| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AssemblyC74_contig_32 | = 3311 | 0 (0.000) | 286 (0.760) | 75/258 | 0.4 | 100% | intergenic (+202/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
| ? | AssemblyC74_contig_53 | = 622 | 0 (0.000) | coding (1/498 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | Mobile element protein | |||||
Only 100 of 537 total aligned reads displayed.
CTTTTGCCACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_53/489‑622 | cTTTTGCCACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGa > 1:1004649/1‑134 (MQ=255) ttGCCACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgac < 2:2528631‑M2/134‑4 (MQ=255) ccGCCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactact > 1:370727‑M2/1‑128 (MQ=255) aCCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttt < 1:1116456‑M2/135‑10 (MQ=255) aCCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttt < 1:1249958‑M2/135‑10 (MQ=255) aCCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttt < 2:494690‑M2/135‑10 (MQ=255) caaGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaa > 1:1520606‑M2/1‑117 (MQ=255) aGCCTTCCCCACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaa > 2:2442822‑M2/1‑115 (MQ=255) aGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTACCCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaaaa > 1:310871‑M2/1‑115 (MQ=255) aGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaa > 1:2262990‑M2/1‑115 (MQ=255) 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cAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaacaaatgtatatttccgcaaaaaaagcaccccttttaattagatttc < 2:1439774‑M2/135‑67 (MQ=255) aGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaacaaatgtatatttccgcaaaaaaagcaccccttttaattagatttct < 1:1971884‑M2/135‑68 (MQ=255) aGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaacaaatgaatatttcctcaaaaaaagcaccccttttaattagatttct < 1:2564191‑M2/135‑68 (MQ=255) aGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaaaacaaatgtatatttccgcaaaaaaatcaccccttttaattagatttct < 2:2268600‑M2/135‑68 (MQ=255) aGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaaaacaaatgtatatttccgcaaaaaaagcaccccttttaattagatttct < 1:1309877‑M2/135‑68 (MQ=255) aGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTACGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaaaacaaatgtatatttccgcaaaaaaagcaccccttttaattagatttct < 2:1523111‑M2/135‑68 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CTTTTGCCACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_53/489‑622 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |