New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_17 | 1 = | 0 (0.000) | 252 (0.610) | 70/256 | 0.7 | 100% | intergenic (–/‑262) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Protein of unknown function DUF421 |
? | AssemblyC74_contig_57 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Mobile element protein |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
TTAGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_17/133‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTTCCCT > AssemblyC74_contig_57/1‑134 ttcGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTA < 2:2782204/132‑1 AGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTA < 2:155905/133‑1 AGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTA < 2:274058/133‑1 AGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTA < 2:366483/133‑1 AGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTA < 2:466726/133‑1 AGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTA < 1:733156/133‑1 AGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTA < 2:1382420/133‑1 AGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTA < 1:1260368/133‑1 ACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGT > 2:2152409/1‑135 ACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGT > 2:2495725/1‑135 ACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATAGTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAACTTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGT > 1:1693572/1‑135 TTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTACAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGACATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTA < 2:1758554/134‑1 TTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAG < 2:931906/135‑1 TTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTA < 1:1122663/134‑1 TTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTA < 1:896968/134‑1 TTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTA < 1:1894510/134‑1 TTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGT < 2:1577077/133‑1 TTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAAT < 1:410512/135‑1 TGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATA < 1:1083431/135‑1 TGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATA < 2:2440325/135‑1 TGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATA < 1:1829561/135‑1 GGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAG < 2:1460767/135‑1 GGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAG < 1:1646370/135‑1 GGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAG < 2:672714/135‑1 TGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATA < 1:1997753/134‑1 TGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATA < 1:2206790/134‑1 CCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGA < 2:209404/135‑1 CCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGA < 2:1973564/135‑1 TCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGAT > 1:521915/1‑132 CTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTTGACGAGACGTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCCTTATTGTAGTAATAGATATAGAGATCGATGGCTG > 1:1870238/1‑135 CTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTG > 1:318529/1‑135 CTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTG > 2:2293972/1‑135 CTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTG > 1:2780495/1‑135 TTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGA > 1:2662069/1‑135 TTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGA > 1:1432919/1‑135 TTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGA > 1:1747063/1‑135 TTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAAT > 2:545211/1‑111 TTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTT < 2:161052/135‑1 TTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTT < 2:427304/135‑1 TTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTT < 2:1842094/135‑1 TTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTA < 2:1666536/135‑1 TTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGGTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTA > 1:274227/1‑135 TCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTC > 1:196807/1‑135 CTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 2:2581977/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 1:1376294/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 1:1485302/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 2:2219729/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 1:778349/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 2:52685/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 1:467613/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 1:2280067/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTAAGAAATTGGAAGAGACTTTGCCATTTTAATTTCTGTTTTATACGTTCATTATTGTAGTATTAGATATAGCTTTCGATGGCTGATTTTAATTCCTCt < 2:1408191/135‑2 AATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAAC > 1:584144/1‑135 ATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACA < 1:664142/135‑1 TTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATA > 1:1308491/1‑135 TTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATA > 2:873642/1‑134 TTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAA > 2:614857/1‑135 TTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAA > 2:1900348/1‑135 TTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAA > 1:1007049/1‑135 TTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTA < 2:2889188/65‑1 GGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAAT < 2:831096/135‑1 GGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAAT < 1:1010550/135‑1 TTTACGAACTTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTG > 2:1202466/1‑135 TTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTGTTG > 2:1323938/1‑135 TTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGT > 1:2847008/1‑135 TTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGT > 2:1647047/1‑135 TTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAAT > 2:1057471/1‑128 CGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTT > 2:1139295/1‑135 AATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAAT > 1:989350/1‑135 GACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATAAAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCa > 2:1522411/1‑134 TTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAA > 2:1228767/1‑134 TTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAA > 2:2442518/1‑134 TTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAA > 1:56100/1‑134 TTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATT < 1:1202466/135‑1 CCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTC < 1:2495725/135‑1 CAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCTAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAAATTCTC > 2:272613/1‑135 CAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCC > 1:117225/1‑135 CAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCC > 2:2539935/1‑135 CAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCC > 1:2331109/1‑135 CAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCC > 1:2555816/1‑135 CAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTA < 2:2846470/35‑1 AGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCA > 2:1119292/1‑135 AGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCC < 1:1510551/134‑1 TAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTATTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAG < 2:3194/135‑1 TAATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAG < 1:2058811/135‑1 AATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAATTCTCTTGTTTTTATTAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGT > 2:2820167/1‑135 AATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGT > 1:869996/1‑135 ATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTG < 1:2152409/135‑1 ATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTG < 2:1724408/135‑1 ATTTCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTG < 1:763885/135‑1 TCTGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAAGTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCNGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATNAGTGAAT < 1:1554155/135‑1 TGTTTTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTA < 1:1666202/135‑1 TTATCCGTTCATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTA > 1:2778962/1‑135 CATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTT > 1:1837762/1‑133 CATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTT > 1:941636/1‑133 CATTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTGAAT > 1:1732601/1‑120 TTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTTCCCT > 2:2658820/1‑135 TTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTTCCCT < 1:2876585/135‑1 TTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTTCCCT > 2:2248960/1‑135 TTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTTCCCT > 2:1947963/1‑135 TTAGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTTTATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACCGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGAGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_17/133‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCC‑AAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTTCCCT > AssemblyC74_contig_57/1‑134 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |