| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
CTTAATGCTATAAATTCATAATAACATTATGGACAATAAATTTAAAATTTATTCAGACTGTAGACAAACTCCTAAATTTAGAGTGTTGTTTGCAGTCTGACGACTCAAAAATGAGTCGTATAAATCAATTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_46/752‑883 | cTTAATGCTATAAATTCATAATAACATTATGGACAATAAATTTAAAATTTATTCAGACTGTAGACAACCTCCTAAATTTAGAGTGTTGTTTGCAGTCTGACGACTCAAAAATGAGTCGTATAAATCAATTATagt > 1:811280‑M2/1‑132 (MQ=255)cTTAATGCTATAAATTCATAATAACATTATGGACAATAAATTTAAAATTTATTCAGACTGTAGACAAACTCCTAAATTTAGTGTGTTGTTTGCAGTCTGACGACTCAAAAATGAGTCGTTTAAATCAATTATagt < 2:1946578‑M2/135‑4 (MQ=255)cTTAATGCTATAAATTCATAATAACATTATGGACAATAAATTTAAAATTTATTCAGACTGTAGACAAACTCCTAAATTTAGAGTGTTGTTTGCAGTCTGACGACTCAAAAATGAGTCGTATAAATCAATTATagt < 1:1886800‑M2/135‑4 (MQ=255)cTTAATGCTATAAATTCATAATAACATTATGGACAATAAATTTAAAATTTATTCAGACTGTAGACAAACTCCTAAATTTAGAGTGTTGTTTGCAGTCTGACGACTCAAAAATGAGTCGTATAAATCAATTATagt > 2:1650795‑M2/1‑132 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(MQ=255) aaTCAATTATagtaataagtcattgatttctttaaattcattatcaagttcttttacatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaatagcctttcgtacaactaccccttt > 1:222113‑M2/1‑10 (MQ=255) aTCAATTATagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaatagcctttcgttcaactaaccatttt > 1:953172‑M2/1‑9 (MQ=255) aaTTATagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaatagcctttcgttcaactaaccattttttt < 1:1657827‑M2/135‑130 (MQ=255) tagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgtatagcctttcgttcaactaaccatttttttaggtt < 1:757064‑M2/135‑135 (MQ=255) tagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaatagcctttcgttcaactaaccatttttttaggtt < 1:1215821‑M2/135‑135 (MQ=255) tagtaataagtcattgatttctttaaattctttatcaagttctttttcatcatatttttcatatttatcagcttcatgaagaacttttttaatttcatgaatagcctttcgttcaactaaccatttttttaggtt < 2:836421‑M2/135‑135 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CTTAATGCTATAAATTCATAATAACATTATGGACAATAAATTTAAAATTTATTCAGACTGTAGACAAACTCCTAAATTTAGAGTGTTGTTTGCAGTCTGACGACTCAAAAATGAGTCGTATAAATCAATTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_46/752‑883 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |