| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_20 | 1 = | 0 (0.000) | 256 (0.680) | 68/258 | 0.6 | 100% | intergenic (–/+131) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Mobile element protein |
| ? | AssemblyC74_contig_57 | = 493 | 0 (0.000) | coding (1/492 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Mobile element protein | |||||
Only 100 of 441 total aligned reads displayed.
ATACAATTTCTTTTGACGGATAATGCCTTTGGCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_57/359‑493 | aTTTCTTTTGACGGATAATGCCTTTGGCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaactt > 1:1774244‑M2/1‑130 (MQ=255) ttCTTTTGACGGATAATGCCTTTGGCATCCACTTCATGGTCTTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttt < 1:763287‑M2/134‑7 (MQ=255) ttCTTTTGACGGATAATGCCTTTGGCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttt < 2:2532014‑M2/134‑7 (MQ=255) cTTTTGACGGATAATGCCTTTGGCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttc < 1:894077‑M2/134‑9 (MQ=255) tttGACGGATAATGCCTTTGGCATCCACTTCATGGTATTTAACTTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctc > 1:2140341‑M2/1‑124 (MQ=255) tttGACGGATAATGCCTTTGGCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCTGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctc > 1:718698‑M2/1‑124 (MQ=255) tttGACGGATAATGCCTTTGGCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGACACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctc > 1:2045733‑M2/1‑124 (MQ=255) tttGACGGATAATGCATTTGGAATCCAATTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctc > 2:1293549‑M2/1‑124 (MQ=255) ttGACGGATAATGCCTTTGGCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCTGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcg < 2:1838276‑M2/135‑13 (MQ=255) gCCTTTGGCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgta > 2:1763986‑M2/1‑111 (MQ=255) ccTTTGGCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtag > 2:1367797‑M2/1‑110 (MQ=255) tttGGCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTATAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcg > 2:288728‑M2/1‑108 (MQ=255) tttGGCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcg > 1:874381‑M2/1‑108 (MQ=255) tttGGCATCCACTTAAGGGTATTTAAATTCAGTGGTACCCGTCGTGATTTTCTGTTGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcg > 1:1345505‑M2/1‑108 (MQ=255) gCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgt < 1:2490073‑M2/135‑32 (MQ=255) gCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgt < 2:1574585‑M2/135‑32 (MQ=255) cATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtg < 2:2155669‑M2/135‑33 (MQ=255) cATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtg < 2:686791‑M2/135‑33 (MQ=255) cATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtg < 2:375358‑M2/135‑33 (MQ=255) cATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtg < 2:361683‑M2/135‑33 (MQ=255) cATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtg < 1:368707‑M2/135‑33 (MQ=255) cATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgacaagaattgtagcgacgtg < 1:1879832‑M2/135‑33 (MQ=255) tCCACTTCATGGTATTTAAATTCCGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgat > 2:892454‑M2/1‑101 (MQ=255) tCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgat > 2:1491807‑M2/1‑101 (MQ=255) tCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgat > 2:1800230‑M2/1‑101 (MQ=255) tCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtga > 2:786825‑M2/1‑101 (MQ=255) tCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgat > 1:1257149‑M2/1‑101 (MQ=255) tCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgat > 1:610067‑M2/1‑101 (MQ=255) cccaCTACTTGGTATTTAAATTCAGTTTTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTCGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgat > 1:1892758‑M2/2‑101 (MQ=255) cACTTCATGGTATTTAATTTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgattt > 2:2112046‑M2/1‑99 (MQ=255) ttCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATCCGGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacg > 1:2394431‑M2/1‑96 (MQ=255) ttCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacg < 1:510663‑M2/135‑40 (MQ=255) ctgGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGTTGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgt > 2:1859303‑M2/2‑93 (MQ=255) aTTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtat < 2:1607558‑M2/134‑47 (MQ=255) tttAAATTCCGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgc > 2:326810‑M2/1‑87 (MQ=255) tttAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgc > 1:675419‑M2/1‑87 (MQ=255) aaaTTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgt < 1:1205547‑M2/135‑52 (MQ=255) aaaTTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgt < 1:152765‑M2/135‑52 (MQ=255) aaTTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgt < 1:2081523‑M2/134‑52 (MQ=255) ttCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttac < 1:18356‑M2/135‑55 (MQ=255) ttGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttactttta < 2:1545788‑M2/135‑60 (MQ=255) ttGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttactttta < 1:824562‑M2/135‑60 (MQ=255) ttGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttactttta < 2:508733‑M2/135‑60 (MQ=255) ttGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttactttta < 1:2430468‑M2/135‑60 (MQ=255) ttaTCCTTCGTGTTTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttatt > 1:1375193‑M2/2‑74 (MQ=255) gTATCCGTCGTTATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttatt > 1:1683692‑M2/1‑74 (MQ=255) gTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgggtatgtcgttacttttat < 2:1417624‑M2/134‑61 (MQ=255) ccGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcct < 1:2221840‑M2/134‑65 (MQ=255) ccGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcct < 2:2488348‑M2/134‑65 (MQ=255) gtcgtGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattactagc < 2:2034721‑M2/135‑68 (MQ=255) tcgtGATTTTCTGATGGCAGATAGTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagct > 1:1492102‑M2/1‑67 (MQ=255) gtGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttc < 2:230909‑M2/135‑71 (MQ=255) gATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGTTGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCtacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgcggttacgtttattcctagctgcgt < 1:1430276‑M2/135‑73 (MQ=255) gATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttctt < 2:169002‑M2/135‑73 (MQ=255) gATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttctt < 2:1211327‑M2/135‑73 (MQ=255) gATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttctt < 1:558447‑M2/135‑73 (MQ=255) gATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttctt < 2:1190523‑M2/135‑73 (MQ=255) gATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgat < 1:2544206‑M2/97‑35 (MQ=255) gATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcc > 1:1722421‑M2/1‑63 (MQ=255) aTTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttg > 2:1746019‑M2/1‑62 (MQ=255) aTTTTATCATTGAATATACTTGTTTACACACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttg > 1:971713‑M2/1‑62 (MQ=255) tAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttcttttta < 2:2195843‑M2/135‑98 (MQ=255) tAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttcttttta < 1:475495‑M2/135‑98 (MQ=255) tAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttcttttta < 2:870105‑M2/135‑98 (MQ=255) tAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttcttttta < 2:109233‑M2/135‑98 (MQ=255) tAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttcttttta < 1:319792‑M2/135‑98 (MQ=255) tAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttcttttt > 2:843000‑M2/1‑38 (MQ=255) tAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacgtttcctcgataagtattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatccagcgctgtaggttcttgtta < 2:2441919‑M2/135‑98 (MQ=255) aGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttaattttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttat < 1:1649106‑M2/135‑99 (MQ=255) aaCGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttattga < 2:2392997‑M2/135‑102 (MQ=255) cgacgaTGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgata > 1:375358‑M2/1‑32 (MQ=255) cgacgaTGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttattgata < 2:457257‑M2/135‑104 (MQ=255) acgaTGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgataga < 1:100769‑M2/135‑106 (MQ=255) acgaTGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgattttcgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttgtttttattgataga < 2:760240‑M2/135‑106 (MQ=255) gaTGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttcttgatagaga < 2:2078500‑M2/135‑108 (MQ=255) gaTGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttattgatagaga < 1:1050537‑M2/135‑108 (MQ=255) aTGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagaga < 1:1308822‑M2/134‑108 (MQ=255) aTGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagaga < 2:112617‑M2/134‑108 (MQ=255) aTGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttcttgttattgatagaga < 1:1093457‑M2/134‑108 (MQ=255) aTGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttattgatagaga < 2:125136‑M2/134‑108 (MQ=255) aTGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttattgatagaga < 2:1013711‑M2/134‑108 (MQ=255) ggATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaac > 1:642328‑M2/1‑25 (MQ=255) ggATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaac > 1:568283‑M2/1‑25 (MQ=255) ggATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttattgatagagaaac > 2:1900669‑M2/1‑25 (MQ=255) gATCCGATTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaaccc > 2:1057007‑M2/1‑24 (MQ=255) tCCGATTTTTGGCTACTGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttattgatagagaaaccg > 1:1556703‑M2/1‑22 (MQ=255) aTTTTTGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaacccgcggtt > 2:2276085‑M2/1‑18 (MQ=255) tttGGCTACTGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaacccgcggtgtct < 1:1951416‑M2/135‑121 (MQ=255) tGCTCCgacttgtcctcgatcagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaacccgcggtttcttagttcatt > 1:265521‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaacccgcggtttcttagttcatt > 2:965247‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaacccgcggtttcttagttcatt > 2:632226‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaacccgcggtttcttagttcatt > 1:2287490‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaacccgcggtttcttagttcatt > 2:1308777‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCgacttgtcctcgataagaattgtagcgccgtgatttacgtgtgtatgtcgttacttttattcctagcttcttgatcaggcgctgaactttctttttattgatagagaacccgcggtttcttagttcatt > 2:2333923‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCaacttttcctcgataataattgtagcgacgtgatttacgattgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttattgatagagaaaccgcggtttcttagttcatt > 2:924779‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttattgatagagaaaccgcggtttcttagttcatt > 2:589178‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttattgatagagaaaccgcggtttcttagttcatt > 2:260728‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgaactttctttttattgatagagaaaccgcggtttcttagttcatt > 1:1141600‑M2/1‑6 (MQ=255) tGCTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagctacttgatcaagcgctgaactttctttttattgatagagaaaccgcggtttcttagttcatt > 2:1965363‑M2/1‑6 (MQ=255) cTCCaacttttcctcgataagaattgtagcgacgtgatttacgcgtgtatgccgttacttttattcctagcttcttgatcaagcgctgacctttctgtttattgatagagaaaccgcggtttcttagttcattg < 1:1701275‑M2/134‑131 (MQ=255) | ATACAATTTCTTTTGACGGATAATGCCTTTGGCATCCACTTCATGGTATTTAAATTCAGTTGTATCCGTCGTGATTTTCTGATGGCAGATACTGGTGTAGAAACGACGATGGATCCGATTTTTGGCTACTGCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_57/359‑493 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |