| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_11 | 1 = | 0 (0.000) | 293 (0.370) | 102/256 | 0.0 | 100% | intergenic (–/‑1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Alcohol dehydrogenase (EC 1.1.1.1) |
| ? | AssemblyC74_contig_45 | = 1002 | 0 (0.000) | intergenic (‑96/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Integrase, catalytic region/– | |||||
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
ACGAGAATTTTACTTTTATGTTTCCTCCATCTGTAATATTCGTTGGGTCCACGGTCAACGAAGTGACATTACTGCTGATATCTCTGCCTGCATCCGCATAGACATGAACAGGAATCAGTGATGTTATATTAGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_11/134‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCCGTTTGTATAATTAAGCGAGACAAATAAAAAAGCCATTTATGTTACACTCAAATTGTAATACCCGCTAAAGCATACAAGGAGAGTGAACATAAATGACTTATACCCATCTTACACCAAACGAGCTTGTAAT < AssemblyC74_contig_45/1002‑869 GAGAATTTTACTTTTATGTTTCCTCCATCTGTAATATTCGTTGGGTCCACGGTCAACGAAGTGACATTACTGCTGATATCTCTGCCTGCATCCGCATAGACATGAACAGGAATCAGTGATGTTATATTAGTACGC < 1:2127052/135‑1 TTTTACTTTTATGTTTCCTCCATCTGTAATATTCGTTGGGTCCACGGTCAACGAAGTGACATTACTGCTGATATCTCTGCCTGCATCCGCATAGACATGAACAGGAATCAGTGATGTTATATTAGTACGCCGTTT < 1:580084/135‑1 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ACGAGAATTTTACTTTTATGTTTCCTCCATCTGTAATATTCGTTGGGTCCACGGTCAACGAAGTGACATTACTGCTGATATCTCTGCCTGCATCCGCATAGACATGAACAGGAATCAGTGATGTTATATTAGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_11/134‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCCGTTTGTATAATTAAGCGAGACAAATAAAAAAGCCATTTATGTTACACTCAAATTGTAATACCCGCTAAAGCATACAAGGAGAGTGAACATAAATGACTTATACCCATCTTACACCAAACGAGCTTGTAAT < AssemblyC74_contig_45/1002‑869 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |