New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? AssemblyC74_contig_47 730 =NA (NA)147 (0.310) 44/256 0.0 100% coding (729/879 nt) rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc hypothetical protein
?AssemblyC74_contig_61 1 = 0 (0.000)intergenic (–/+2) –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc –/hypothetical protein

Only 100 of 462 total aligned reads displayed.

AGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGA  >  AssemblyC74_contig_47/602‑863
                                                                                                                                |                                                                                                                                     
aGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTc                                                                                                                                 >  1:28898/1‑135 (MQ=255)
     aGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCaaaa                                                                                                                            >  2:2056479/1‑135 (MQ=255)
         gtaagtaaTTGGCATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATtgt                                                                                                                        <  1:2389192/135‑1 (MQ=255)
         gtaagtaaTTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAAtt                                                                                                                          <  2:1901914/133‑1 (MQ=255)
         gtaagtaaTTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTGGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATtgt                                                                                                                        <  1:1950766/135‑1 (MQ=255)
         gtaagtaaATGGCATCCGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTGTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAAtt                                                                                                                          <  2:1315323/133‑1 (MQ=255)
               aaTTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGctct                                                                                                                  >  1:792427/1‑135 (MQ=255)
               aaTTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGctct                                                                                                                  >  2:2499163/1‑135 (MQ=255)
               aaTTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGctct                                                                                                                  >  2:1523690/1‑135 (MQ=255)
               aaTTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATGGTGGctct                                                                                                                  >  2:747180/1‑135 (MQ=255)
               aaTTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTGTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGctct                                                                                                                  >  2:1673269/1‑135 (MQ=255)
               aaTTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTGTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCAATAATTGTGGctct                                                                                                                  >  2:2319080/1‑135 (MQ=255)
                aTTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGctc                                                                                                                   <  1:377465/133‑1 (MQ=255)
                 ttgggatacgtcaaatgttacgaatatgaattctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCttt                                                                                                                >  1:1866251‑M1/112‑135 (MQ=255)
                 ttGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTTTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCttt                                                                                                                <  2:601223/135‑1 (MQ=255)
                 ttGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCttt                                                                                                                <  1:1583065/135‑1 (MQ=255)
                    gAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAAc                                                                                                             >  2:776005/1‑135 (MQ=255)
                             cAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTACAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGa                                                                                                    >  2:2168592/1‑135 (MQ=255)
                               aTGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGctct                                                                                                                  <  1:437758/119‑1 (MQ=255)
                               aTGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGctct                                                                                                                  >  2:437758/1‑119 (MQ=255)
                                       aatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATgtaag                                                                                              >  1:897073‑M1/90‑131 (MQ=255)
                                       aaTATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAt                                                                                          >  2:2617317/1‑135 (MQ=255)
                                        atatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTaa                                                                                                              >  2:1407671‑M1/89‑114 (MQ=255)
                                        atatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTaa                                                                                                              <  1:1407671‑M1/26‑1 (MQ=255)
                                        atatGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAtt                                                                                         >  1:1620698/1‑135 (MQ=255)
                                        atatGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAAtt                                                                                         >  1:2335374/1‑135 (MQ=255)
                                         tatGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg                                                                                        <  1:988997/135‑1 (MQ=255)
                                          atGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTgg                                                                                       <  2:1246607/135‑1 (MQ=255)
                                             acttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTAGAAAGTTGTGGATCTTTATCGATTGTAGATGTAAGTAATTGGGa                                                                                     <  1:169132‑M1/51‑1 (MQ=255)
                                                   cTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTc                                                                               <  2:88613/134‑1 (MQ=255)
                                                    tGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGa                                                                             >  1:1298532/1‑135 (MQ=255)
                                                     gTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGaa                                                                            <  1:1523690/135‑1 (MQ=255)
                                                         tGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAATTAATTGGGATACGTCGAAGGt                                                                         >  1:1145491/1‑134 (MQ=255)
                                                         tGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGt                                                                         >  1:183455/1‑134 (MQ=255)
                                                            ggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTa                                                                                                      >  2:685995‑M1/69‑102 (MQ=255)
                                                            ggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATa                                                                                   <  1:2440061‑M1/53‑1 (MQ=255)
                                                            ggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATa                                                                                   >  2:2440061‑M1/69‑121 (MQ=255)
                                                            ggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTAc                                                                      <  2:2744042‑M1/66‑1 (MQ=255)
                                                               aaTACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTc                                                                   <  1:550187/134‑1 (MQ=255)
                                                                   cGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGa                                                              <  2:2397984/135‑1 (MQ=255)
                                                                    gtgtTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAc                                                             <  2:2130282/135‑1 (MQ=255)
                                                                      ctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTAtgaat                                                            >  2:1067758‑M1/59‑132 (MQ=255)
                                                                       tttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGc                                                          >  1:2525638‑M1/58‑135 (MQ=255)
                                                                       tttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGc                                                          >  2:1339822‑M1/58‑135 (MQ=255)
                                                                         tAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTa                                                        >  1:2644256/1‑135 (MQ=255)
                                                                          aacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCttt                                                                                                                <  1:1483528‑M1/24‑1 (MQ=255)
                                                                              agtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGttt                                                   >  1:2070784‑M1/51‑135 (MQ=255)
                                                                              agtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGttt                                                   >  2:84017‑M1/51‑135 (MQ=255)
                                                                              agtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGttt                                                   >  1:92251‑M1/51‑135 (MQ=255)
                                                                              agtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGttt                                                   >  1:1266378‑M1/51‑135 (MQ=255)
                                                                              agtgtagatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGttt                                                   >  1:2744042‑M1/51‑135 (MQ=255)
                                                                                  tAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAc                                                             <  2:463387/121‑1 (MQ=39)
                                                                                  tAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAc                                                             >  1:463387/1‑121 (MQ=39)
                                                                                  tAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAg                                               >  1:75340/1‑135 (MQ=255)
                                                                                   aGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAgg                                              >  2:544790/1‑135 (MQ=255)
                                                                                   aGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAgg                                              >  2:2201159/1‑135 (MQ=255)
                                                                                    gatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACTTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAggg                                             <  1:1797870‑M1/91‑1 (MQ=255)
                                                                                    gatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAggg                                             <  1:2024874‑M1/91‑1 (MQ=255)
                                                                                    gatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAggg                                             >  1:2495249‑M1/45‑135 (MQ=255)
                                                                                    gatgtaagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAggg                                             >  2:2279532‑M1/45‑135 (MQ=255)
                                                                                    gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAggg                                             <  2:1782136/135‑1 (MQ=255)
                                                                                    gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAggg                                             <  1:270772/135‑1 (MQ=255)
                                                                                        taagtaattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTTAAGGGGTTa                                         <  2:1937542‑M1/95‑1 (MQ=255)
                                                                                           gtaaTTGGGATACGTCGAATGTTACAATTATGAGTGATATGTTCAAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTTCTATGTTTTCAGGGGTTaa                                        >  1:658158/1‑133 (MQ=255)
                                                                                           gtaaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTaa                                        >  1:2918408/1‑133 (MQ=255)
                                                                                             aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATg                                                                                                  <  1:1776545‑M1/38‑1 (MQ=255)
                                                                                             aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCTAAGGTTACTTCTATGAATTCTATGTTTTCAGGGGTTAAATCt                                    <  2:1847822‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                                                                             aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt                                    <  1:329165‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                                                                             aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt                                    <  1:2836780‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                                                                             aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt                                    <  1:1955998‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                                                                             aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGAAGGGGTTAAATCt                                    <  2:1181041‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                                                                             aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTACTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt                                    <  2:1602560‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                                                                             aattgggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGACGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt                                    <  1:572733‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                                                                             aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAGGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTACTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt                                    >  2:2638050/1‑135 (MQ=255)
                                                                                             aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTg                                                                                        >  2:2533794/1‑83 (MQ=255)
                                                                                             aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAg                                                                           <  1:2128257/96‑1 (MQ=40)
                                                                                             aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGttt                                                   <  1:258925/120‑1 (MQ=255)
                                                                                             aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAggg                                             <  2:2697538/126‑1 (MQ=255)
                                                                                             aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt                                    >  1:2602055/1‑135 (MQ=255)
                                                                                             aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCt                                    >  1:281484/1‑135 (MQ=255)
                                                                                              aTTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATc                                     <  1:2572275/133‑1 (MQ=255)
                                                                                                  ggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAacac                               <  1:1055245‑M1/105‑1 (MQ=255)
                                                                                                  ggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAacac                               <  1:935869‑M1/105‑1 (MQ=255)
                                                                                                  ggatacgtcgaaggttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAacac                               <  2:2825213‑M1/105‑1 (MQ=255)
                                                                                                      aCGTCCAAGGTTACACTTATGAGTGATATGTTCCAAACTTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATc                           <  2:1991783/135‑1 (MQ=255)
                                                                                                       cGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCg                          >  1:2206895/1‑135 (MQ=255)
                                                                                                           gAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATgt                      <  1:82073/135‑1 (MQ=255)
                                                                                                              ggTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATgtaag                   <  2:2102283/135‑1 (MQ=255)
                                                                                                               gttacttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATgtaagt                  <  1:1106669‑M1/118‑1 (MQ=255)
                                                                                                               gTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTGTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATgtaagt                  >  2:566367/1‑135 (MQ=255)
                                                                                                                ttACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATgtaagta                 >  1:2279515/1‑135 (MQ=255)
                                                                                                                    ttctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg             >  2:329165‑M1/13‑135 (MQ=255)
                                                                                                                    aaTTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg             <  1:1349562/135‑1 (MQ=40)
                                                                                                                    aaTTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTg             <  2:149308/135‑1 (MQ=40)
                                                                                                                     tctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACg                                                                                 >  2:810008‑M1/12‑66 (MQ=255)
                                                                                                                     tctatgaatgcTGTGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGAATGCTATGttt                                                   <  1:100174‑M1/85‑1 (MQ=255)
                                                                                                                     aTTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAggg                                             <  1:2055275/102‑1 (MQ=255)
                                                                                                                     aTTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTgg            >  2:2572995/1‑135 (MQ=39)
                                                                                                                          gAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTATATCGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATAc       <  2:285810/135‑1 (MQ=255)
                                                                                                                              gATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCg   >  2:2908457/1‑135 (MQ=35)
                                                                                                                                |                                                                                                                                     
AGTGTAGATGTAAGTAATTGGAATACGTCCAATGTTACGAATATGCATGGGCTGTTTTGGGGAAATACGTGTTTAGAGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACAATTATGAGTGATATGTTCCAAAATTGTGGCTCTTTAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGA  >  AssemblyC74_contig_47/602‑863

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.