| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_25 | = 8555 | 0 (0.000) | 172 (0.680) +A |
41/254 | 2.4 | 77.3% | intergenic (+310/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | hypothetical protein/– |
| ? | AssemblyC74_contig_34 | 2046 = | 102 (0.390) | intergenic (‑223/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | PaaD‑like protein (DUF59) involved in Fe‑S cluster assembly/– | |||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
AATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_25/8423‑8555‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_34/2046‑2107 | AATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAAT > 1:2581317/1‑135AATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAAT > 1:1179822/1‑135AATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAAT > 1:1676911/1‑135 ATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAAT < 1:984144/134‑1 ATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAAT < 2:1748950/134‑1 ATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAAT < 2:372623/134‑1 ATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAAT < 1:389710/134‑1 ATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAAT < 1:1410341/134‑1 ATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAAT < 1:1364930/134‑1 ATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAAT < 1:833480/134‑1 ATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAAT < 2:722263/134‑1 ATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAAT < 2:1697189/134‑1 TTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGG > 1:1642849/1‑135 TTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATA < 2:580105/135‑1 TTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATA < 1:486071/135‑1 CTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGG < 2:1269732/135‑1 CAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCT < 1:1244217/135‑1 GTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAA > 2:1267286/1‑135 AATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATT > 2:2034437/1‑135 AATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATT > 1:1202013/1‑135 AATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATT > 2:2816563/1‑135 AATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAAT > 1:2441933/1‑120 AATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATAGTTAAATGTATATTAAATTAATATCATAATTACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGTATAGGCGACAATT > 1:1797051/1‑135 TTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAAC > 2:2494925/1‑135 TTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGA < 1:2909262/135‑1 ATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACA < 1:70053/135‑1 ATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAA < 1:2572940/135‑1 TTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAA < 1:84815/135‑1 atcgTCATACGAACGTAGTAATATCTCTATTGTTAAATGTTTATTAACTTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAATATTTTTAGGCTCCAATTAACTTGACATAAATATT < 2:2612113/131‑1 ATTTTCATTCGAAAGTAGTAATATATCTTTTGTTAAATGTTTATTAAATTTATATCATAATGACTCTATCCACTATAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTATCTAGACAGAAAAATT < 2:1536913/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAACATT < 2:461146/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:1728575/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:2010304/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:1179822/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:941896/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:1520880/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:2169419/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:1020478/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:1672002/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:548081/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:345114/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:319479/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:554808/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:221467/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:2170655/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:2761569/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:2346907/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:2816563/135‑1 ATTTTCATACGAACGTAGTAATATATATATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATTATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:340076/135‑1 ATTTTCATACGAACGCAGTAATATATATATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:2317601/135‑1 CATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 1:58483/135‑1 CATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 1:1943428/135‑1 CATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 1:1290799/135‑1 CATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 1:1700671/135‑1 CATACGAACGTAGTAATATATATATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 2:1798108/135‑1 CGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 2:2434239/131‑1 GAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA < 1:1473265/135‑1 GAAAGTAGTAATATATCTATAGTTAAATTTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA < 2:2772106/135‑1 GTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACT > 2:1689508/1‑135 TAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTA < 2:2314662/135‑1 TAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTA < 1:2720005/135‑1 CTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAT < 2:2757552/135‑1 TATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAT > 1:2742669/1‑134 TATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAT > 1:1334063/1‑134 TATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAT > 2:896384/1‑134 TTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC < 2:598549/135‑1 TTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC > 1:731274/1‑135 TTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC > 2:1674512/1‑135 TTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC > 2:1418478/1‑135 TTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC > 1:1920568/1‑135 TTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC < 1:1732202/135‑1 TTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAA > 1:1331355/1‑108 GTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCag > 1:1893389/1‑133 GTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCag > 1:202218/1‑133 GTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCag > 2:265578/1‑133 GTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCag > 1:1879054/1‑133 GTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCag > 1:500198/1‑133 GTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCag > 2:2179380/1‑133 GTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCag > 1:762296/1‑133 GTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCag > 2:1194956/1‑133 GTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCag > 2:1220741/1‑133 GTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCag > 1:113383/1‑133 GTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATACAGTGAAAATGGATAGTCTACAATTAACTATACAGAAAAATAAAGGTGTGTAGACTATAAGAAAACATACCag > 2:428499/1‑133 TAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCagga > 1:2837777/1‑131 TAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCagga > 1:260100/1‑131 TAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCagga > 1:2250923/1‑131 TAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCagga > 2:2627704/1‑131 AATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGTAAATGGATAGGCGACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggagg > 1:2011034/1‑129 AATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggagg > 1:1025171/1‑129 GTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:265205/97‑1 TTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 1:1573984/100‑1 TTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT > 2:1573984/1‑100 AAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT > 1:1909903/1‑90 AAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:1909903/90‑1 AAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:815818/90‑1 ATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT > 2:1386627/1‑70 CCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:793579/66‑1 CCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT > 2:793568/1‑66 CCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT > 2:793579/1‑66 CCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAAATGGATAGGCTACAATTAACTAGA < 2:2546691/56‑1 | AATTATTCTCAATGTAATTTTTTTATGATATTATTTTCATACGAACGTAGTAATATATCTATTGTTAAATGTTTATTAAATTAATATCATAATGACTATTGCCACTTTAACAATACAAAAAAATTCAGTGAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_25/8423‑8555‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_34/2046‑2107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |