New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_21 | 1 = | 0 (0.000) | 209 (0.530) | 63/256 | 0.9 | 100% | intergenic (–/+243) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Sucrose operon repressor ScrR, LacI family |
? | AssemblyC74_contig_57 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Mobile element protein |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
AGTTAGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_21/134‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTTCCCT > AssemblyC74_contig_57/1‑134 AGTTAGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACT < 1:1172690/135‑1 AGTTAGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACT < 2:552596/135‑1 GTTAGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTA < 1:546495/135‑1 GTTAGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTA < 1:955119/135‑1 GTTAGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTA < 1:2313037/135‑1 GTTAGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTA < 2:1837772/135‑1 AGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATT < 1:1067677/134‑1 AGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTA < 2:1707534/132‑1 AGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTA < 1:2437641/132‑1 GACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGT < 1:2169981/135‑1 ACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTA > 2:2693302/1‑135 CTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAG > 2:1238326/1‑135 CTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAG > 2:792863/1‑135 TTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAG < 2:264666/134‑1 TTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAG < 2:1818673/134‑1 TTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTA < 1:1722961/133‑1 TTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTA < 1:2197101/133‑1 TTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTA < 1:2017493/133‑1 TTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTAATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGTAATTTGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAAT < 2:1037960/135‑1 GTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATA < 1:808211/134‑1 GTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATA < 2:1935156/134‑1 AAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTAT > 1:2677348/1‑135 AAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTAT > 2:1496108/1‑135 AAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTAT > 2:876335/1‑135 AAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTGTATCCGTTCACTATTGTAGTACTAGATATAGCTAT > 2:1521885/1‑135 CACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATG < 1:1084611/135‑1 TCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCT > 1:2783382/1‑135 CTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGA > 1:1826818/1‑135 CTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGA > 2:1442801/1‑135 CTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATA > 2:2479325/1‑118 CTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAG > 2:451264/1‑109 CTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTA < 1:2840957/108‑1 CTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTA > 2:2840957/1‑108 TTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGAT > 1:387680/1‑135 TTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTT < 2:1567596/135‑1 TTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTA < 1:2661203/135‑1 CTAAACTGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 1:1194268/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 2:1468361/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 2:723404/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 1:1001542/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 1:619238/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG > 2:619251/1‑135 CTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 1:515617/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG > 1:2719727/1‑135 CTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 1:1238321/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 1:340481/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 1:1449650/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCG < 1:1496108/135‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTA < 2:1550930/95‑1 CTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTA > 1:1550930/1‑95 AATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAAC > 2:1461413/1‑135 TTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAA < 2:387680/135‑1 TTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATA > 2:1264714/1‑134 TTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATGTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATA > 2:1660526/1‑134 TTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATGGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAAC > 2:684913/1‑135 ACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACA > 2:494961/1‑124 TTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTCTCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAA > 2:1780113/1‑135 TTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAA > 1:1662641/1‑135 TTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAA > 1:2722399/1‑135 cgtTTGTTTTACGAAATTGGACTGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAA < 2:914613/132‑1 GGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAAT < 2:2612669/135‑1 TTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTG > 1:969496/1‑135 TTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTG > 1:624918/1‑135 TTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGT > 1:1053819/1‑135 TTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGT > 1:445216/1‑135 TTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGT > 2:2790801/1‑135 TTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGT > 2:618650/1‑135 TTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGT > 1:485671/1‑135 TTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGAAATAGATATAGCTATCTATGGCTGATTTTAATTCCACGAAACAGATATAAACTTTACCGAGAAAAATCTCTTGT > 1:2539739/1‑135 GGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAA < 2:2866434/135‑1 CTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAA < 1:1883110/134‑1 TTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAA > 1:1210382/1‑134 TTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAG < 2:2264388/47‑1 GCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCT < 2:1622109/135‑1 CAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCC > 2:607451/1‑135 CAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCC > 2:327767/1‑135 CAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCC > 1:2365590/1‑135 CAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCC > 1:587584/1‑135 CAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTC > 2:1173820/1‑134 TAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTTTTGTAGTTATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGTATAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAATTTCTCCATAAG < 1:543933/135‑1 TAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAG < 1:2790801/135‑1 TAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAG < 1:2476718/135‑1 TAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAG > 1:1125298/1‑135 TAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAG < 1:1703793/135‑1 TAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAG < 2:1987380/135‑1 TAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAG > 1:705414/1‑135 TAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAG > 2:2136660/1‑135 TAATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAG < 2:2719727/135‑1 AATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGTTGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAATCTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAGT < 1:1000773/135‑1 AATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCACGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAGT > 1:801361/1‑135 ATTTCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAGTG < 1:1284399/135‑1 TCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAGTGAAT < 2:2365590/135‑1 TCTGTTTTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAGTGAAT < 2:248600/135‑1 TTATCCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTACCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTATCCATAAGTGAATTATATA > 2:2203032/1‑135 CCGTTCACTATTGTAGTAATAGATATTGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCAATAAGTGAATTATCTAAGCA > 2:1391651/1‑135 GTTCACTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGT < 2:1517754/135‑1 CTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTTCCCT > 1:1987225/1‑135 CTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTTCCCT > 1:2058933/1‑135 CTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTTCCCT > 1:2689582/1‑135 CTATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTTCCCT > 2:240508/1‑135 AGTTAGACTTTTTTGGAGTGGAGAAATCCACTCCTTTTTTCATGCTCTAAAATGATATTTTTACACAACTGTTACGGTTGTTTTACGAAATTGGACGGGACTTTGCCAGTTTAATTTCTGTTTTATCCGTTCAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_21/134‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTGTAGTAATAGATATAGCTATCGATGGCTGATTTTAATTCCTCGAAACAGTTATAAACTTTCCCGTGAAAAATCTCTTGTTTTAATAAGCCAAAAAAATTCTCCATAAGTGAATTATCTAAGCAGTTCCCT > AssemblyC74_contig_57/1‑134 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |