| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AssemblyC74_contig_32 | = 3311 | 0 (0.000) | 301 (0.760) | 84/256 | 0.2 | 100% | intergenic (+202/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
| ? | AssemblyC74_contig_53 | = 622 | 0 (0.000) | coding (1/498 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | Mobile element protein | |||||
Only 100 of 571 total aligned reads displayed.
CTTTTGCCACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_53/489‑622 | cTTTTGCCACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGa > 2:2420829/1‑134 (MQ=255)cTTTTGCCACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGa > 2:553784/1‑134 (MQ=255) ttGCCACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgac < 1:1047179‑M2/134‑4 (MQ=255) ccACCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactact < 1:1537022‑M2/135‑8 (MQ=255) aCCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttt < 1:2376559‑M2/135‑10 (MQ=255) aCCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttt < 1:1920765‑M2/135‑10 (MQ=255) aCCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttt < 1:502096‑M2/135‑10 (MQ=255) aCCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttt < 2:1558577‑M2/135‑10 (MQ=255) aCCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttt < 1:1727448‑M2/135‑10 (MQ=255) aCCTCCAACCAAGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAAAGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttt < 1:1428460‑M2/135‑10 (MQ=255) caaccaaGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttct < 2:2107857‑M2/135‑15 (MQ=255) caaccaaGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATAGTTATGTGCAAGTTATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttct < 2:1828503‑M2/135‑15 (MQ=255) aaccaaGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttctt > 2:1032647‑M2/1‑120 (MQ=255) aaccaaGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttctt > 2:1537022‑M2/1‑120 (MQ=255) ccaaGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaa > 1:2238225‑M2/1‑118 (MQ=255) aGCCTTCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaa > 1:1318760‑M2/1‑115 (MQ=255) 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ttCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaa > 1:1768841‑M2/1‑111 (MQ=255) ttCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaa < 2:1768841‑M2/131‑21 (MQ=255) ttCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaaaacaaa < 2:2183713‑M2/135‑25 (MQ=255) tCCCAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaaaacaaat < 2:2272768‑M2/135‑26 (MQ=255) cAACCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaaaacaaatgta < 2:606129‑M2/135‑29 (MQ=255) aaCCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaacaaatgtat < 2:309582‑M2/135‑30 (MQ=255) aaCCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaacaaatgtat < 1:2151826‑M2/135‑30 (MQ=255) aaCCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaaaacaaatgtat < 1:689258‑M2/135‑30 (MQ=255) aaCCATGATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaaaacaaatgtat < 1:1006316‑M2/135‑30 (MQ=255) gATAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaaaacaaatgtatatttc < 1:366358‑M2/134‑35 (MQ=255) aTAGTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaaaacaaatgtatatttccg > 1:1449914‑M2/1‑99 (MQ=255) gTTATAAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaacaaatgtatatttccgcaa < 1:2712715‑M2/135‑40 (MQ=255) taAATCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaacaaatgtatatttccgcaaaaaa < 2:2325087‑M2/135‑44 (MQ=255) aaTCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaacaaatgtatatttccgcaaaaaaag < 1:1380851‑M2/135‑46 (MQ=255) aaTCCTTACCCAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaaaacaaatgtatatttccgcaaaaaaag < 1:1257261‑M2/135‑46 (MQ=255) ccAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaa < 1:1850077‑M2/101‑21 (MQ=255) ccAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAaactacttttttcttaaaaacaaatgtatatttccgcaaaaaaagcaccccttt < 2:425871‑M2/135‑55 (MQ=255) cAATGTCTAACCAGTGTACGATTTATTTGATATTTATGTGCAAGATATTTGTAGCCGCCTTCGTTATTTAAATAGTCTGAgactacttttttcttaaaaacaaatgtatatttccgcaaaaaaagcacccctttt < 1:1692167‑M2/135‑56 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |