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cGCAGggcatgtcgagattacacgagcagttgttccaattaatgcaaagtaactggttgggttaaacctgaattgacgaagatgtaaatatttgatctcttcgtcaattcatattaatactggacatt > 2:2771069‑M2/1‑5 (MQ=255) agagcatgccgagattacacgagcagctgttccaattaacgcaaagtaactgttttggatataccttattaacatgaattagcggcatattaagtatgtcgctaatttctatattcaaaattagtagcaactata < 1:1260136‑M2/135‑134 (MQ=255) aGggcatgtcgagattacacgagcagttgttccaattaatgcaaagtaactggttgggttaaacctgaattgacgaagatgtaaatatttgatctcttcgtcaattcatattaatactggacatttggttagtc < 1:2455929‑M2/134‑133 (MQ=255) aGggcatgtcgagattacacgagcagttgttccaattaatgcaaagtaactggttgggttaaacctgaattgacgaagatgtaaatatttgatctcttcgtcaattcatattaatactggacatttggttagtc < 1:716972‑M2/134‑133 (MQ=255) aGggcatgtcgagattacacgagcagttgttccaattaatgcaaagtaactggttgggttaaacctgaattgacgaagatgtaaatatttgatctcttcgtcaattcatattaatactggacatttggttagtc < 1:1209196‑M2/134‑133 (MQ=255) aGggcatgtcgagattacacgagcagttgttccaattaatgcaaagtaactggttgggttaaacctgaattgacgaagatgtaaatatttgatctcttcgtcaattcatattaatactggacatttggttagtc < 1:1138916‑M2/134‑133 (MQ=255) | TGATTGGAGTAGAAATCAATGGCCAAGTACAAGCCATCGTTCCTAGTGAGGATCTGAAAAACGGTACGTTCCAATATTATGTGGGAAGTGGGTTAAAATTGACAGATAAAGTCGAAATAGTATTGTATACCGCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_64/218‑352 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |