| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 660 total aligned reads displayed.
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ataAATTTAACCACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGTGAGCTCCTGCTTTGCACGCTGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGTCTCCTTTTCATTTAAATATTGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCt < 1:25044/135‑1 (MQ=255) ataAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCt < 1:1677541/135‑1 (MQ=255) aaTTTAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagta > 1:1065002‑M2/1‑85 (MQ=255) aaTTTAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagta > 2:2220957‑M2/1‑85 (MQ=255) aaTTTAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagta > 1:2044844‑M2/1‑85 (MQ=255) aTTTAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaa < 1:1331672‑M2/135‑52 (MQ=255) aTTTAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagta > 2:1645871‑M2/1‑84 (MQ=255) tttAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGc < 1:482065/135‑1 (MQ=255) tttAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGc < 1:1356506/135‑1 (MQ=255) tttAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCGGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGc < 2:1347175/135‑1 (MQ=255) tttAAA‑ACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTaacaacattagttgttaaatttgttcattgaaaactggatatttgaagtaaa > 2:1951730‑M2/1‑83 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATTAAACGGGAAGTAGCTCAGCTTGGTAGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTAGGCTCCATTTCATTTAAATAATGAATATCTTTTTCGCGGTGTAGCTCAGCTGGCTAGAGCG > AssemblyC74_contig_63/1‑228 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |