| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_47 | 452 = | NA (NA) | 156 (0.640) +TACACTCGTTAAAGAGCCACAGCCATAAAACATA |
44/188 | 0.8 | NA | noncoding (7/29 nt) | direct | CRISPR repeat with sequence actatcgatgtaagtaattgggatacgtc |
| ? | AssemblyC74_contig_47 | = 882 | NA (NA) | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
TAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_47/753‑882 | tAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgt > 2:1593459‑M2/1‑130 (MQ=255) aCGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttt > 1:544790‑M2/1‑128 (MQ=255) gtAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttat < 1:1771690‑M2/132‑11 (MQ=255) tAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggct > 1:1794766‑M2/1‑121 (MQ=255) tAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatgg > 1:2261195‑M2/1‑121 (MQ=255) tAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttat < 1:2511136‑M2/131‑11 (MQ=255) tAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGGAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttat < 1:2886397‑M2/131‑11 (MQ=255) aGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTCCTTATATGACTGAtatgttttatggctg < 2:2155488‑M2/135‑16 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggct < 2:836998‑M2/133‑15 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggct > 1:836998‑M2/1‑119 (MQ=255) gATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTAGAGATGTAAGTAATTGGGATACGACTAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgt < 1:144331‑M2/135‑17 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgt < 1:722894‑M2/134‑17 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtattttttatggctgtggctcttt < 2:6904‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:1710377‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:800038‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:209929‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:2652629‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:1971456‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:1736928‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:2453737‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:2601687‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:2567086‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTAGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:425895‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAAGTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGAATGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:2793192‑M2/134‑25 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGGTTGAAGGGGTTAAATCTAACACTATAGATGTAAGTAATTTGGATACTTCGAAGTTTACTAATATGACTGAtatgttttatggctgaggctcatt < 2:498742‑M2/134‑25 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:2524667‑M2/1‑109 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:557716‑M2/1‑109 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 1:1838232‑M2/1‑109 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGATAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:2045580‑M2/1‑109 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGGTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:2279515‑M2/1‑109 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaac < 1:1562246‑M2/135‑28 (MQ=255) gggATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacga > 1:1964762‑M2/1‑106 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgag < 1:1163951‑M2/135‑31 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgag < 1:2497740‑M2/135‑31 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 2:587685‑M2/1‑105 (MQ=255) ggATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 1:587685‑M2/129‑25 (MQ=255) gTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATAAGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaga > 1:1878989‑M2/1‑99 (MQ=255) gAAGGTTTCTTCTCTGACTGCTATGTTTGCTGGGGGTAACTCTAACACTCTCGTTGTTAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatg > 2:663599‑M2/1‑96 (MQ=255) gAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatg > 2:1550371‑M2/1‑96 (MQ=255) ttCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattg > 1:1313913‑M2/1‑87 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgg < 1:1029762‑M2/135‑50 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgg < 1:2372746‑M2/135‑50 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgg < 1:1602365‑M2/135‑50 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt > 1:44018‑M2/1‑86 (MQ=255) tCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctcttt < 2:44018‑M2/110‑25 (MQ=255) aTGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaat < 2:902105‑M2/135‑62 (MQ=255) gTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgt < 1:2830531‑M2/135‑64 (MQ=255) tttGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagacgtaagtaattgggatacgtcaaatgtt > 2:2249111‑M2/1‑71 (MQ=255) gCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacg > 2:1467006‑M2/1‑68 (MQ=255) ggggTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaa > 1:2917932‑M2/1‑65 (MQ=255) tAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgac < 1:308237‑M2/135‑76 (MQ=255) aaaTCTCACACTCTCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtaggttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgact > 1:1195665‑M2/1‑59 (MQ=255) aaaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgact > 2:273295‑M2/1‑59 (MQ=255) aaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgactt > 2:2644256‑M2/1‑58 (MQ=255) aaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgactt > 1:2201159‑M2/1‑58 (MQ=255) aaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgactt > 2:937669‑M2/1‑58 (MQ=255) aaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgactt > 2:105448‑M2/1‑58 (MQ=255) aaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgactt > 1:51813‑M2/1‑58 (MQ=255) aaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgactt > 1:880144‑M2/1‑58 (MQ=255) aaTCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgac < 2:1858730‑M2/133‑76 (MQ=255) acacTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTTTATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgt > 2:2918408‑M2/1‑52 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgtttt < 2:313131‑M2/135‑87 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgtttt < 1:168243‑M2/135‑87 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgtttt < 1:607315‑M2/135‑87 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgtttt < 2:370125‑M2/135‑87 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgtttt < 2:287794‑M2/135‑87 (MQ=255) cTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttt < 1:493264‑M2/134‑86 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggct > 1:1665138‑M2/1‑43 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggct > 1:494885‑M2/1‑43 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggct > 2:1698567‑M2/1‑43 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctaggttttat < 2:1168177‑M2/131‑89 (MQ=255) aTGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgactactatgttttatggat < 2:2014822‑M2/135‑93 (MQ=255) tGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctg < 2:494513‑M2/135‑94 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtgtctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgaatactatgttaaatggatgtgtctct < 1:50012‑M2/135‑101 (MQ=255) aaTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctct < 1:631455‑M2/135‑101 (MQ=255) cttgGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctct > 1:993871‑M2/2‑34 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctct > 1:2849844‑M2/1‑34 (MQ=255) aTTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctc > 2:2652629‑M2/1‑34 (MQ=255) ttGGGATCCGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 2:345037‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAATGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 2:62247‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaggtgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:1450434‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:2726300‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 2:75340‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:371910‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:313131‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 2:308238‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 2:281484‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:800038‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:2638050‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:2121026‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 1:902105‑M2/1‑33 (MQ=255) ttGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 2:1649098‑M2/1‑33 (MQ=255) gtgGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTTAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctcttt > 2:2463842‑M2/2‑33 (MQ=255) gATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacg < 2:1411860‑M2/135‑107 (MQ=255) tACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacga > 1:2215364‑M2/1‑27 (MQ=255) cGTCGAAGGTTACTTATAAGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaatttggatactacaaatgatacgaatatgcctactatgttatatggatgtgtctctttaaagagtg < 1:785534‑M2/135‑111 (MQ=255) tCGAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgta > 2:1146287‑M2/1‑23 (MQ=255) gAAGGTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtaga > 2:1771690‑M2/1‑21 (MQ=255) gTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgta < 2:237764‑M2/135‑119 (MQ=255) gTTACTTATATGACTGAtatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgtaagtaattgggatacgtcaaatgttacgaatatgacttctatgttttatggctgtggctctttaacgagtgtagatgta < 2:1244294‑M2/135‑119 (MQ=255) | TAACGAGTGTAGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTCTATGACTGCTATGTTTGCAGGGGTTAAATCTAACACTATCGATGTAAGTAATTGGGATACGTCGAAGGTTACTTATATGACTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_47/753‑882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |