| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_31 | = 3396 | 0 (0.000) | 411 (0.410) +TGATGTT |
70/242 | 0.5 | 78.5% | noncoding (118/118 nt) | rasttk_feature_creation_tool=RNA_reps_5S_rRNA | 5S rRNA # 5S ribosomal RNA ‑ 3 prime truncation |
| ? | AssemblyC74_contig_8 | 1645 = | 239 (0.860) | intergenic (‑212/‑2) | rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE/rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE | tRNA‑Thr‑GGT/tRNA‑Asn‑GTT | |||||
Only 100 of 729 total aligned reads displayed.
TCTAATAGGAAAACAGATTTTAGAAAAAATAAAAATAACAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTAAATAAAGCTTATGCAAAGAAAAAGAAATCCAATCACTTGGGTTTCTTTTTCTTTTA > AssemblyC74_contig_8/1511‑1778 | aacaccacagtgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgtta < 1:590170‑M2/1‑1 (MQ=255) tAGGAAAACATATTTTAGAAAAAATAAAAATAACAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCg < 2:1188878/135‑1 (MQ=255) tAGGAAAACAGATTTTAGAAAAAATAAAAATAACAAAAACTGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCg < 2:943182/135‑1 (MQ=255) tAGGAAAACAGATTTTAGAAAAAATAAAAATAACAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCg < 2:2044541/135‑1 (MQ=255) tAGGAAAACAGATTTTAGAAAAAATAAAAATAACAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCg < 1:1710917/135‑1 (MQ=255) ccacagtgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCg < 2:799345‑M2/6‑1 (MQ=255) cacagtgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCgg > 2:2516250‑M2/129‑135 (MQ=255) cacagtgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCg < 1:1877510‑M2/6‑1 (MQ=255) cacagtgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCgg > 1:387424‑M2/129‑135 (MQ=255) ggAAAACAGATTTTAGAAAAAATAAAAATAACAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGc > 2:1618976/1‑135 (MQ=255) tgtggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCAt > 2:50555‑M2/124‑133 (MQ=255) aaCAGATTTTAGAAAAAATAAAAATAACAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCAt > 2:2770622/1‑133 (MQ=255) aaCAGATTTTAGAAAAAATAAAAATAACAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATa < 2:137793/134‑1 (MQ=255) aaCAGATTTTAGAAAAAATAAAAATAACAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATa < 2:696670/134‑1 (MQ=255) tggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATa < 1:2719289‑M2/11‑1 (MQ=255) tggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATa < 1:2307480‑M2/11‑1 (MQ=255) tggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATa < 1:2771393‑M2/11‑1 (MQ=255) tggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATa < 1:2157920‑M2/11‑1 (MQ=255) tggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATa < 2:2197641‑M2/11‑1 (MQ=255) tggtggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATa < 1:1967978‑M2/11‑1 (MQ=255) tggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAg > 1:424589‑M2/119‑135 (MQ=255) tggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagggaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAg > 2:1977377‑M2/119‑135 (MQ=255) ggcgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGt > 1:2352064‑M2/118‑135 (MQ=255) tttAGAAAAAATAAAAATAACAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTc < 1:1174464/131‑1 (MQ=255) cgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTg > 1:852673‑M2/116‑135 (MQ=255) cgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTg > 2:1012705‑M2/116‑135 (MQ=255) cgatagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTg > 1:2627550‑M2/116‑135 (MQ=255) tAGAAAAAATAAAAATACCAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTgg < 1:269081/135‑1 (MQ=255) tAGAAAAAATAAAAATAACAAAAACTGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTgg < 2:2566367/135‑1 (MQ=255) tAGAAAAAATAAAAATAACAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTgg < 1:653713/135‑1 (MQ=255) tAGAAAAAATAAAAATAACAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTgg < 1:129002/135‑1 (MQ=255) atagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGgt > 2:1927011‑M2/114‑135 (MQ=255) atagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGgt > 2:1249899‑M2/114‑135 (MQ=255) atagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTgg < 2:2306178‑M2/21‑1 (MQ=255) atagcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTgg < 2:1091214‑M2/21‑1 (MQ=255) gAAAAAATAAAAATAACAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGgta < 2:451218/135‑1 (MQ=255) gcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATa > 2:759697‑M2/111‑121 (MQ=255) gcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGgtagt > 1:1545096‑M2/111‑135 (MQ=255) gcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGgtagt > 2:116399‑M2/111‑135 (MQ=255) gcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGgtagt > 1:1003162‑M2/111‑135 (MQ=255) gcgagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgaggttATTCCGGCATAGCTCAGTTGgtagt > 2:831108‑M2/111‑135 (MQ=255) gagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATa > 1:755144‑M2/109‑119 (MQ=255) gagaaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGtagtag > 2:364636‑M2/109‑135 (MQ=255) ataaaaataaCAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAgcg < 2:392368/135‑1 (MQ=255) ataaaaataaCAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAgcg < 1:715976/135‑1 (MQ=255) aaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAgcg < 1:1370673‑M2/29‑1 (MQ=255) aaggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAgcg < 1:1231536‑M2/29‑1 (MQ=255) ggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCa < 2:1706432‑M2/31‑1 (MQ=255) ggatacacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAgcgc < 1:782514‑M2/30‑1 (MQ=255) aaaataaCAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCAt < 1:506937/135‑1 (MQ=255) cacctgtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTg > 1:207727‑M2/99‑135 (MQ=255) agtaaccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgagagtagtgaggggttgccccttgagagagtaggacgacgccacgcagatgttATTCCGGCATAGCTCAGATGGTAGTAGCGCATGACAGTTaa > 1:1490539‑M2/95‑135 (MQ=255) aaaTGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATc < 2:2110906/135‑1 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATa > 2:1854902‑M2/90‑100 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTgg < 2:1566201‑M2/21‑1 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCatg > 2:1513508‑M2/90‑135 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCatg > 2:2871955‑M2/90‑135 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCatg > 2:2169704‑M2/90‑135 (MQ=255) ccatgccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCatg > 2:166086‑M2/90‑135 (MQ=255) gccgaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGt < 2:22293‑M2/50‑1 (MQ=255) aaCGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGt < 2:24722/135‑1 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgtta < 2:2373010‑M2/1‑1 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTc < 1:1585983‑M2/15‑1 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGt > 2:750139‑M2/83‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGt > 1:1105078‑M2/83‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGt > 1:919754‑M2/83‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGt > 2:311615‑M2/83‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccgagtgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTGGGTAGTATCGCATGACTGTTAAGCATGATGTCGt > 2:1998985‑M2/83‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGt > 1:2202713‑M2/83‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGt > 2:1540018‑M2/83‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGt > 1:1741021‑M2/83‑135 (MQ=255) gaacacagaagttaagcttcttagcgccaagtgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGt > 2:2423692‑M2/83‑135 (MQ=255) ttCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAg < 1:533598/134‑1 (MQ=255) tttGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTc < 1:2500168/135‑1 (MQ=255) tcttagcgccaattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTACTCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACt < 1:1638460‑M2/69‑1 (MQ=255) taaAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGcc > 1:2264485/1‑135 (MQ=255) taaAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGcc < 1:1936359/135‑1 (MQ=255) aaaaaTTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGATGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGa > 2:233863/1‑135 (MQ=255) aaaTTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGt > 2:576285/1‑135 (MQ=255) gattgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCggagttctc < 2:1890600‑M2/81‑5 (MQ=255) attgtagtgaggggttgccccttgtgagagtaggacgtcgccacgctgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCcggagttctca > 1:2108565‑M2/54‑130 (MQ=255) ttATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTAAATAAAGCTTATGCaaagaa > 1:2842521/1‑135 (MQ=255) agaagaAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTAAATAAAGCTTATGCaaagaaaaagaa > 1:2403552/1‑135 (MQ=255) gATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTAAATAAAGCTTATGCAAAGAAAAAGAAATCCAATCAc > 1:96022/1‑135 (MQ=255) tgatgttATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAgcg < 2:1296141‑M2/29‑1 (MQ=255) tACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTAAATAAAGCTTATGCAAAGAAAAAGAAATCCAATCACTTGGGtttctttttc > 1:1069019/1‑135 (MQ=255) tgttattccGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTtctcattttgagaaagagtattgagcttctttcactctggagagttgtccgaga < 1:2884882‑M2/131‑55 (MQ=255) cTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTAAATAAAGCTTATGCAAAGAAAAAGAAATCCAATCACTTGGGtttctttttctt < 1:17872/135‑1 (MQ=255) gttattcCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTaaaagtagatttaagaaatatcattctgtagacaaaagtatcagtttcctcttta > 2:615853‑M2/4‑80 (MQ=255) gttattcCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTaaaagtagatgtaagaaatatcatactgtagacaaaagtatcagtttcctcttta > 2:2627550‑M2/4‑80 (MQ=255) gttattcCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTaaaagtagatgtaagaaatatcatactgtagacaaaagtatcagtttcctcttta > 2:1770735‑M2/4‑80 (MQ=255) gttattcCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTaaaagtagatgtaagaaatatcatactgtagacaaaagtatcagtttcctcttta > 2:127117‑M2/4‑80 (MQ=255) gttattcCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTaaaagtagatgtaagaaatatcatactgtagacaaaagtatcagtttcctcttta > 1:349665‑M2/4‑80 (MQ=255) gttattcCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTaaaagtagatgtaagaaatatcatactgtagacaaaagtatcagtttcctcttta > 1:2658640‑M2/4‑80 (MQ=255) gttattcCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTaaaagtagatgtaagaaatatcatactgtagacaaaagtatcagtttcctcttta > 1:2444040‑M2/4‑80 (MQ=255) gttattcCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTaaaagtagatgtaagaaatatcatactgtagacaaaagtatcagtttcctcttta > 1:1682415‑M2/4‑80 (MQ=255) gttattcCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTaaaagtagatgtaagaaatatcatactgtagacaaaagtatcagtttcctcttta > 1:1042873‑M2/4‑80 (MQ=255) ttattCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTaaaagtagatgtaagaaatatcatactgtagacaaaagtatcagtttcctctttac > 2:2825639‑M2/3‑79 (MQ=255) ttattCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTaaaagtagatgtaagaaatatcatactgtagacaaaagtatcagtttcctctttac < 1:133987‑M2/133‑57 (MQ=255) gATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACt > 1:1257750/1‑70 (MQ=255) | TCTAATAGGAAAACAGATTTTAGAAAAAATAAAAATAACAAAAAATGCGAACGGTTTCTTTGATAATATAATAAAAAAATTCAAAAAAAGTATTGCGTTATTTAGAAGAAATTGATATTATATTCATGTACTTGATTCCGGCATAGCTCAGTTGGTAGTAGCGCATGACTGTTAATCATGATGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGCCGGAGTAAATAAAGCTTATGCAAAGAAAAAGAAATCCAATCACTTGGGTTTCTTTTTCTTTTA > AssemblyC74_contig_8/1511‑1778 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |