| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_2 | 1 = | 0 (0.000) | 217 (0.660) +A |
56/246 | 1.4 | 76.8% | intergenic (–/+1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_34 | 2046 = | 132 (0.420) | intergenic (‑223/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | PaaD‑like protein (DUF59) involved in Fe‑S cluster assembly/– | |||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
TTCAATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_2/133‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_34/2046‑2107 | TTCAATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATAT < 1:6589/135‑1TTCAATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATAT < 2:2180247/135‑1TTCAATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATAT < 2:1847400/135‑1TTCAATATGCGTGATTTCCATAATAAGAAAGTATACGTCATGATGAGTGCGAAATACGATCCAGAAGGAAATTCTAAGGGTGGAGCAAAAGATTTTCATGACATGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATAT < 2:1303662/135‑1 TCAATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATG < 2:1638036/135‑1 AATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGA > 1:2217255/1‑135 AATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGA > 1:1499955/1‑135 AATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGA > 2:1451674/1‑135 AATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGA > 1:1726211/1‑135 ATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGAT < 1:366419/135‑1 ATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGAT > 1:526992/1‑135 ATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGAT > 2:1253339/1‑135 ATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGAT < 2:406704/135‑1 TATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATA < 2:2019908/135‑1 TATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATA < 2:3200625/135‑1 TATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATA < 2:3675104/135‑1 TATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATA < 1:2443939/135‑1 TATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATA < 2:1011951/135‑1 TATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATA < 1:850071/135‑1 GCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGC > 1:1552322/1‑135 TGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTAC > 1:252330/1‑135 CCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATG > 2:2254961/1‑118 CTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACT < 2:185925/135‑1 ATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGA < 1:1288519/135‑1 ATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGAACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGTTATTTAAATATTCCACAACGATATTGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:2230429/135‑1 TACTTCATGATGCGTTCGTCAAACGATCCATAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:863222/134‑1 TACTTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGTTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCTTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:3085857/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:3029183/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:169329/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:1726211/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:1922725/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:1556077/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:2217255/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:2248861/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:1108490/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:252330/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:812204/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:418326/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:3896787/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:313602/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:3011324/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:3886456/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:3507246/134‑1 TACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAAT < 2:2308530/133‑1 GTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGG > 2:614768/1‑135 TCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 1:380227/135‑1 TCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 1:2087436/135‑1 TCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT > 2:1408145/1‑135 TCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 1:3349021/135‑1 TCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 2:2451830/135‑1 TCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT > 1:863222/1‑135 TCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT < 2:2919193/135‑1 GATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAATCGTTGTTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGT > 1:2104385/1‑135 ATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:2786397/125‑1 TGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA > 1:1475057/1‑134 TGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA > 2:3108054/1‑134 GCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA > 2:2637574/1‑133 GCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA > 2:568659/1‑133 GCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA > 2:297665/1‑133 GCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA > 1:167016/1‑133 GCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA > 1:1954361/1‑133 GCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA > 2:1184093/1‑133 GCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA > 1:2546082/1‑133 GCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:673407/123‑1 GCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGATACAATAAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA > 1:1025651/1‑133 TGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTA < 1:1561685/135‑1 TGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTA < 2:1331281/135‑1 TGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACT < 1:729675/134‑1 CGACAAACGATCCAGACGGAAATAATAAGGGTGGAGCAAAAGATTTTCATGACTAGCGTTGGTATTGAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTCACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGA < 2:2104385/135‑1 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ACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGG < 2:3637121/70‑1 ACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGG > 1:3637121/1‑70 CACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGT > 1:1405064/1‑87 CACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 1:1382000/82‑1 CACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT > 2:1382000/1‑82 CACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGA > 1:2781442/1‑72 ATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT > 1:2847219/1‑76 ATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATT < 2:2847219/76‑1 TTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGATAT > 2:3764909/1‑42 ATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA < 1:3780347/59‑1 ATATTCCACAACGATATGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTA > 2:3780347/1‑59 | TTCAATATGCGTGATTTCCCTAATAAGAAAGTATACGTCATGATGCGTGCGACAAACGATCCAGAAGGAAATACTAAGGGTGGAGCACAAGATTTTCATGACAAGCGTTGGTATTTAAATATTCCACAACGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_2/133‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATAGGCTACAATTAACTAGACAGAAAAATTAAGGTGTGTAGACTAGAAGAAAACATACC‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_34/2046‑2107 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |