| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_34 | 2046 = | 102 (0.390) | 184 (0.470) | 42/256 | 2.3 | 78.3% | intergenic (‑223/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | PaaD‑like protein (DUF59) involved in Fe‑S cluster assembly/– |
| ? | AssemblyC74_contig_52 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Putative transposase InsK for insertion sequence element IS150 | |||||
Only 100 of 1136 total aligned reads displayed.
CCAGAAGCCAAAATTCTGTTCTTTTTATTAACTTTTGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_34/1912‑2107 | tgtgttcgatatttaagtggtcgaagtatctaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattat < 2:2119758‑M2/1‑1 (MQ=255)tgtgttcgatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattat < 2:1380622‑M2/1‑1 (MQ=255)ccAGCAGCCAAAATTCTGTTCTTTTTATTAACTTTTGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCt < 1:1871275/135‑1 (MQ=255)ccAGAAGCCAAAATTCTGTTCTTTTTATTAACTTTTGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCt < 1:1468545/135‑1 (MQ=255)aagatttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttt > 1:924157‑M1/135‑135 (MQ=255)aagatttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttt > 2:406897‑M1/135‑135 (MQ=255) ttcgagctcaagaaagtttaaatcgctatactacagttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaat > 2:1912680‑M1/134‑134 (MQ=255) attattctcaatgtaatttttttatgatattattttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaat < 1:714916‑M2/1‑1 (MQ=255) attattctcaatgtaatttttttatgatattattttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaat < 1:1410341‑M2/1‑1 (MQ=255) attattctcaatgtaatttttttatgatattattttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaat < 2:372623‑M2/1‑1 (MQ=255) ttattctcaatgtaatttttttatgatattattttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTgg > 1:1642849‑M2/133‑135 (MQ=255) aatatgcgtgatttccctaataagaaagtatacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGa > 1:2264413‑M2/132‑135 (MQ=255) aatatgcgtgatttccctaataagaaagtatacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGa > 2:263850‑M2/132‑135 (MQ=255) aatatgcgtgatttccctaataagaaagtatacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGa > 1:399229‑M2/132‑135 (MQ=255) ttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATa > 2:2916776‑M1/130‑135 (MQ=255) ttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATa > 2:2230152‑M1/130‑135 (MQ=255) ttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATa > 1:1688013‑M1/130‑135 (MQ=255) gCCAAAATTCTGTTCTTTTTATTAACTTTTGTAGTTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATa < 2:580732/134‑1 (MQ=255) cgatatataagtggtcgaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATa < 1:278479‑M2/6‑1 (MQ=255) caatgtaatttttttatgatattattttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCt < 1:1244217‑M2/10‑1 (MQ=255) gtgatttccctaataagaaagtatacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTa > 2:71781‑M2/125‑135 (MQ=255) gtaatttttttatgatattattttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACaa > 1:1359583‑M2/122‑135 (MQ=255) aatttttttatgatattattttcatacgaacgtagtaatatatctatagttaaatgtatattaaattaatatcataattactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGTATAGGCGACAAtt > 1:1797051‑M2/120‑135 (MQ=255) tattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAAtt < 2:1788997‑M1/16‑1 (MQ=255) tttttatgatattattttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACt < 1:2831336‑M2/20‑1 (MQ=255) ttttATTAACTTTTGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGa < 2:1126922/135‑1 (MQ=255) gaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGa > 1:2018579‑M2/113‑135 (MQ=255) gaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGa < 2:1661951‑M2/23‑1 (MQ=255) gaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGa > 1:463545‑M2/113‑135 (MQ=255) gaagtatcaaggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaacgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatatggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGa > 2:1562611‑M2/113‑135 (MQ=255) ataagaaagtatacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGa < 2:1616512‑M2/23‑1 (MQ=255) caaggttatctatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatgtaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGaaaa < 2:2852760‑M2/30‑1 (MQ=255) aaCTTTTGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGaaaa < 2:1864388/135‑1 (MQ=255) ttttGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:1901301/135‑1 (MQ=255) ttttGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:1545263/135‑1 (MQ=255) ttttGTAGGATTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCACTGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:1055539/135‑1 (MQ=255) ggttatgtatactggatgggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:1442904‑M2/33‑1 (MQ=255) attttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAACAtt < 2:461146‑M2/33‑1 (MQ=255) attttcatacgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:2761569‑M2/33‑1 (MQ=255) atacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:881933‑M2/33‑1 (MQ=255) tacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:2703457‑M2/33‑1 (MQ=255) tacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 2:930074‑M2/33‑1 (MQ=255) tacgtcatgatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:1988155‑M2/33‑1 (MQ=255) aagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGaaaa > 2:517990‑M1/101‑130 (MQ=255) aagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt > 2:2808453‑M1/101‑133 (MQ=255) agtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCt > 1:1045762‑M1/100‑109 (MQ=255) ttactagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgt < 1:2516116‑M1/38‑1 (MQ=255) tAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgt < 1:2638304/135‑1 (MQ=255) ctagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaat < 2:246877‑M1/1‑1 (MQ=255) ctagaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgtgtg < 1:2709035‑M1/41‑1 (MQ=255) gatgcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgtgtgt > 1:2085546‑M2/94‑135 (MQ=255) cgaacgtagtaatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGgt > 1:2434239‑M2/94‑131 (MQ=255) agaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAt > 1:424605‑M1/93‑124 (MQ=255) agaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 2:215773‑M1/43‑1 (MQ=255) agaaataatactgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgatcggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 2:787562‑M1/43‑1 (MQ=255) gcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa > 1:2363542‑M2/91‑133 (MQ=255) gcgtgcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa > 1:1093928‑M2/91‑133 (MQ=255) attatACCTCAAAAAATGTTTATATTGTCACTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACTATTAACTAGACAGAAAAATTATGGTGTGTAGa < 1:1736248/135‑1 (MQ=255) ttatACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGAc > 1:2746427/1‑135 (MQ=255) gggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGAc < 1:368072‑M1/46‑1 (MQ=255) tgctacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTa < 2:1260922‑M2/48‑1 (MQ=255) gcgacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTag > 2:2429263‑M2/87‑135 (MQ=255) gggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTaga > 1:1163986‑M2/86‑135 (MQ=255) gggagatagaagagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTaga > 2:2069946‑M2/86‑135 (MQ=255) tactgtgaagatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTAAAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTagaa > 2:1155015‑M1/85‑135 (MQ=255) gacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTagaa > 1:564034‑M2/85‑135 (MQ=255) gacaaacgatccagaaggaaatactaagggtggagcacaagattttcatgacaagcgttggtatttaaatattccacaacgataTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTa < 2:227434‑M2/48‑1 (MQ=255) attaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTa < 1:686143‑M1/43‑1 (MQ=255) attaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTagaa < 1:2030817‑M1/51‑1 (MQ=255) aatatatctattgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaat < 1:2599137‑M2/1‑1 (MQ=255) tgtgacgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAgaagaa < 1:1005333‑M1/54‑1 (MQ=255) cgatgtttggatctattcgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACa < 2:1513535‑M1/58‑1 (MQ=255) agagttaaaaattggaggtcaccgccacaaatggaatttagatttagaggtaccttagatttggtatagttattaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAt > 2:1306177‑M2/76‑134 (MQ=255) ttgttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATAcc > 2:1703810‑M2/74‑135 (MQ=255) gttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAtaccag > 1:500198‑M2/72‑133 (MQ=255) gttaaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACAtaccag > 2:1194956‑M2/72‑133 (MQ=255) taaatgtttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAAcataccagga > 1:981370‑M2/70‑131 (MQ=255) tttattaaattaatatcataatgactattgccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:221214‑M2/33‑1 (MQ=255) tCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatt < 1:625068‑M1/135‑11 (MQ=255) tCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatt < 1:2548962‑M1/135‑11 (MQ=255) cgttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATa > 1:303307‑M1/60‑65 (MQ=255) gttatagctatagagtttatcataatatttttaacttttatcccctatatgattggaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGa < 2:2395233‑M1/23‑1 (MQ=255) atatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttt < 2:829197‑M1/1‑1 (MQ=255) ggACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaa > 2:1221084‑M1/1‑109 (MQ=255) atctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATAcc < 2:2318924‑M1/62‑1 (MQ=255) ctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttTGGATa < 2:201031‑M1/6‑1 (MQ=255) ccactttaacaatacaaaaaaattcagtgaaaaTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAtt < 1:793579‑M2/33‑1 (MQ=255) agaACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttca > 2:2606507‑M1/1‑92 (MQ=255) aaCTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcaca > 2:2039883‑M1/1‑90 (MQ=255) ttttACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAATAAAACAAAACaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactatttcacaataat > 1:2311533‑M1/1‑85 (MQ=255) ttttACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaat < 1:1936175‑M1/135‑51 (MQ=255) aTCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaat < 1:2890241‑M1/135‑64 (MQ=255) gagttttggatagGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtc > 2:2550635‑M1/7‑68 (MQ=255) gagttttggatagGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtc < 2:1951874‑M1/129‑68 (MQ=255) gaatggaTAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtc > 1:120072‑M1/4‑65 (MQ=255) tCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtcaatc > 1:1311091‑M1/1‑64 (MQ=255) gttggATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtcaatc > 2:629725‑M1/3‑64 (MQ=255) atgGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtcaatct < 1:1582103‑M1/134‑73 (MQ=255) tGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtcaatctt > 1:84823‑M1/1‑62 (MQ=255) tGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACCaggaggaatttttatgtctaagagaacacgaagaactttttcacaagaattcaagcaacaaatcgtcaatctt < 1:2133198‑M1/135‑74 (MQ=255) | CCAGAAGCCAAAATTCTGTTCTTTTTATTAACTTTTGTAGGTTTATTATACCTCAAAAAATGGTTAAATTGTCCCTTAAAATAGCTTGGACTACATACTCAATGAGAACTTTTTTACGCTTCTTATCTGTAGTCTGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_34/1912‑2107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |