑M2/135‑12 (MQ=255) agagGTTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaa < 2:415143‑M2/135‑12 (MQ=255) agagGGTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaa < 1:727883‑M2/135‑12 (MQ=255) cAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaaga < 2:1729392‑M2/135‑39 (MQ=255) cAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaaga < 2:1044251‑M2/135‑39 (MQ=255) aataaGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattatgaaaaat < 2:1001992‑M2/135‑44 (MQ=255) aataaGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaagaaaaat < 1:2221408‑M2/135‑44 (MQ=255) aataaGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaagaaaaat < 1:1705029‑M2/135‑44 (MQ=255) aataaGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaagaaaaat < 1:2408749‑M2/135‑44 (MQ=255) aataaGAACAGCCAAATAAAAATAGCGCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaagaaaaat < 2:1561421‑M2/135‑44 (MQ=255) gAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaagaaaaattttgt < 2:2141493‑M2/135‑49 (MQ=255) gAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaagaaaaattttgt < 2:1853671‑M2/135‑49 (MQ=255) gAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaagaaaaattttgt < 1:1587303‑M2/135‑49 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ccAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaagaaaaattttgtgaaaat < 2:573022‑M2/135‑55 (MQ=255) ccAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaagaaaaattttgtgaaaat < 1:306392‑M2/135‑55 (MQ=255) cAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaagaaaaattttgtgaaaat < 1:2429558‑M2/134‑55 (MQ=255) aaTAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaagaaaaattttgtgaaaatggc < 2:1024227‑M2/135‑58 (MQ=255) aaTAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaagaaaaattttgtgaaaatggc < 1:811725‑M2/135‑58 (MQ=255) aaTAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAGgaggttgtgaaaaagtcgcttagtttcgagtattaagaaaaattttgtgaaaatggc < 1:1006793‑M2/135‑58 (MQ=255) 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TAACAGCATGAAGAGGTTGTGAAAAAACTGCCCTGCATCAAGTAATAAGAACAGCCAAATAAAAATAGCTCCTTATATTTTTCGTTTGGTTGGGCTTATTACCGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_24/8520‑8654 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |