| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | AssemblyC74_contig_52 | = 702 | 0 (0.000) | intergenic (+23/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Putative transposase InsK for insertion sequence element IS150/– | |||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
TAAATGTAATTCTTCCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_40/1474‑1604 | taaatGTAATTCTTCCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAAtgaa < 2:1585563‑M1/135‑5 (MQ=255) cttcCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAAtgaactgaaccccaa > 1:2680009‑M1/1‑120 (MQ=255) tcCAACAGCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGCACTGCCCCTCAAtgaactgaaccccaaaa < 2:1872200‑M1/135‑18 (MQ=255) accagCCGCTTCTCCGATCATTTGTTATAAATATATGTTAATTTTACATCTTAGCCGTCTTTATAACAATAACTAAAATTGCAGATGTAGCCTAATTATATGTACTGCCCCTCAAtgaactgaaccccaaaagtt < 1:55140‑M1/133‑21 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |