| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_2 | 1 = | 0 (0.000) | 165 (0.620) +A |
45/254 | 1.9 | 76.5% | intergenic (–/+1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_34 | 2046 = | 102 (0.390) | intergenic (‑223/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | PaaD‑like protein (DUF59) involved in Fe‑S cluster assembly/– | |||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGTATACTTTCTTATTAGGGAAATCACGCATATTGAAA > AssemblyC74_contig_2/1‑134 | ctggtatgttttcttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTcc < 1:1550819‑M1/67‑1 (MQ=255) ggtatgttttcttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTg > 1:1047815‑M1/64‑135 (MQ=255) ggtatgttttcttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTg < 2:224568‑M1/72‑1 (MQ=255) atgttttcttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGAt < 1:2908879‑M1/75‑1 (MQ=255) tcttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGttt < 1:1834636‑M1/80‑1 (MQ=255) cttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGt > 1:1773524‑M1/54‑135 (MQ=255) ttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTc > 1:225954‑M1/53‑135 (MQ=255) ttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTc > 2:1261611‑M1/53‑135 (MQ=255) ttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTc > 1:2314156‑M1/53‑135 (MQ=255) ttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTc > 1:505469‑M1/53‑135 (MQ=255) ttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTc > 1:564034‑M1/53‑135 (MQ=255) ttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTc > 1:769899‑M1/53‑135 (MQ=255) ttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTc > 2:919828‑M1/53‑135 (MQ=255) ttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTc > 2:1030567‑M1/53‑135 (MQ=255) ttctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTc > 2:1023933‑M1/53‑135 (MQ=255) ttctagtctacacaccttaatgtttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTc > 1:1230803‑M1/53‑135 (MQ=255) tctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTcg > 2:1550819‑M1/52‑135 (MQ=255) tctagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTACTGGATCGTTTGTcg > 2:2190713‑M1/52‑135 (MQ=255) tagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTcc < 1:1564791‑M1/52‑1 (MQ=255) tagtctacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTcgca < 2:2059476‑M1/86‑1 (MQ=255) tacacaccttgatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTcgcacgc > 1:1278758‑M1/45‑133 (MQ=255) tacacaccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTATATGCGAACGCTTGTCATGAATATATTGTGCTCCACCATTAGTATTTGCTGGTGGATCGGTGGTCGCACGcat < 2:1009601‑M1/91‑1 (MQ=255) 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accttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCAc > 1:1180744‑M1/40‑93 (MQ=255) accttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGa < 2:1996743‑M1/96‑1 (MQ=255) accttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGa < 2:1944094‑M1/96‑1 (MQ=255) ccttaatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGAc > 1:2585198‑M1/39‑135 (MQ=255) aatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGt < 2:2160181‑M1/5‑1 (MQ=255) aatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAAt > 2:1539067‑M1/35‑55 (MQ=255) aatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAAt > 2:2021448‑M1/35‑76 (MQ=255) aatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAAt > 2:1252172‑M1/35‑76 (MQ=255) 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aatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGta < 2:930074‑M1/100‑1 (MQ=255) aatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGta < 1:864981‑M1/100‑1 (MQ=255) aatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGta < 1:1842021‑M1/100‑1 (MQ=255) aatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGta < 1:1988155‑M1/100‑1 (MQ=255) aatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGta < 1:204276‑M1/100‑1 (MQ=255) aatttttctgtctagttaattgtagcctatccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGta < 1:2074045‑M1/100‑1 (MQ=255) 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tccatATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGTATACTTTCTTATTAGGGAAATCACGCATAtt > 1:399229‑M1/6‑135 (MQ=255) catATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGTATACTTTCTTATTAGGGAAATCACGCATATTGa > 1:1674139‑M1/4‑135 (MQ=255) atATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGTATACTTTCTTATTAGGGAAATCACGCATATTGaa < 2:1157114‑M1/133‑1 (MQ=255) atATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGTATACTTTCTTATTAGGGAAATCACGCATATTGaa < 2:2339031‑M1/133‑1 (MQ=255) atATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGTATACTTTCTTATTAGGGAAATCACGCATATTGaa < 1:464953‑M1/133‑1 (MQ=255) atATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGTATACTTTCTTATTAGGGAAATCACGCATATTGaa < 1:435239‑M1/133‑1 (MQ=255) tATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGTATACTTTCTTATTAGGGAAATCACGCATATTGaaa > 1:134591‑M1/2‑135 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCGTTGTGGAATATTTAAATACCAACGCTTGTCATGAAAATCTTGTGCTCCACCCTTAGTATTTCCTTCTGGATCGTTTGTCGCACGCATCATGACGTATACTTTCTTATTAGGGAAATCACGCATATTGAAA > AssemblyC74_contig_2/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |