| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_16 | = 21988 | 318 (1.000) | 281 (0.860) | 52/242 | 2.9 | 47.6% | coding (146/387 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_2 | = 131967 | 309 (0.900) | intergenic (‑305/+164) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Uncharacterized membrane protein YwzB/ATP synthase epsilon chain (EC 3.6.3.14) | |||||
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
TGAGCACCGTTTAAAGAAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_16/21852‑21988‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatCAGAGGTTGTAAAATCAGCGTTTTGTCCTGAGTATTAGAGAAACAAATGG‑AAAATAGTTCCTCATATTTTGCCGTTTTTTGAGCTAATACCGAGGGTCAGATGATTGAACACCGTTTATTTGGAATAAGGGAC < AssemblyC74_contig_2/131967‑131835 AGCACCGTTTAAAGAAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTA > 1:332280/1‑134 AGCACCGTTTAAAGAAGAGGTTGTGAAAAAGCCGCTTAGTTTCGAGTATTAAGAAAAATTTTGTGAAAATGGCTTTCCACATTTTTGCATAAATTTGGCTTAATACCGAGAAACTGGCTTTTGAACACCGTTTA > 1:2353060/1‑134 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |