New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 566 total aligned reads displayed.
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ttggaacgtgccgtttttcagatccTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGACCATTGATTTCTACTCCAATCAAAGCCGCATTTTCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCACTATTTCCTACCACATAAgg > 1:2000004‑M2/26‑135 (MQ=255) cgtgccgtttttcagatccTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGACCATTGATTTCTACTCCAATCAAAGCCGCATTTTCATACGTCAGTGTTCCCGTAATcc < 1:1545959‑M2/85‑1 (MQ=255) cgtttttcagatccTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGAcc < 1:2474655‑M2/29‑1 (MQ=255) cgtttttcagatccTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGACCATTGATTTCTACTCCAATCAAAGCCGCATTTTCATACGTCATTGTTCCCGTAATCCATTCGCTACTTc < 2:396327‑M2/97‑1 (MQ=255) cgtttttcagatccTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGACCATTGATTTCTACTCCAATCAAAGCCGCATTTTCATACGTCAGTGTTCCCGTAAt > 2:429031‑M2/15‑97 (MQ=255) cgtttttcagatccTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGACCATTGATTTCTACTCCAATCAAAGCCGCATTTTCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCACTATTTCCTACCACATAAGGATCTACTTTCg > 1:1444683‑M2/15‑135 (MQ=255) cgtttttcagatccTCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGACCATTGATTTCTACTCCAATCAAAGCCGCAATTTCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCGCTACTTc > 1:396327‑M2/15‑111 (MQ=255) cgtttttcagatcATCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGTCCATTTATTTCTACTCCAATCAAAGCCGCATTTTCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCACTATTTCCTACCACATAAGGATTTACTTTCg > 1:245589‑M2/14‑135 (MQ=255) cgtttttcagatcATCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGACCATTGATTTCTACTCCAATCAAAGCCGCATTTTCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCACTATTTc > 2:1922924‑M2/14‑111 (MQ=255) cgtttttcagatcATCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGACCATTGATTTCTACTCCAATCAAAGCCGCATTTTCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCACTATTTCCTACCACATAAGGATTTAGTTTCg > 2:1011831‑M2/14‑135 (MQ=255) cgtttttcagatcATCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGACCATTGATTTCTACTCCAATCAAAGCCGCATTTTCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCACTATTTCCTACCACATAAGGATTTACTTTCg > 2:2065409‑M2/14‑135 (MQ=255) cgtttttcagatcATCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGACCATTGATTTCTACTCCAATCAAAGCCGCATTTTCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCACTATTTCCTACCACATAAGGATTTACTTTCg > 2:2285574‑M2/14‑135 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCACTAGGAACGATGGCTTGTACTTGACCATTGATTTCTACTCCAATCAAAGCCGCATTTTCATACGTCAGTGTTCCCGTAATCCATTCACTATTTCCTACCACATAAGGATTTACTTTCGTGATTTCATCTTTT > AssemblyC74_contig_65/1‑136 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |