| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_50 | = 745 | 0 (0.000) | 212 (0.670) | 74/258 | 0.2 | 100% | intergenic (+8/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Aggregation promoting factor/– |
| ? | AssemblyC74_contig_9 | = 104617 | 0 (0.000) | intergenic (+75/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity/– | Putative deoxyribonuclease YcfH/– | |||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
GAAGAAGTTAAAAAAAATACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_9/104483‑104617 | gaagaaGTTAAAAAAAATACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCAGTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTGTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATa > 1:2474795/1‑135 (MQ=255) aagcagTTAAAAAAAATACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAa > 2:294514‑M2/1‑134 (MQ=255) aagaatTTAAAAAAAATACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCATTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAa > 2:2037001‑M2/1‑134 (MQ=255) aagaagTTAAAAATAATACTTATCAAAACTTTGAACGTTTCATTAGATTATGTAAATAAAAATGACATGTGACACAACTAGTGTCTCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAa > 2:518626‑M2/1‑134 (MQ=255) aagaagTTAAAAAAAATACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAa > 2:1251290‑M2/1‑134 (MQ=255) aagaagTTAAAAAAAATACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAa > 2:2354555‑M2/1‑134 (MQ=255) aagaagTTAAAAAAAATACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAa > 2:2522138‑M2/1‑134 (MQ=255) aagaagTTAAAAAAAATACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAa > 2:1344303‑M2/1‑134 (MQ=255) aagaagTTAAAAAAAATACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAa > 1:797915‑M2/1‑134 (MQ=255) aagaagTTAAAAAAAATACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACGAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAa > 1:1994549‑M2/1‑134 (MQ=255) aagaagTTAAAAAAAATACTGATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAACGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAa > 1:1581278‑M2/1‑134 (MQ=255) agaagTTAAAAAAAATACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaa < 2:2160895‑M2/135‑3 (MQ=255) gaagTTAAAAAAAATACTTATCAAAACTTGGCACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCAGCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAACAGTAAACTGTTTGATTAATAa > 2:1287014‑M2/1‑132 (MQ=255) gttaaaaaaatacTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaat > 1:595073‑M2/4‑128 (MQ=255) aaaaaaaaTACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaat > 1:1512579‑M2/1‑126 (MQ=255) aaaaaaaaTACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaat > 2:179383‑M2/1‑126 (MQ=255) aaaaaaTACTTATCAAAACTTGGAACTTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatctta < 2:1307142‑M2/135‑12 (MQ=255) aaaTACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCAGTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCGTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagt < 1:2173983‑M2/134‑14 (MQ=255) cTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaac > 1:1814451‑M2/1‑116 (MQ=255) cAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgttt > 1:708415‑M2/1‑111 (MQ=255) cAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgttt > 1:1098871‑M2/1‑111 (MQ=255) aaaaCTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtt < 1:2331408‑M2/133‑24 (MQ=255) aaaaCTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAa < 1:136264‑M2/111‑2 (MQ=255) aaCTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgct > 2:708059‑M2/1‑108 (MQ=255) ttGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcc < 2:1728078‑M2/135‑31 (MQ=255) ttGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcc < 1:848479‑M2/135‑31 (MQ=255) tGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttccc > 2:2011282‑M2/1‑104 (MQ=255) cATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgcttt < 2:934252‑M2/135‑42 (MQ=255) cATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgcttt > 1:2038353‑M2/1‑94 (MQ=255) cATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgcttt < 2:684812‑M2/135‑42 (MQ=255) attagattagGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAa > 2:1578511‑M2/1‑93 (MQ=255) ttagattagGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttc < 1:754030‑M2/134‑43 (MQ=255) tagattagGTAAATAAAAAAGAGAGGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAactgaatcttagtaccaaccgattgcttcccagaatgctttcgc > 1:947702‑M2/1‑91 (MQ=255) tagGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgctt > 1:2099884‑M2/1‑86 (MQ=255) tagGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgctt > 2:1989488‑M2/1‑86 (MQ=255) agGTAAATAAAAAAGAGATGAGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccttttgcttcccagaatgctttcgccgctt < 2:1071516‑M2/134‑50 (MQ=255) aaataaaAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaa < 2:575868‑M2/135‑55 (MQ=255) aaataaaAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttccc > 2:185661‑M2/1‑81 (MQ=255) aataaaAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTTGCTTTATTTGTAAAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaag < 1:1909218‑M2/135‑56 (MQ=255) aaaaaGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgtatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaac > 1:542791‑M2/1‑76 (MQ=255) aaaaaGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaacc < 1:953226‑M2/135‑60 (MQ=255) aaaaGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaacca < 1:1222777‑M2/135‑61 (MQ=255) aaGAGATGTGACACAACTAGTGTCGAACATCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccata > 2:662146‑M2/1‑73 (MQ=255) gagaTGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataac > 1:1874754‑M2/1‑71 (MQ=255) gagaTGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataac > 2:858049‑M2/1‑71 (MQ=255) gagaTGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataac > 1:1769033‑M2/1‑71 (MQ=255) aTGTGACAAAAATAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcgtagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgcctcttcccaagaaccataacgt > 1:1038274‑M2/1‑68 (MQ=255) gtgACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaa > 1:427387‑M2/1‑66 (MQ=255) gtgACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaa > 1:250394‑M2/1‑66 (MQ=255) gtgACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaa > 1:100107‑M2/1‑66 (MQ=255) gtgACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaa > 2:2418903‑M2/1‑66 (MQ=255) gtgACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaa > 2:2458492‑M2/1‑66 (MQ=255) gtgACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtg > 2:1626716‑M2/1‑66 (MQ=255) tgACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaag < 1:2058784‑M2/135‑71 (MQ=255) acacAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccatcacgtgaagta > 2:2215389‑M2/1‑63 (MQ=255) acacAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagt < 1:2238000‑M2/134‑72 (MQ=255) cacaACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTAGTATAAAAGTAAACGGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaa < 2:2294730‑M2/135‑74 (MQ=255) acaACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaac > 1:2301934‑M2/1‑61 (MQ=255) aCTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacata > 1:918226‑M2/1‑58 (MQ=255) gtgtCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattg < 2:2338948‑M2/134‑81 (MQ=255) gtgtCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttccca > 2:1166967‑M2/1‑54 (MQ=255) gtgtCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttccca < 1:1166967‑M2/86‑33 (MQ=255) tCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttct > 1:1366762‑M2/1‑51 (MQ=255) cGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttc < 2:1277340‑M2/133‑84 (MQ=255) gCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctg > 1:1783055‑M2/1‑49 (MQ=255) gCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctg > 1:1864166‑M2/1‑49 (MQ=255) cACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgct > 2:754030‑M2/1‑48 (MQ=255) cACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgc < 2:1765753‑M2/134‑87 (MQ=255) ccTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgcta < 1:1610618‑M2/134‑89 (MQ=255) ccTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgcta < 1:970273‑M2/134‑89 (MQ=255) ccTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgcta < 2:1556088‑M2/134‑89 (MQ=255) ccTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgcta < 1:1163462‑M2/134‑89 (MQ=255) tctTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactc < 2:167577‑M2/135‑92 (MQ=255) tttttGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctt > 1:2457907‑M2/1‑42 (MQ=255) tttGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttccaataatgctttcgccgcttcccaagaaccataacttgaagtaacatattgttctgctactctttc < 1:1589964‑M2/135‑96 (MQ=255) tGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttctt > 1:1691322‑M2/1‑38 (MQ=255) ggCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttg > 1:1556088‑M2/1‑37 (MQ=255) tttctttGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggt > 1:477791‑M2/1‑34 (MQ=255) tttctttGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggt > 2:953226‑M2/1‑34 (MQ=255) tctttGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttg > 1:1303647‑M2/1‑32 (MQ=255) tctttGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttg < 1:305859‑M2/135‑104 (MQ=255) ctttGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgc > 1:521059‑M2/1‑31 (MQ=255) tttGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccatagcgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgca > 2:1429057‑M2/1‑30 (MQ=255) ttGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcag < 1:2291839‑M2/135‑107 (MQ=255) ttGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtg < 2:1222515‑M2/96‑68 (MQ=255) aaaaGTAAACTGTTTGATTAATAtatgaatcttagttccaaccgtttgcttcccagaattctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagttacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagt > 1:1314524‑M2/1‑23 (MQ=255) aaaaGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagt < 2:458373‑M2/135‑113 (MQ=255) aaaaGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagt > 2:737345‑M2/1‑23 (MQ=255) aaaaGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagt > 1:681303‑M2/1‑23 (MQ=255) aaaaGTAAACTGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagt < 2:1175788‑M2/135‑113 (MQ=255) tGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagtagtcaccatt < 1:189853‑M2/135‑123 (MQ=255) tGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagtagtcaccatt < 2:525461‑M2/135‑123 (MQ=255) tGTTTGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagtagtcaccatt < 1:342883‑M2/135‑123 (MQ=255) tttGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagtagtcaccattta > 2:2331408‑M2/1‑11 (MQ=255) tttGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagtagtcaccattta > 2:826215‑M2/1‑11 (MQ=255) tttGATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagtagtcaccattta > 2:1478122‑M2/1‑11 (MQ=255) gATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagtagtcaccatttaagt > 1:2184945‑M2/1‑8 (MQ=255) gATTAATAaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagtagtcaccatttaagt < 1:557948‑M2/135‑128 (MQ=255) taaatgaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagtagtcaccatttaagtaagaag > 2:555752‑M2/1‑2 (MQ=255) taaaagaatcttagtaccaaccgtttgcttcccagaatgctttcgccgcttcccaagaaccataacgtgaagtaacatattgttctgctactctttcttggtttgcagcagagtagtcaccatttaagtaagaag > 1:1438899‑M2/1‑2 (MQ=255) | GAAGAAGTTAAAAAAAATACTTATCAAAACTTGGAACGTTTCATTAGATTAGGTAAATAAAAAAGAGATGTGACACAACTAGTGTCGCACCTCTTTTTGGCTTTCTTTGTATAAAAGTAAACTGTTTGATTAATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_9/104483‑104617 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |