| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_47 | 452 = | NA (NA) | 299 (0.850) +TACACTCGTTAAAGAGCCACAGCCATAAAACATA |
69/188 | -0.0 | 100% | noncoding (7/29 nt) | direct | CRISPR repeat with sequence actatcgatgtaagtaattgggatacgtc |
| ? | AssemblyC74_contig_61 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+2) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 1119 total aligned reads displayed.
AAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTG > AssemblyC74_contig_47/320‑582 | tcgaaggttacttctatgactgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGAt > 1:2617317‑M1/133‑135 (MQ=255) gaaggtttcttctctgactgctatgtttgctgggggtaactctaacactctcgttgttagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATg > 2:663599‑M1/131‑134 (MQ=255) ttctatgactgctatgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTg > 1:1313913‑M1/122‑135 (MQ=255) acTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg < 1:2845466/134‑1 (MQ=255) tgatttctatgttttatggctgtggatcttttacgagtgtatttttaagtaattgggatacgtcgaatgttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTg > 2:2070357‑M1/120‑133 (MQ=255) cTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATAc > 2:1436023/1‑135 (MQ=255) acttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacttccaaggatacttctaagaatgcTATGTTTGCATGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATAc < 1:2109019‑M1/51‑1 (MQ=255) tgaatgaaCTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGt > 1:692032/1‑135 (MQ=255) gttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTACTTGGTATACGTCaaa < 1:1484032‑M1/26‑1 (MQ=255) gttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGTATACGTCaa < 1:1948557‑M1/25‑1 (MQ=255) atgtttgcaggggttaaatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAAt > 2:1739524‑M1/109‑135 (MQ=255) tgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATg > 1:1750394‑M1/77‑135 (MQ=255) aaCTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATg < 1:2165864/135‑1 (MQ=255) gctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTAcga > 2:1384251‑M1/102‑134 (MQ=255) tgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTacgaa > 1:2653800‑M1/100‑132 (MQ=255) tgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTacgaa > 1:369846‑M1/100‑132 (MQ=255) tgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTacgaa > 2:1140640‑M1/100‑132 (MQ=255) ggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGTGTTAAATATAACAAGATAGATGTAAGTAATTGGGAAAAGTCAAATGTtacgaat < 2:2765399‑M1/67‑4 (MQ=255) tGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGaa > 2:2272248/1‑135 (MQ=255) ctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATgac < 2:2857373‑M1/41‑2 (MQ=255) gctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATatgactt > 1:1005529‑M1/62‑132 (MQ=255) gctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATAtgact > 2:1051108‑M1/62‑132 (MQ=255) gctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATAtgact > 1:294111‑M1/62‑132 (MQ=255) gctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATgac < 2:1620162‑M1/72‑2 (MQ=255) ctttaccgtgtgtagatgtaagtaattgtgatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATAtgact > 2:445379‑M1/93‑132 (MQ=255) ctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATatgactt > 1:1385590‑M1/93‑132 (MQ=255) aatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATatgactt > 1:2201159‑M1/93‑132 (MQ=255) aatctaacactatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATgac < 2:1858730‑M1/41‑2 (MQ=255) aaGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTa > 2:1182362/1‑135 (MQ=255) gagtttagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctcttttaagagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTATATGtt > 2:1488282‑M1/86‑135 (MQ=255) ctatcgatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGtttt < 1:607315‑M1/52‑1 (MQ=255) aCCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTAt > 2:2823172/1‑135 (MQ=255) tagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCt > 1:1620162‑M1/47‑135 (MQ=255) tagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCt > 2:1696097‑M1/47‑135 (MQ=255) tCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGACTGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCt < 2:1338111/135‑1 (MQ=255) atgtaagtaattgggatccgtcgacggttacttatatgacggatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCt > 2:354798‑M1/78‑135 (MQ=255) atgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCTAATGTTACGAATATGACTTATATGTTTTATGGCt > 1:452331‑M1/78‑135 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg < 2:8315/88‑1 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCtgt > 1:1205333/1‑134 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCtgt > 2:220148/1‑134 (MQ=255) atatGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCtgt > 2:1098511/1‑134 (MQ=255) agtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTgg < 1:1706593‑M1/62‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 1:545350‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 1:2699543‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 1:879309‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 1:1902613‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACCAGTATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 1:1546449‑M1/66‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGctct < 1:631455‑M1/66‑1 (MQ=255) attgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGctc > 1:749585‑M1/69‑133 (MQ=255) ttgggatacgtcgaagtttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:2898031‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:606894‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:2121534‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:1034865‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:902105‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:498742‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:1649098‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:313131‑M1/68‑135 (MQ=255) ttgggatacgtcgaaggttacttatatgactgatatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:308237‑M1/68‑135 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:2012986/135‑1 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:2878213/135‑1 (MQ=255) tGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:729549/135‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 2:1009480‑M1/99‑1 (MQ=255) aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:2440343‑M1/99‑1 (MQ=255) aattggcatacgacgaaggttacttctatgactgcTAGGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGGAAGTAATTGGGAGACGTCTCATGTTACGAATATGACGTCTATGTGTTATGGCGGTGGCTCttt < 2:1287793‑M1/99‑1 (MQ=255) ttGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGa > 2:2014834/1‑135 (MQ=255) gggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCTAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGa > 2:2587873‑M1/32‑135 (MQ=255) gggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGa > 1:1180218‑M1/32‑135 (MQ=255) gggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGa > 1:2810803‑M1/32‑135 (MQ=255) atacgtcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGa < 2:2640690‑M1/73‑1 (MQ=255) tcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCTAATGTTACTAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGTCTATTTATAGAGTGTa < 1:2269762‑M1/78‑1 (MQ=255) tcgaaggttacttctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCt < 1:793227‑M1/58‑1 (MQ=255) aaTGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGa > 2:892286/1‑124 (MQ=255) gttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgtaagt < 1:842760‑M1/118‑1 (MQ=255) gttacttctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 1:2477747‑M1/18‑116 (MQ=255) gttacttctatgaaTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGACTATGAATTCTATGTTTTATGGCt > 2:2511458‑M1/15‑106 (MQ=255) tctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAt < 2:922276‑M1/90‑1 (MQ=255) ctatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAtt < 1:2764835‑M1/91‑1 (MQ=255) ttCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg < 2:2713653/135‑1 (MQ=255) tctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACTAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTTTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTgg < 2:2671480‑M1/124‑1 (MQ=255) tctatgaatgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTgg > 2:1224245‑M1/12‑135 (MQ=255) tctatgaaTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt > 2:239761‑M1/9‑110 (MQ=255) tGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGTCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATa > 1:253529/1‑135 (MQ=255) cTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGt > 2:2474709/1‑135 (MQ=38) atgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGt < 2:1548272‑M1/131‑1 (MQ=255) atgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGt < 1:1446489‑M1/131‑1 (MQ=255) atgcTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGAAtt < 2:1907802‑M1/74‑1 (MQ=255) atGTTTGCAGGGGTTAAAACTAACACTATCTATGTAAGTAATTGTGATAATTCAAATGTTACGCATATGAATAATATGATTTATGGCTGTGTCTCTTTAAATAGAGTATAAGTAAGAAATTGTGATACGTCTAAg > 2:503800/1‑135 (MQ=2) tGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAgg > 1:973316/1‑135 (MQ=37) ttGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATg < 1:1104942/108‑1 (MQ=12) aGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACaaa > 1:1656979/1‑135 (MQ=40) aGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACaaa > 2:556759/1‑135 (MQ=40) aGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACaaa > 2:1785218/1‑135 (MQ=40) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACaaa < 2:1819812/134‑1 (MQ=40) ggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCttt < 1:206543/87‑1 (MQ=255) tAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAg > 2:1956418/1‑135 (MQ=255) ctctttaacgagtgtaGATGTAAGTAATTGGGATACg > 2:943888‑M1/17‑37 (MQ=255) aaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGAATATGACTTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACttctatgacta < 2:796233‑M2/135‑12 (MQ=255) acTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGttt < 1:1849799/135‑1 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGa < 1:2359566/78‑1 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGa > 2:2359566/1‑78 (MQ=255) | AAAGTGTTAGACACTAACTTGAATGAACTTTTCCGCAATGCAAAAGTTACAACCATCGATATGCGTGGGTTTGATATGTCGAATGTTACTTCTATGGCTGATATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCAAATGTTACGGATATGAATTCTATGTTTTATGGCTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAAATATGAGTTATATGTTTTG > AssemblyC74_contig_47/320‑582 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |