| New junction evidence | |||||||||||
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TGTATCTACACTCGTTAAGAAAGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTC > AssemblyC74_contig_43/838‑1105 | tctaatgttgttaaattactacagctatggacgtaagaattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAac > 1:2415796‑M1/133‑135 (MQ=255) cGTTAAGAAAGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTAATATACGTAACATTAGACGTATCAAACACGCGCATATCAATGGTCTTAGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGAACAGACAGTATCCAACAATTTGAttac > 1:476061/1‑133 (MQ=255) aaattactacagctatggacgtaagaattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaataagttctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCt < 2:356818‑M1/15‑1 (MQ=255) aaattactacagctatggacgtaagaattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCt < 1:2917802‑M1/15‑1 (MQ=255) aaattactacagctatggacgtaagaattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCt < 1:1203359‑M1/15‑1 (MQ=255) aaattactacagctatggacgtaagaattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttcaaattagtgtctAACACTTTGATTTCt < 2:2303411‑M1/15‑1 (MQ=255) attactacagctatggacgtaagaattcatgtttgttacgtgtgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCttt > 2:1187235‑M1/119‑135 (MQ=255) aagaaagaTCAATAAGCTAACATGCTGTTCAAATTCGAAACATACGACGTATCAAACAAGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTTAAGAATTGAAAAGATATGACAAGTCAGTATCCTAGACGTTGATTTCTTTa > 2:2905743/1‑135 (MQ=255) agaaagaGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTa > 2:1079924/1‑134 (MQ=255) aaTAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAg > 1:1899870/1‑135 (MQ=255) 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TGTATCTACACTCGTTAAGAAAGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTC > AssemblyC74_contig_43/838‑1105 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |