| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_15 | 1 = | 0 (0.000) | 291 (0.680) | 70/256 | 0.9 | 100% | intergenic (–/+1116) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_52 | = 702 | 0 (0.000) | intergenic (+23/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Putative transposase InsK for insertion sequence element IS150/– | |||||
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGGGGGTGCTTCTCTTGTTAGACAAAATCTTCACATTTCGCAATTAAATTATAACATCTTTGCTTCGAATGCACAACTTAAATGTCCGTCTATAACTGTATCATACTATTAGTTCAGATTTTTCCATTAAGGT > AssemblyC74_contig_15/1‑135 | ttcaaagtaaattaaatgagtatattaggtggtataataacaaaaggataaaactaaagttaaatggactatctccagtagaatatcggaaacagtccattaaatagttcaacttttggggttcagttcaAAAgg > 2:2435174‑M1/131‑135 (MQ=255)ttcaaagtaaattaaatgagtatattaggtggtataataacaaaaggataaaactaaagttaaatggactatctccagtagaatatcggaaacagtccattaaatagttcaacttttggggttcagttcaAAAgg > 1:2590650‑M1/131‑135 (MQ=255) caaagtaaattaaatgagtatattaggtggtataataacaaaaggataaaactaaagttaaatggactatctccagtagaatatcggaaacagtccattaaatagttcaacttttggggttcagttcaAAAgggg > 1:1206067‑M1/129‑135 (MQ=255) aagtaaattaaatgagtatattaggtggtataataacaaaaggataaaactaaagttaaatggactatctccagtagaatatcggaaacagtccattaaatagttcaacttttggggttcagttcaAAAggggg < 2:683911‑M1/8‑1 (MQ=255) 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ttcaAAAGGGGGTGCTTCTCTTGTTAGACAAAATCTTCACATTTCGCAATTAAATTATAACATCTTTGCTTCGAATGCACAACTTAAATGTCCGTCTATAACTGTATCATACTATTAGTTCAGATTTTTCCATTa < 1:2228976‑M1/131‑1 (MQ=255) caACAGGGGGTGCTTCACTAGTTAGACAAAATCTTCACATTTCGCAATTAAATTATAACATCTTTGCTTCGAATGCACAACTTAAATGTCCGTCTATAACTGTATCATACTATTAGTTCAGATTTTTCCAtt > 2:2300652‑M1/3‑132 (MQ=255) caAAAGGGGGTGCTTCTCTTGTTAGACAAAATCTTCACATTTCGCAATTAAATTATAACATCTTTGCTTCGAATGCACAACTTAAATGTCCGTCTATAACTGTATCATACTATTAGTTCAGATTTTTCCAtt > 2:2892442‑M1/3‑132 (MQ=255) caAAAGGGGGTGCTTCTCTTGTTAGACAAAATCTTCACATTTCGCAATTAAATTATAACATCTTTGCTTCGAATGCACAACTTAAATGTCCGTCTATAACTGTATCATACTATTAGTTCAGATTTTTCCAtt > 1:1390505‑M1/3‑132 (MQ=255) aaaGGGGGTGCTTCTCTTGTTAGACAAAATCTTCACATTTCGCAATTAAATTATAACATCTTTGCTTCGAATGCACAACTTAAATGTCCGTCTATAACTGTATCATACTATTAGTTCAGATTTTTCCATTAAGGt < 2:2037713/135‑1 (MQ=255) aaaGGGGGTGCTTCTCTTGTTAGACAAAATCTTCACATTTCGCAATTAAATTATAAAATCTTTGCTTCGAATGCACAACTTAAATGTCCGTCTATAACTGTATCATACTATTAGTTCAGATTTTTCCATTAAGGt < 2:899192/135‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAGGGGGTGCTTCTCTTGTTAGACAAAATCTTCACATTTCGCAATTAAATTATAACATCTTTGCTTCGAATGCACAACTTAAATGTCCGTCTATAACTGTATCATACTATTAGTTCAGATTTTTCCATTAAGGT > AssemblyC74_contig_15/1‑135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |