| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_17 | = 32032 | 0 (0.000) | 200 (0.730) +A |
40/254 | 2.6 | 79.8% | intergenic (+380/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
| ? | AssemblyC74_contig_34 | 2046 = | 102 (0.390) | intergenic (‑223/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | PaaD‑like protein (DUF59) involved in Fe‑S cluster assembly/– | |||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
TGTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_17/31900‑32032‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_34/2046‑2107 | TGTGTTCGATATATTAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTAT < 1:635819/135‑1TGTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTAT < 1:284573/135‑1TGTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTAT < 1:980030/135‑1TGTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTAT < 1:1597208/135‑1TGTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTAT < 2:1380622/135‑1 GTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATG > 2:2620521/1‑135 GTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATG > 2:2242737/1‑135 GTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATG > 2:1873091/1‑135 GTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATG > 1:1420708/1‑135 GTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATG > 2:2910639/1‑135 GTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATG > 1:302888/1‑135 GTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATG > 2:408769/1‑135 GTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATG > 1:671057/1‑135 GTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATG > 1:2411027/1‑135 GTGTACGATATATAAGTTGTCGAAGTATCAAGGTTATGTAAACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTTGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTAATATG > 1:1641451/1‑135 CGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATA < 1:278480/134‑1 CGAGATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAG < 2:963861/135‑1 gagATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTTAACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGTTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTATGATTAGTTATAGTTATGATGGATA > 2:2817304/4‑133 GATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGG < 1:2620521/135‑1 GATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATA > 2:1144179/1‑133 GATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATA > 2:1696035/1‑133 GATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATA > 2:1107772/1‑133 GATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATA > 1:221245/1‑133 GATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATA > 1:1444856/1‑133 GATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATA > 1:1379873/1‑133 GATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATA > 1:1338585/1‑133 GATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATA > 1:1149189/1‑133 ATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCT < 2:2778203/134‑1 GTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAA < 2:515031/133‑1 GAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTCGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGA > 2:2402676/1‑135 GAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGA < 1:224805/135‑1 GAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGA > 1:727720/1‑135 GAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGA > 2:1830676/1‑135 GAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGA > 2:2148380/1‑135 GAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGA > 2:2447222/1‑135 GAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGA > 1:2018579/1‑135 GAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGA > 1:2779886/1‑135 GAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGA > 2:757351/1‑135 GAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGA > 1:2028560/1‑135 GAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCAACGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATATGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGA > 2:1562611/1‑135 GAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGATAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGA < 2:688117/135‑1 AAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAA < 1:2349398/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACATTTGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:1186260/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:624253/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:2060760/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:1930534/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:1224162/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:2411027/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:839058/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:1656930/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:1626351/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:2644748/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:2151446/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:1442904/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:453695/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:1149189/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:1019554/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATATAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:2500800/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGCAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:1993802/135‑1 GGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGCTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTAAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:231300/135‑1 TGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 1:1107772/135‑1 TGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 2:2028500/135‑1 TGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 1:2118280/135‑1 TGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 1:1873506/135‑1 TGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 2:671112/135‑1 TATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGT > 1:382933/1‑135 TATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGT > 1:1622193/1‑135 TATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGT > 1:412938/1‑135 TATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGT > 2:2063459/1‑135 TATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGT > 2:209071/1‑135 TATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGT > 2:1311591/1‑135 ATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTG > 2:1957514/1‑135 TACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGT > 1:118186/1‑135 ACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA < 2:1420708/135‑1 ACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA < 1:2409967/135‑1 ACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA < 2:1263203/135‑1 GATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACT > 2:2708742/1‑135 ATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTA > 2:2122377/1‑135 ATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTA > 1:2735962/1‑135 ATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTA > 1:465809/1‑135 TGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTA < 1:1928961/134‑1 TGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTA < 1:228801/134‑1 TGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTA < 2:2744594/134‑1 TGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTA < 1:1711906/134‑1 GGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGA > 2:2069946/1‑135 GGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATA > 2:1232088/1‑91 GGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATA < 1:1232088/91‑1 GGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAA > 2:126108/1‑135 AGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGA > 1:503711/1‑135 GATAGAAGAGTTCAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGA < 2:2475131/134‑1 GATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGA < 1:126108/134‑1 GAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACA < 1:687402/135‑1 AGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATA > 2:1229780/1‑135 AGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAT > 2:2337799/1‑134 AGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAT > 1:2266647/1‑134 TAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT > 1:1947672/1‑103 AAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggag > 1:849574/1‑130 AAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGA > 1:2813243/1‑121 AAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggagg > 1:2892643/1‑129 TGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATTATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC < 1:2676072/125‑1 | TGTGTTCGATATATAAGTGGTCGAAGTATCAAGGTTATGTATACTGGATGGGAGATAGAAGAGTTAAAAATTGGAGGTCACCGCCACAAATGGAATTTAGATTTAGAGGTACCTTAGATTTGGTATAGTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_17/31900‑32032‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_34/2046‑2107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |