| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_52 | 1 = | 0 (0.000) | 241 (0.470) | 78/256 | 0.8 | 100% | intergenic (–/‑1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Putative transposase InsK for insertion sequence element IS150 |
| ? | AssemblyC74_contig_53 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+2) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Mobile element protein | |||||
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTCAATTTAAA > AssemblyC74_contig_53/1‑134 | agatttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCt < 2:2522315‑M2/2‑1 (MQ=255) gatttatttcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctccgataaccataagagtttCtt < 1:1297261‑M2/3‑1 (MQ=255) gatttatatcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCtt < 1:1895274‑M2/3‑1 (MQ=255) tcgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCttt > 1:216836‑M2/125‑135 (MQ=255) cgctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGACTCtttt < 2:2072669‑M2/12‑1 (MQ=255) ctttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTAc < 2:2862956‑M2/14‑1 (MQ=255) ttattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACaa < 1:1154782‑M2/16‑1 (MQ=255) tattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACa > 2:337870‑M2/119‑133 (MQ=255) tattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAAt > 1:1501641‑M2/119‑135 (MQ=255) tattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAAt > 1:2642756‑M2/119‑135 (MQ=255) tattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAAt > 1:2672026‑M2/119‑135 (MQ=255) tattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAAt > 2:1595625‑M2/119‑135 (MQ=255) tattcggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAAt > 2:622474‑M2/119‑135 (MQ=255) tattcggatttgacaggtaagtaccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaattgactctacgataaccataagagtatCTTGATTCTTTTACAAt > 2:1453246‑M2/119‑135 (MQ=255) ggatttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgagtgattgtatatcctttcatctttaacgataaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTg > 2:167754‑M2/114‑135 (MQ=255) ttgacaggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAAt < 1:815016‑M2/26‑1 (MQ=255) ggtaagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCt > 1:1802602‑M2/104‑133 (MQ=255) aagtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCtt < 1:1595625‑M2/31‑1 (MQ=255) agtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCtt < 2:1369452‑M2/35‑1 (MQ=255) gtcccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCttt > 1:1322452‑M2/99‑134 (MQ=255) ccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATc < 2:2627334‑M2/39‑1 (MQ=255) ccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATc < 1:880888‑M2/39‑1 (MQ=255) ccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATc < 1:1665972‑M2/39‑1 (MQ=255) ccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATc < 1:2801301‑M2/39‑1 (MQ=255) ccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATc < 1:2740063‑M2/39‑1 (MQ=255) ccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATc < 1:2519097‑M2/39‑1 (MQ=255) ccatttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaactgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATc < 2:924634‑M2/39‑1 (MQ=255) catttgggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCt > 1:1791559‑M2/95‑134 (MQ=255) gggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCtat > 2:358873‑M2/90‑135 (MQ=255) gggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCtat > 2:328902‑M2/90‑135 (MQ=255) gggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCtat > 1:1983022‑M2/90‑135 (MQ=255) gggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCtat > 2:767198‑M2/90‑135 (MQ=255) gggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCtat > 2:2262523‑M2/90‑135 (MQ=255) gggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCtat > 2:543191‑M2/90‑135 (MQ=255) gggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCtat > 2:1404799‑M2/90‑135 (MQ=255) gggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCtat > 1:1990962‑M2/90‑135 (MQ=255) gggacattaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCtat > 1:582029‑M2/90‑135 (MQ=255) attaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATAttt > 1:91383‑M2/85‑134 (MQ=255) attaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATAttt > 2:1235893‑M2/85‑134 (MQ=255) attaattttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATAttt > 1:2209950‑M2/85‑134 (MQ=255) attttctaactgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCt > 1:2801945‑M2/81‑134 (MQ=255) ctgttttatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAAt < 1:1962646‑M2/26‑1 (MQ=255) tatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAAttttt < 1:2903953‑M2/70‑1 (MQ=255) tatgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAAttttt < 1:1471111‑M2/70‑1 (MQ=255) tgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctactataaccataagagtttCTTGATTCTTTTAAAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAAttttttt < 2:2738638‑M2/72‑1 (MQ=255) tgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAAttttttt < 1:1644872‑M2/72‑1 (MQ=255) tgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAAttttttt < 2:2642756‑M2/72‑1 (MQ=255) tgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAAttttttt < 1:1563010‑M2/72‑1 (MQ=255) tgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAAttttttt < 1:430218‑M2/72‑1 (MQ=255) tgattgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAAttttttt < 1:1429472‑M2/72‑1 (MQ=255) tgattgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTAcc < 1:328902‑M2/75‑1 (MQ=255) tgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataatagttaCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACACAGta > 1:658474‑M2/56‑135 (MQ=255) tgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAAttttttt < 2:819287‑M2/72‑1 (MQ=255) tgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGta > 2:2130287‑M2/56‑135 (MQ=255) tgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGta > 2:86608‑M2/56‑135 (MQ=255) tgtatatcctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTAGCTAATTTTTTTACCCAGta > 2:1077397‑M2/56‑135 (MQ=255) cctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATc < 1:2022046‑M2/39‑1 (MQ=255) cctttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATc > 2:2022046‑M2/49‑87 (MQ=255) ttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGtt < 2:2801829‑M2/90‑1 (MQ=255) ttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGtt < 1:2129362‑M2/90‑1 (MQ=255) ttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGtt < 2:1892898‑M2/90‑1 (MQ=255) ttcatctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGtt > 2:1275636‑M2/46‑135 (MQ=255) catctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGtt > 1:1259379‑M2/44‑133 (MQ=255) catctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAAACGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGtt > 2:1743107‑M2/44‑133 (MQ=255) atctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACa > 2:1795072‑M2/43‑57 (MQ=255) atctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAAttttt < 2:430252‑M2/70‑1 (MQ=255) atctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGAc > 2:2573340‑M2/43‑135 (MQ=255) atctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGAc < 2:2921996‑M2/93‑1 (MQ=255) atctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGAc > 1:1089379‑M2/43‑135 (MQ=255) tctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAAttttttt < 2:2424768‑M2/72‑1 (MQ=255) tctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAAttttttt > 1:2424768‑M2/42‑113 (MQ=255) tctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGAc > 2:665176‑M2/42‑134 (MQ=255) ctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATAtt > 2:1539558‑M2/41‑89 (MQ=255) ctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACtt > 2:1494440‑M2/41‑135 (MQ=255) ctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACtt > 1:1726510‑M2/41‑135 (MQ=255) ctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACtt > 1:2080550‑M2/41‑135 (MQ=255) ctttaacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTAACCAGTAATAATAAGTTGACtt > 2:2576170‑M2/41‑135 (MQ=255) taacgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGc < 1:1329910‑M2/98‑1 (MQ=255) cgctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCt < 2:571718‑M2/34‑1 (MQ=255) ctaaagtgactctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAAtt < 2:2390160‑M2/103‑1 (MQ=255) actctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAAt < 2:41618‑M2/110‑1 (MQ=255) actctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAAt < 1:2006890‑M2/110‑1 (MQ=255) tctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTg < 1:2336294‑M2/112‑1 (MQ=255) ctacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGaa > 2:1301403‑M2/22‑135 (MQ=255) tacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTCATTTTTTTACCCAGTAATACTAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGaaa > 2:1022269‑M2/21‑135 (MQ=255) tacgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGaaa > 2:1986626‑M2/21‑135 (MQ=255) acgataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAg > 2:2556053‑M2/20‑135 (MQ=255) ataaccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTaa > 1:2894668‑M2/17‑135 (MQ=255) ccataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGa < 2:2209950‑M2/123‑1 (MQ=255) cataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGa > 2:176412‑M2/12‑134 (MQ=255) ataagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGAtt > 1:22387‑M2/11‑135 (MQ=255) taagagtttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTc > 2:2326464‑M2/10‑135 (MQ=255) attccatttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTc > 2:341866‑M2/10‑135 (MQ=255) atttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTCAAttt > 2:223031‑M2/5‑135 (MQ=255) tttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTCAATTTa > 1:1714911‑M2/4‑135 (MQ=255) ttCTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTCAATTTaa < 1:622450‑M2/133‑1 (MQ=255) cTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCa > 1:1508661/1‑77 (MQ=255) cTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCa < 2:1508661/77‑1 (MQ=255) cTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTTCAATTGAAAGTAATAGATTCAATTTaaa > 2:1138359/1‑134 (MQ=255) cTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTCAATTTaaa > 1:2613936/1‑134 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGATTCTTTTACAATCGCTGTAATTTCTTGCTTTATCTTGCTATATTTATCTGGCTTATCTAATTTTTTTACCCAGTAATAATAAGTTGACTTCGCTAATTGTGCAATTGAAAGTAATAGATTCAATTTAAA > AssemblyC74_contig_53/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |