| New junction evidence | |||||||||||
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AATGCTGAAGCCGTTAGTTCATATTCTCGAATGATTTCTACACGTGGCTTTCCAGCTAAGTAAAGATTGACGATTTGTTGCTTGAATTCTTGTGAAAAAGTTCTTCGTGTTCTCTTAGACATAAAAATTCCTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_42/1109‑1243 | aaTGCTGAAGCCGTTAGTTCATATTCTCGAATGATTTCTACACGTGGCTTTCCAGCTAAGTAAAGATTGACGATTTGTTGCTTGAATTCTTGTGAAAAAGTTCTTCGTGTTCTCTTAGACATAAAAATTcctcct < 2:1844496/135‑1 (MQ=255)aaTGCTGAAGCCGTTAGTTCATATTCTCGAATGATTTCTACACGTGGCTTTCCAGCTAAGTAAAGATTGACGATTTGTTGCTTGAATTCTTGTGAAAAAGTTCTTCGTGTCCTCTTAGACATAAAAATTcctcct < 1:2334814/135‑1 (MQ=255) gCTGAAGCCGTTAGTTCATATTCTCGAATGATTTCTACACGTGGCTTTCCAGCTAAGTAAAGATTGACGATTTGTTGCTTGAATTCTTGTGAAAAAGTTCTTCGTGTTCTCTTAGACATAAAAATTCCTCCTggt < 1:2104654‑M2/135‑4 (MQ=255) gAAGCCGTTAGTTCATATTCTCGAATGATTTCTACACGTGGCTTTCCAGCTAAGTAAAGATTGACGATTTGTTGCTTGAATTCTTGTGAAAAAGTTCTTCGTGTTCTCTTAGACATAAAAATTCCTCCTggtat > 2:829819‑M2/1‑129 (MQ=255) 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AATGCTGAAGCCGTTAGTTCATATTCTCGAATGATTTCTACACGTGGCTTTCCAGCTAAGTAAAGATTGACGATTTGTTGCTTGAATTCTTGTGAAAAAGTTCTTCGTGTTCTCTTAGACATAAAAATTCCTCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_42/1109‑1243 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |