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Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
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2:1005852/1‑135 ACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAAT < 1:83479/123‑1 ACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAAT > 2:83479/1‑123 GCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATGAATAGTATGTT > 1:2421900/1‑134 GCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATGAATAGTATGTT > 2:1226808/1‑134 CTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATGAATAGTATGTTTA > 1:1143462/1‑135 TCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATGAATAGTATGTTTAC > 1:2271669/1‑135 CTTCCTGTGTGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_43/131‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATGAATAGTATGTTTACA < AssemblyC74_contig_44/1136‑1005 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |