| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_47 | 452 = | NA (NA) | 202 (0.880) +TACACTCGTTAAAGAGCCACAGCCATAAAACATA |
59/190 | 0.1 | NA | noncoding (7/29 nt) | direct | CRISPR repeat with sequence actatcgatgtaagtaattgggatacgtc |
| ? | AssemblyC74_contig_47 | = 882 | NA (NA) | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
CTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_47/750‑882 | ctTTAACGAGTGTAGATGTAAGTTCTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAt > 1:1789893‑M2/1‑133 (MQ=255) aaCGTGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGACGGTTACTTATCTGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATAGATGTCAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgtt > 1:2203224‑M2/1‑129 (MQ=255) aaCGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgtt > 2:1791333‑M2/1‑129 (MQ=255) tAGATGTTACTAAATGGGATACGTCGAAGGTTTCTTCTATGCCTGCTATGTTTGCAGGTGATTAATATAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggct > 1:2140181‑M2/1‑121 (MQ=255) tAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggct > 1:556241‑M2/1‑121 (MQ=255) tAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggct > 2:2475544‑M2/1‑121 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgt > 1:650295‑M2/1‑119 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTAGCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgt < 2:462553‑M2/135‑17 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTAATACTGCTATCAGTGCAGGCGATAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGTCTGAtatgttttgtggctgt < 1:1700138‑M2/135‑17 (MQ=255) aaTTGGGATACTTCGAAGGTTACTACAATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATATAACACTAACGATGAAATTAATTGGGATACGACGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggatttggcaattt < 2:982864‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctttggctcttt < 1:1665803‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:1345237‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:2404697‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:2420‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:1647040‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:2284537‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:1157498‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctta < 2:535342‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggc > 2:1891811‑M2/1‑110 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggc < 1:1891811‑M2/129‑20 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTAGCAGGGGTTAAATCTAAAACTAACGATGTAAGTAATATGGATACGTCGAAGTTTAATTATATGACTGAtattttttatgtctgtggctcttta < 1:1036247‑M2/135‑26 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACGTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTTAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:2564383‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTAGGGATACGTCTAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:2127907‑M2/134‑25 (MQ=255) agtggGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:859917‑M2/3‑109 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:1308224‑M2/1‑109 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:2362786‑M2/1‑109 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 1:1718008‑M2/1‑109 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:1814594‑M2/1‑109 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:1345212‑M2/1‑109 (MQ=255) tGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacg > 1:2306950‑M2/1‑107 (MQ=255) gggATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacga > 2:688982‑M2/1‑106 (MQ=255) gTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaga > 2:2069024‑M2/1‑99 (MQ=255) gAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgt < 2:1141309‑M2/135‑40 (MQ=255) aGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaa < 2:2084362‑M2/135‑42 (MQ=255) ggTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaag > 1:280170‑M2/1‑93 (MQ=255) ttCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattg > 2:1608569‑M2/1‑87 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgg < 2:774080‑M2/135‑50 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgg < 1:1484190‑M2/135‑50 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctatggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgg < 2:1414932‑M2/135‑50 (MQ=255) tGACTGCTATGTGTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggata > 2:2491839‑M2/1‑82 (MQ=255) cTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt < 1:600208‑M2/135‑57 (MQ=255) cTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt < 1:2442996‑M2/135‑57 (MQ=255) cTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt < 2:1051715‑M2/135‑57 (MQ=255) cTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt < 2:1353991‑M2/135‑57 (MQ=255) tGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTTCTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt > 2:376022‑M2/1‑78 (MQ=255) tGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgt > 1:2419915‑M2/1‑78 (MQ=255) aTGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaat > 1:997552‑M2/1‑74 (MQ=255) aTGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtctagatgtaagtaattggcatacgtcaaat < 2:1582221‑M2/135‑62 (MQ=255) aTGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGAATAAtatgttttatgtatgtggctctttaacgatagtagatgtaagtaattgggatacgtcaaat < 1:247849‑M2/135‑62 (MQ=255) gTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:18355‑M2/96‑25 (MQ=255) gTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 1:18355‑M2/1‑72 (MQ=255) ttGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgtta < 2:9272‑M2/135‑66 (MQ=255) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaat < 2:744729‑M2/135‑71 (MQ=255) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaa > 1:382584‑M2/1‑65 (MQ=255) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaa > 1:1330316‑M2/1‑65 (MQ=255) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagaaattgggatacgtcaaatgttacgaat < 1:253898‑M2/135‑71 (MQ=255) tAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATCGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggcggtggctcgttaacgagggtagatgtaagtaattgggatacgtcaagtgttacgaatatgag < 1:2069246‑M2/135‑76 (MQ=255) aaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgactt > 2:300914‑M2/1‑58 (MQ=255) ttcGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatga > 2:2069876‑M2/2‑47 (MQ=255) aTGTAAGTTATTGGGATACGTCGAAGGTTTCTTATCTGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttatatgttttatggct > 1:615283‑M2/1‑43 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGTtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttat < 1:2357264‑M2/131‑89 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttactaatatgacttctatgttttatgggt < 1:758773‑M2/135‑93 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggct > 1:1044832‑M2/1‑43 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggct > 2:2337010‑M2/1‑43 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttat < 2:2033643‑M2/131‑89 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttatatgttttat < 2:1227381‑M2/131‑89 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaa > 1:1389887‑M2/1‑43 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtggagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgactactatgttttatggcg < 1:2368503‑M2/135‑93 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:75014‑M2/1‑35 (MQ=255) aTTGGGATCCGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctct > 1:1868211‑M2/1‑34 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtatgtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 2:1439293‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:9272‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:2404697‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:853856‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:1637486‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 2:2197617‑M2/1‑33 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaac < 2:1719723‑M2/135‑106 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 1:1195040‑M2/1‑30 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:1195040‑M2/54‑25 (MQ=255) aTACGTCGAAGCTTTCTTATATGAATGAtttgatttatggctgtggatcttaaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacg > 2:1470985‑M2/1‑28 (MQ=255) tACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacga > 2:827503‑M2/1‑27 (MQ=255) tACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacga > 1:744729‑M2/1‑27 (MQ=255) cGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtg < 1:2036510‑M2/135‑111 (MQ=255) tCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgta > 2:1679517‑M2/1‑23 (MQ=255) gTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaactgttacgaatatgtcttctatgttttatggcggtggctctttatcgagtgtagatgta < 2:912966‑M2/135‑119 (MQ=255) gTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgta < 1:2240576‑M2/135‑119 (MQ=255) aCTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagt > 1:1118746‑M2/1‑14 (MQ=255) tataTGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaat < 1:882226‑M2/135‑125 (MQ=255) tataTGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaat < 1:1248008‑M2/135‑125 (MQ=255) tataTGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaat < 2:1110628‑M2/135‑125 (MQ=255) atatGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtttagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaatt > 1:1736288‑M2/1‑10 (MQ=255) atatGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaatt < 1:160715‑M2/135‑126 (MQ=255) tatGTCTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattg > 1:531697‑M2/1‑9 (MQ=255) tatGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattg > 1:402620‑M2/1‑9 (MQ=255) tatGACTGAtatgttttatggctatggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattg > 1:1414932‑M2/1‑9 (MQ=255) tatGACTGAtaggttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattg > 1:1577946‑M2/1‑9 (MQ=255) atGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgg > 2:1913824‑M2/1‑8 (MQ=255) atGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgg > 2:1873449‑M2/1‑8 (MQ=255) aCTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattggga < 1:2502255‑M2/134‑130 (MQ=255) tGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatac > 1:462553‑M2/1‑3 (MQ=255) | CTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_47/750‑882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |